Povinné předměty

 1. semestr

• Úvod do studia a života na VŠ
• Práce s informačními zdroji
• Biologická laboratorní technika
• Chemická laboratorní technika
• Základy fyzikálních měření
• Základy buněčné biologie
• Fyzika I - Mechanika a molekulová fyzika

 2. semestr

• Postupová zkouška z angličtiny
• Obecná a fyzikální chemie
• Obecná a fyzikální chemie - praktikum
• Fyzika II - Elektřina a magnetismus
• Fyzikální praktikum I
• Seminář Katedry fyziky

 3. semestr

• Molekulární biologie
• Biochemie
• Fyzika III - Optika
• Fyzikální praktikum II

4. semestr

• Fyzikální praktikum III
• Termodynamika a statistická fyzika

5. semestr

• Bakalářská zkouška z angličtiny

6. semestr

• Kvantová teorie I

Povinně volitelné předměty - Matematika (výběr ze dvou bloků)

1. blok

• Repetitorium matematiky
• Matematika pro fyziky I
• Matematika pro fyziky II

     2. blok

• Matematická analýza I.
• Matematická analýza II.
• Matematická analýza III.
• Lineární algebra

Povinně volitelné předměty (cca třetina z těchto kurzů, oficiálně 40 kreditů z celkem 121)

• Matematická analýza IV.
• Úvod do diferenciálních rovnic
• Numerická matematika I.
• Počítačová fyzika - částicové modelování
• Statistické vyhodnocení experimentálních dat nebo Biostatistika
• Fyzika IV - Atomová fyzika
• Teoretická mechanika
• Fyzikální praktikum IV
• Praktikum z kvantové fyziky
• Výběrové praktikum z gama spektroskopie
• Fyzika plazmatu
• Fyzika pevných látek
• Programování I
• Programování II
• Zpracování dat v Matlab/Octave
• Vybrané kapitoly z biofyziky
• Praktikum z biochemie
• Instrumentální metody biochemie a biofyziky
• Chemická struktura a spektroskopie
• Biology of Microorganisms nebo Mikrobiologie
• Evoluční biologie
• Fyziologie rostlin
• Fyziologie živočichů a člověka
• Genetika

Za tříleté studium potřebujete ze zkoušek a zápočtů z kurzů získat alespoň 180 kreditů (tj. 30 kreditů za semestr). Z tohoto počtu získáte 82 kreditů za povinné předměty, 16 kreditů za bakalářskou práci a 8 kreditů za zkoušku z angličtiny. Zbytek, tj. nejméně 74 kreditů získáte z volitelných kurzů, jež si volíte sami podle zájmu a plánované specializace. Více než 40 % studia si tedy můžete zvolit sami. Je jen na vás, jestli se budete věnovat hlavně fyzice nebo si dáte raději více biologie, chemie, programování nebo si namícháte vše dohromady, protože vás prostě baví všechno. Počet kreditů se u každého kurzu liší podle náročnosti a pohybuje se mezi 2 a 8 kredity za jeden kurz.

Důležitou a nedílnou součástí studia je vypracování bakalářské práce. V ní prokážete schopnost zvládnout teorii vybrané komplexní problematiky, vlastní badatelskou práci a také přípravu kvalitního textu odborné studie. Na PřF JU a na spolupracujícím Biologickém centru AV ČR máte velký výběr témat zaměřených na základní výzkum i aplikace. Jako biofyzici si můžete vybírat práce na několika katedrách, kromě fyziky také na chemii, molekulární biologii i jinde, kde budete pracovat s moderními biofyzikálními metodami. Aktivní studenti se mohou zapojit do vědecké práce již od prvního ročníku studia. Témata biofyzikálních prací mohou být velmi různorodá, v nedávné době byly u nás dokončeny například práce věnující se depozici biokompatibilních vrstev v nízkoteplotním plazmatu, studiu vlastností biologicky významných porfyrinů s pomocí počítačových simulací, práce zkoumající vlastnosti rostlinných barviv a proteinů pokročilými metodami optické spektroskopie nebo analýza funkce bakteriálních proteinů metodou spektroskopie jednotlivých molekul.

Státní závěrečná zkouška se skládá ze tří okruhů: 1) Obecná fyzika, 2) Teoretická fyzika, 3) volba ze dvou možností a) Biologická chemie nebo b) Fyziologie rostlin a živočichů. V průběhu studia je tedy dobré se profilovat také podle uvažované třetí části státní závěrečné zkoušky a splnit včas potřebné kurzy. Pro úspěšné dokončení studia musíte kromě splnění SZZ také obhájit svou bakalářskou práci. Tím prokážete, že umíte nastudovat odbornou literaturu, umíte ji vlastními slovy vysvětlit, zvládnete kvalitně pracovat v laboratoři nebo s počítačovými simulacemi, umíte vše srozumitelně a kvalitně popsat v textu a dokážete o tématu práce diskutovat s odborníky.

Díky sdílenému základu s dalšími fyzikálními programy mají absolventi bakalářské biofyziky možnost si volit kromě magisterského studia Biofyziky i studijní programy Fyzikální měření a modelování a Učitelství pro střední školy se specializací fyzika. Někteří studenti také úspěšně kombinují biofyziku se studiem pro budoucí učitele, zejména v oborech chemie a biologie nebo s molekulární biologií (Molekulární a buněčná biologie a genetika nebo Functional genetics and bioinformatics). Nově byl otevřen navazující obor Učitelství science pro střední školy pro který jsou absolventi biofyziky díky multidisciplinaritě bakalářského programu velmi dobře připraveni.

První semestr je pojatý jako kombinace přednášek, cvičení a seminářů. Jeho struktura je narozdíl od ostatních semestrů pevně daná a pokrývá základy biologie v celé šíři. Kromě orientace v oboru má posloužit i k získání dovedností, které využijete v průběhu celého studia i po něm, jako je práce v laboratoři, základy vědecké práce, prezentační dovednosti a práce s vědeckou literaturou.

V prvním semestru Vás čekají čtyři přednáškové kurzy: Buněčná biologie a genetika, Biologie organismu, Evoluční biologie a fylogeneze a Ekologie a životní prostředí. Jednotlivá témata v rámci přednášek jsou vybrána a přednášena tak, aby na sebe navazovala napříč kurzy, takže je uslyšíte v různých kontextech. Např. o mutacích je možné hovořit na úrovni sekvence DNA, ale i jejich vlivu na mnohobuněčný organismus (rakovina), na vznik nových druhů, a tedy i na diverzitu na úrovni ekosystémů. Na každý z těchto kurzů navazuje seminář, který probíraná témata ilustruje na konkrétních, pokud možno aktuálních, společensky významných nebo kontroverzních případech a dává velký prostor pro zapojení studentů (v případě mutací to bude třeba téma rychlé evoluce virů a jejího vlivu na vývoj epidemií).

Dalším předmětem prvního semestru je Biologické a chemické laboratorní praktikum, ve kterém se naučíte základy mikroskopování a práce v laboratoři, což jsou dovednosti, které využijete v dalších semestrech v praktikách specializovaných kurzů a při vypracování bakalářské práce.

Posledním předmětem prvního semestru je seminář Jak se dělá věda I, který slouží k orientaci ve vědecké literatuře a rozvoji měkkých dovedností, jako je prezentování a psaní odborných textů. Na tento kurz pak v druhém semestru navazuje předmět Jak se dělá věda II, který je zaměřený na podstatu vědecké práce, jako je design experimentů, formulování a testování vědeckých hypotéz, etika vědy či vztah mezi vědou a společností.

Prvnímu semestru předcházejí kurzy Terénní praxe I, což je pětidenní exkurze na terénní stanici v jižních Čechách, na které si vyzkoušíte sběr a poznávání rostlin a živočichů (a která funguje jako skvělá teambuildingová akce), a Úvod do studia a života na VŠ, kde se dozvíte o tom, jak to chodí na vysoké škole.

Kromě prvního semestru obsahuje studijní plán programu Biologie dalších osm povinných předmětů, které mají poskytnout všeobecný biologický základ. Jsou to již zmíněný předmět Jak se dělá věda II, dále Biochemie, Biologie protist a hub, Biostatistika, Botanika, Ekologie, Genetika a Zoologie. Dále si vybíráte dle svého zaměření ze 41 povinně volitelných předmětů. Kromě toho si můžete zapsat libovolný kurz nejen na PřF JU, ale i na jiných fakultách JU.

Zatímco povinné předměty poskytují všeobecný biologický základ, výběrem z povinně volitelných předmětů je možné se již v rámci bakalářského studia do určité míry specializovat a směřovat k vybranému navazujícímu magisterskému studiu. Na PřF JU jsou pro absoventy Biologie nejvýznamější tyto navazující magisterské programy: Aplikovaná ekologie a ochrana přírody, Biologie ekosystémů, Botanika, Fyziologie a buněčná biologie rostlin, Klinická biologie, Molekulární a buněčná biologie a genetika, Parazitologie a Zoologie. Pro zájemce o učitelství máme nový unikátní navazující magisterský program Science. Pokud chcete dál studovat v angličtině, nabízíme magisterské programy Ecology a Functional genetics and bioinformatics. Na cestě k vybranému navazujícímu magisterskému programu poslouží doporučené studijní plány, které pomohou s výběrem předmětů poskytujících dobrý základ pro studium daného magisterského programu. 

Nebiologické předměty

Fakulta nabízí řadu nebiologických předmětů, ale žádný z nich není povinný. Mezi povinnými předměty sice najdeme Biochemii a Biostatistiku, ale ty jsou koncipovány jako předměty biologické, přednášené biology, kteří vědí, co biolog potřebuje znát. Kromě toho jsou mezi povinně volitelnými předměty nabízeny také Matematika, Chemie a Vědy o Zemi (tedy geologie a geografie).

Angličtina

Protože komunikační jazykem vědy je angličtina, musíte během studia složit zkoušku z angličtiny na úrovni B2 dle SERR. K tomu Vám pomohou kurzy, které zdarma nabízí naše Oddělení jazyků.

Povinné předměty prvního semestru

• Terénní praxe I
• Úvod do studia a života na VŠ
• Buněčná biologie a genetika 
• Biologie organismu
• Evoluční biologie a fylogeneze
• Ekologie a ŽP
• Seminář z biologie organismu
• Seminář z buněčné biologie a genetiky
• Seminář z evoluční biologie a fylogeneze
• Seminář z ekologie a ŽP
• Jak se dělá věda I
• Biologické a chemické laboratorní praktikum

Povinné předměty v dalších semestrech

• Jak se dělá věda II
• Genetika
• Biostatistika
• Ekologie
• Biochemie
• Biologie protist a hub
• Botanika
• Zoologie

Povinně volitelné předměty  

• Algologie
• Anatomie a morfologie rostlin 
• Biogeografie
• Biochemické praktikum pro biologii a ŽP
• Biogeochemické cykly
• Biologie buňky
• Biologie ochrany přírody
• Biologie rostlinné buňky
• Biologie chování živočichů
• Cvičení z genetiky
• Cvičení ze zoologie bezobratlých
• Cvičení ze zoologie obratlovců
• Ekologie a biogeografie biomů
• Ekologie půdy
• Ekologie živočichů
• Evoluční biologie
• Fylogenetika
• Fyziologie rostlin
• Fyziologie živočichů a člověka
• Geobotanika
• Hydrobiologie
• Chemie pro biology
• Imunologie
• Matematika pro biology
• Mikrobiologie
• Molekulární biologie
• Mykologie
• Parazitologie
• Populační genetika a mikroevoluce
• Příprava dat pro biologické aplikace
• Příroda ČR
• Systematická botanika I
• Systematická botanika II
• Terénní praxe II (Vomáčka)
• Vědy o Zemi pro biology
• Virologie
• Vývojová biologie
• Základy bioinformatiky
• Základní metody molekulární biologie
• Základy ekologie obnovy - praktikum
• Zoologie bezobratlých
• Zoologie obratlovců

Za absolvování předmětu získáváte nějaký počet kreditů (obvykle 3-8, záleží na rozsahu a náročnosti předmětu). Celkový počet kreditů, které musíte během bakalářského studia získat, je 180. Z toho dostanete 77 kreditů za povinné předměty, ale také 16 kreditů za bakalářskou práci a 8 kreditů za zkoušku z angličtiny. Zbytek je za předměty v nějaké míře volitelné, buď úplně volně (34 kreditů z téměř neomezené nabídky), anebo v rámci povinně volitelných předmětů (45 kreditů z nabídky předmětů za více než 200 kreditů). Tím je určen stupeň volitelnosti studia – tři čtvrtiny povinně volitelných předmětů tedy můžete minout.  Je dobré se přitom řídit doporučením navazujícího magisterského programu, v němž chcete pokračovat ve studiu, a pokud ještě nejste rozhodnuti, zapisovat si ty předměty, na kterých se různé magisterské programy shodnou.

Nedílnou součástí bakalářského studia je vypracování bakalářské práce. Ta může mít podobu rešerše, tedy teoretického zpracování vybraného tématu za pomoci vědecké literatury, nebo může být praktická. V tomto případě provádíte pod vedením školitele vlastní vědeckou činnost, jejíž výsledky zpracujete do podoby bakalářské práce. Velkou výhodou PřF JU je úzká spolupráce s Biologickým centrem AV ČR, které rozšiřuje spektrum potenciálních školitelů nad rámec PřF JU, je součástí kampusu a ve kterém je řada špičkových mezinárodních vědeckých týmů, do jejichž zkoumání se můžete zapojit už od prvního ročníku studia.

SZZ se skládá z obhajoby bakalářské práce a složení zkoušek ze tří tématických okruhů. Na výběr je z těchto šesti okruhů: (1) Biologie rostlin (2) Biologie živočichů (3) Buněčná biologie a genetika (4) Ekologie (5) Fyziologie a vývojová biologie živočichů a rostlin (6) Biologická chemie. Ke každému okruhu jsou specifikovány doporučené předměty, které poskytnou informační základ, a státnicové otázky, které jsou volně k dispozici na webu PřF JU.

Bakalářský studijní program Biologie poskytuje všeobecný přehled, který absoventům umožňuje studovat navazující magisterské programy s biologickým zaměřením. Na PřF JU jsou pro absoventy Biologie relevantní tyto navazující magisterské programy: Aplikovaná ekologie a ochrana přírody, Biologie ekosystémů, Botanika, Fyziologie a buněčná biologie rostlin, Klinická biologie, Molekulární a buněčná biologie a genetika, Parazitologie a Zoologie. Pro zájemce o učitelství máme nový unikátní navazující magisterský program Science, pokud chcete studovat v angličtině, nabízíme magisterské programy Ecology a Functional genetics and bioinformatics. Na cestě k vybranému navazujícímu magisterskému programu poslouží doporučené studijní plány, které pomohou s výběrem předmětů poskytujících dobrý základ pro studium daného magisterského programu.

Povinné předměty prvního semestru

• Biologické a chemické laboratorní praktikum
• Buněčná biologie a genetika
• Ekologie a životní prostředí
• GIS I.
• Práce s informačními zdroji
• Seminář z ekologie a ŽP
• Terénní praxe I (pro 1. semestr)
• Úvod do studia a života na VŠ
• Úvod do studia EOP

Povinné předměty v dalších semestrech

• Aplikovaná ekologie I.
• Aplikovaná ekologie II.
• Bakalářská diplomová praxe I
• Bakalářská diplomová praxe II
• Bakalářská zkouška z angličtiny
• Biogeochemické cykly
• Biostatistika Environmentální politiky, teorie a praxe
• Botanika
• Ekologie
• Ekologie půdy
• Fyzika pro biology
• Hodnocení vlivů na ŽP
• Hodnocení vlivů na ŽP II
• Hydrobiologie
• Chemie pro PŽP 1
• Chemie pro PŽP II.
• Krajinná ekologie I.
• Letní praxe z aplikované ekologie I.
• Letní praxe z aplikované ekologie II.
• Matematika pro biology
• Monitorovací analytika
• Ochrana přírody
• Postupová zkouška z angličtiny
• Seminář bakalářského oboru PŽP
• Seminář z letní praxe z aplikované ekologie I.
• Seminář z letní praxe z aplikované ekologie II.
• Technologie ŽP
• Územní plánování jako nástroj ochrany přírody a krajiny
• Vědy o Zemi pro biology
• Zadání bakalářské práce
• Základy meteorologie a klimatologie
• Zoologie

Povinně volitelné předměty  

• Algologie
• Aplikovaná hydrobiologie 1
• Biologie chování živočichů
• Ekologie půdních organismů pro PŽP
• Ekologie živočichů
• Environmentální DNA
• Environmentální fyziologie živočichů
• Geologie
• Chemické a biologické polutanty ve vodě a ovzduší
• Krajinná ekologie II.
• Lesnictví
• Malá Fyziologie rostlin
• Mykologie
• Obecná limnologie
• Znečištění a degradace půdy

Celkový minimální součet kreditů za povinné a povinně volitelné předměty je 162.  Podle svého zájmu a zaměření tak ještě budete muset někde „nasbírat“ dalších minimálně 18 kreditů do povinného minima 180 kreditů za bakalářské studium. Dá se tedy říci, že budete z 10 % víceméně volní ve svém výběru.

Dá se říci, že sepsání a obhajoba bakalářské práce bude představovat vrchol vašeho studia. V oboru EOP jsou bakalářské práce výhradně projektového charakteru. Základem je dobrá literární rešerše daného tématu, následovaná návrhem projektu řešícím zpravidla nějaký environmentální problém, ale třeba i jeho výzkum. Na psaní práce nebudete sami, během studia se vám bude věnovat školitel, kterého si vyberete podle svých zájmů. Během prvních semestrů budete mít dost času na rozkoukání, abyste si pak vybrali téma práce tak, aby vás těšilo a bavilo, a zároveň odborně někam posunulo.

Příklady návrhů témat kvalifikačních prací

• Význam sídelní zeleně pro ochranu biodiverzity a metody její údržby na příkladu vybraného města
• Hodnocení zdravotního stavu lesních porostů pomocí družicových dat
• Vliv zotavování lesního ekosystému po kůrovcové disturbanci na dostupnost živin v půdě
• Vliv revitalizace horských rašelinišť na mikroklima
• Obsah a formy P v půdách povodí ledovcových jezer Vysokých Tater

Příklady obhájených prací v posledních letech

• Návrh projektu na využití Singapurského indexu městské biodiverzity pro hodnocení českých měst
• Okrajový efekt lesa a jeho ekologické funkce
• Vliv managementu lesa po kůrovcovém žíru na společenstvo ektomykorhizních hub
• Vliv extenzivní pastvy velkých kopytníků na cykly živin v půdě a jejich obsah v rostlinné biomase
• Zlepšení prostředí vodní nádrže Bagr ve veřejném lesoparku Stromovka

Podrobnější informace k sepisování bakalářských prací naleznete na stránkách Katedry biologie ekosystémů zde.

U státní zkoušky prokážete, že se orientujete v základech biologických disciplín a v oborech vaší specializace. Nejedná se ani tak o přísné zkoušení z encyklopedických znalostí, nýbrž si v přátelském duchu ještě jednou formálně ověříme, že jste si ze studia opravdu něco odnesli. Závěrečnou zkoušku složíte ze tří předmětů: povinně z Ekologie a ze Životního prostředí, dále si pak vyberete buď Biologii rostlin, nebo Biologii živočichů. Pro zachování objektivity u zkoušky si budete otázky losovat z okruhů předem známých témat.

Nedílnou součástí státní závěrečné zkoušky je i obhajoba bakalářské práce. Na tu vás připravíme na seminářích.

Podrobnější informace o okruzích státní závěrečné zkoušky naleznete na stránkách Katedry biologie ekosystémů zde.

Studenti, kteří splní předepsaná kritéria pro prostupnost do magisterského studia, mohou pokračovat v dalších navazujících magisterských studijních programech zajišťovaných naší fakultou, zejména Aplikovaná ekologie a ochrana přírody, Biologie ekosystémů, a Ecology, ale i v ostatních biologických a ekologických specializacích nabízených fakultami podobného zaměření.

Bakalářská práce je klíčovou součástí závěrečného ročníku studijního programu Aplikovaná informatika. Tato práce představuje příležitost pro studenty aplikovat teoretické znalosti a praktické dovednosti získané během studia na konkrétní problém z oblasti informatiky. Výběr tématu je široký a může zahrnovat návrh a implementaci softwarových aplikací, analýzu bezpečnostních rizik, vývoj databázových systémů nebo výzkum v oblasti umělé inteligence a vestavěných systémů. Bakalářská práce slouží nejen jako doklad odborné způsobilosti studenta, ale také jako významný přínos pro budoucí zaměstnavatele nebo pro další akademické studium.

Státní závěrečná zkouška (SZZ) je důležitým krokem k získání titulu bakaláře v oboru Aplikovaná informatika. Tato zkouška se skládá ze tří částí:

1. Obhajoba bakalářské práce: Student musí úspěšně obhájit svou bakalářskou práci před odbornou komisí, která hodnotí nejen obsahovou kvalitu práce, ale také schopnost studenta práci prezentovat a obhájit své postupy a výsledky.
2. Zkouška z informatiky: Tato část pokrývá klíčové oblasti informatiky, včetně teorie algoritmů, programování, databázových systémů, počítačových sítí a IT bezpečnosti. Student musí prokázat hluboké znalosti a schopnost aplikovat teoretické koncepty na praktické problémy.
3. Zkouška z vedlejší specializace: Kromě hlavní části z informatiky může být požadována zkouška z dalšího specializačního předmětu, který si student zvolil během studia, například matematika, fyzika nebo jiný příbuzný obor.

Úspěšné složení státní závěrečné zkoušky je podmínkou pro získání titulu bakaláře a umožňuje studentovi pokračovat v dalším studiu nebo vstoupit do profesionální praxe.

Po úspěšném ukončení bakalářského studia v oboru Aplikovaná informatika mají absolventi několik možností, jak pokračovat ve své kariéře. Mohou se rozhodnout pro navazující magisterské studium v oblastech, jako je informatika, softwarové inženýrství, kybernetická bezpečnost, nebo jiné příbuzné obory. Tím si prohloubí své odborné znalosti a zvýší šance na získání specializovaných a vysoce kvalifikovaných pozic v IT průmyslu.

Pokud se rozhodnou pro vstup do praxe, mají absolventi široké spektrum možností uplatnění v soukromém i veřejném sektoru, a to jak v České republice, tak v zahraničí. Díky kvalitnímu vzdělání a praktickým zkušenostem, které během studia získali, jsou dobře připraveni na náročné výzvy moderního IT prostředí.