Bakalářská práce je klíčovou součástí závěrečného ročníku studijního programu Aplikovaná informatika. Tato práce představuje příležitost pro studenty aplikovat teoretické znalosti a praktické dovednosti získané během studia na konkrétní problém z oblasti informatiky. Výběr tématu je široký a může zahrnovat návrh a implementaci softwarových aplikací, analýzu bezpečnostních rizik, vývoj databázových systémů nebo výzkum v oblasti umělé inteligence a vestavěných systémů. Bakalářská práce slouží nejen jako doklad odborné způsobilosti studenta, ale také jako významný přínos pro budoucí zaměstnavatele nebo pro další akademické studium.

Státní závěrečná zkouška (SZZ) je důležitým krokem k získání titulu bakaláře v oboru Aplikovaná informatika. Tato zkouška se skládá ze tří částí:

1. Obhajoba bakalářské práce: Student musí úspěšně obhájit svou bakalářskou práci před odbornou komisí, která hodnotí nejen obsahovou kvalitu práce, ale také schopnost studenta práci prezentovat a obhájit své postupy a výsledky.
2. Zkouška z informatiky: Tato část pokrývá klíčové oblasti informatiky, včetně teorie algoritmů, programování, databázových systémů, počítačových sítí a IT bezpečnosti. Student musí prokázat hluboké znalosti a schopnost aplikovat teoretické koncepty na praktické problémy.
3. Zkouška z vedlejší specializace: Kromě hlavní části z informatiky může být požadována zkouška z dalšího specializačního předmětu, který si student zvolil během studia, například matematika, fyzika nebo jiný příbuzný obor.

Úspěšné složení státní závěrečné zkoušky je podmínkou pro získání titulu bakaláře a umožňuje studentovi pokračovat v dalším studiu nebo vstoupit do profesionální praxe.

Po úspěšném ukončení bakalářského studia v oboru Aplikovaná informatika mají absolventi několik možností, jak pokračovat ve své kariéře. Mohou se rozhodnout pro navazující magisterské studium v oblastech, jako je informatika, softwarové inženýrství, kybernetická bezpečnost, nebo jiné příbuzné obory. Tím si prohloubí své odborné znalosti a zvýší šance na získání specializovaných a vysoce kvalifikovaných pozic v IT průmyslu.

Pokud se rozhodnou pro vstup do praxe, mají absolventi široké spektrum možností uplatnění v soukromém i veřejném sektoru, a to jak v České republice, tak v zahraničí. Díky kvalitnímu vzdělání a praktickým zkušenostem, které během studia získali, jsou dobře připraveni na náročné výzvy moderního IT prostředí.

Povinné předměty

• Biologie ochrany přírody
• Biotopy ČR
• Evropská fauna a její ochrana
• Hodnocení vlivů na přírodu
• Letní praxe z aplik. Ekol. III
• Magisterská diplomová praxe
• Magisterská zkouška z angličtiny
• Právo ŽP
• Seminář mag. oborů KBE
• Seminář z letní praxe aplik.ekol.III
• Správní právo
• Zadání magisterské diplomové práce

Povinně volitelné předměty - skupina 1 (teoretického a metodologického charakteru)

• Ecosystem management course
• Ekologie a biogeografie biomů
• Ekologie živočichů
• Krajinná ekologie II.
• Management a monitoring v ochraně přírody
• Ochrana světové fauny
• Plánování a hodnocení ekologických experimentů
• Úvod do funkční ekologie
• Vybraná chráněná území světa – seminář

Povinně volitelné předměty - skupina 2 (specializačního charakteru)

• Diverzita a ekologie hmyzu
• Ekologie obnovy I.
• Ekologie mokřadů
• Genetika v ochraně přírody
• GIS II
• Instrumentální metody monitorování ŽP
• Instrumentální metody monitorování ŽP – praktikum
• Květena a vegetace střední Evropy
• Lesnictví
• Obnova přírodně-kulturního dědictví krajiny
• Základy moderních regresních metod
• Populační ekologie
• Základy meteorologie a klimatologie

Během studia musíte absolvovat předměty v celkovém souhrnu nejméně 120 kreditů (ECTS). Z toho 70 kreditů představují předměty povinné včetně angličtiny, dále minimálně 20 kreditů získáte za povinně volitelné předměty skupiny 1  a minimálně 10 kreditů za povinně volitelné předměty skupiny 2. Zbývajících 20 volných kreditů můžete získat za předměty specializačního zaměření dle Vašeho výběru nad rámec povinných a povinně volitelných předmětů.

Diplomovou práci budete vypracovávat v průběhu minimálně dvou semestrů studia, za což získáte minimálně 26 kreditů. Práce je samostatnou výzkumně-aplikační prací pod vedením školitele a může tématicky navazovat i na bakalářskou práci.

Příklady obhájených prací:

• Vliv vegetace na teplotní režim městského prostředí
• Habitatové preference ptáků na mokřadech SV Čech a optimalizace managementu v připravované přírodní památce Sedmihorské slatiny
• Model přežívání smrku ztepilého v podmínkách gradace lýkožrouta smrkového
• Reprodukční biologie Achillea millefolium agg. a Achillea ptarmica v lučních a lemových společenstvech
• Vliv druhového složení a prostorové struktury urbánní zeleně na biodiverzitu

Návrh možných témat diplomových prací:

• Lokální klimatické zóny v Českých Budějovicích
• Přirozená obnova lesa po disturbanci vlivem lýkožrouta smrkového
• Liší se klíčivost vybraných druhů vstavačovitých rostlin na přirozených a obnovených loukách?
• Vliv geografického původu rostlin květnatých pásů ve městech na skladbu opylovačů
• Historické parky jako ohniska biodiversity rostlin i bezobratlých

Státní závěrečná zkouška (SZZ) sestává z obhajoby diplomové práce a ústní zkoušky ze dvou povinných a jednoho povinně volitelného tematického okruhu. Zkouška (bez obhajoby diplomové práce) obvykle trvá cca 1 hodinu.

První okruh SZZ Biologie ochrany ekosystémů klade důraz na všeobecné základní znalosti z ekologie a aplikované ekologie, biologie ekosystémů a stanovišť a biologie ochrany přírody (pokryto předměty teoretického základu KBE/542 Biologie ochrany přírody, KBE/354 Biotopy ČR, KBO/330 Ekologie a biogeografie biomů a KZO/143 Evropská fauna a její ochrana).

Druhý okruh SZZ Krajinná a aplikovaná ekologie je zaměřen přímo na environmentální vědy, právo životního prostředí a praktickou ochranu přírody a krajiny (odpovídá předmětům povinného základu KBE/120 Právo ŽP, KBE/009 Správní právo, KBE/010 Hodnocení vlivů na přírodu, KBO/122 Management a monitoring v ochraně přírody, KBE/026 Krajinná ekologie II). Oba okruhy (jak první, tak druhý) jsou povinné součásti SZZ a navazují mj. i na předpokládané získané znalosti v bakalářském programu.

Třetí povinně výběrový okruh Ochrana flóry a fauny je specializační, student si vybírá jeden předmět (Biologie rostlin / Biologie živočichů), více pak souvisí s dalšími předměty, které si studenti volí během svého magisterského studia dle svého užšího odborného zaměření (např. KBE/354 Biotopy ČR, KBE/550 Lesnictví, KBO/308 Květena a vegetace střední Evropy, KBO/334 Populační ekologie, KBO/420 Ekologie obnovy I., nebo KBE/124 Ekologie živočichů, KZO/066 Diverzita a ekologie hmyzu, KZO/146 Genetika v ochraně přírody, KZO/164 Ochrana světové fauny)

Povinné předměty prvního semestru

• Terénní praxe I
• Úvod do studia a života na VŠ
• Buněčná biologie a genetika 
• Biologie organismu
• Evoluční biologie a fylogeneze
• Ekologie a životní prostředí
• Seminář z biologie organismu
• Seminář z buněčné biologie a genetiky
• Seminář z evoluční biologie a fylogeneze
• Seminář z ekologie a ŽP
• Jak se dělá věda I
• Biologické a chemické laboratorní praktikum

Povinné předměty v dalších semestrech

• Jak se dělá věda II
• Genetika
• Biostatistika
• Ekologie
• Biochemie
• Biologie protist a hub
• Botanika
• Zoologie

Povinně volitelné předměty  

• Algologie
• Anatomie a morfologie rostlin 
• Biogeografie
• Biochemické praktikum pro biologii a ŽP
• Biogeochemické cykly
• Biologie buňky
• Biologie ochrany přírody
• Biologie rostlinné buňky
• Biologie chování živočichů
• Cvičení z genetiky
• Cvičení ze zoologie bezobratlých
• Cvičení ze zoologie obratlovců
• Ekologie a biogeografie biomů
• Ekologie půdy
• Ekologie živočichů
• Evoluční biologie
• Fylogenetika
• Fyziologie rostlin
• Fyziologie živočichů a člověka
• Geobotanika
• Hydrobiologie
• Chemie pro biology
• Imunologie
• Matematika pro biology
• Mikrobiologie
• Molekulární biologie
• Mykologie
• Parazitologie
• Populační genetika a mikroevoluce
• Příprava dat pro biologické aplikace
• Příroda ČR
• Systematická botanika I+II
• Terénní praxe II (Vomáčka)
• Vědy o Zemi pro biology
• Virologie
• Vývojová biologie
• Základy bioinformatiky
• Základní metody molekulární biologie
• Základy ekologie obnovy - praktikum
• Zoologie bezobratlých
• Zoologie obratlovců

Za absolvování předmětu získáváte nějaký počet kreditů (obvykle 3-8, záleží na rozsahu a náročnosti předmětu). Celkový počet kreditů, které musíte během bakalářského studia získat, je 180. Z toho dostanete 77 kreditů za povinné předměty, ale také 16 kreditů za bakalářskou práci a 8 kreditů za zkoušku z angličtiny. Zbytek je za předměty v nějaké míře volitelné, buď úplně volně (34 kreditů z téměř neomezené nabídky), anebo v rámci povinně volitelných předmětů (45 kreditů z nabídky předmětů za více než 200 kreditů). Tím je určen stupeň volitelnosti studia – tři čtvrtiny povinně volitelných předmětů tedy můžete minout.  Je dobré se přitom řídit doporučením navazujícího magisterského programu, v němž chcete pokračovat ve studiu, a pokud ještě nejste rozhodnuti, zapisovat si ty předměty, na kterých se různé magisterské programy shodnou.

Nedílnou součástí bakalářského studia je vypracování bakalářské práce. Ta může mít podobu rešerše, tedy teoretického zpracování vybraného tématu za pomoci vědecké literatury, nebo může být praktická. V tomto případě provádíte pod vedením školitele vlastní vědeckou činnost, jejíž výsledky zpracujete do podoby bakalářské práce. Velkou výhodou PřF JU je úzká spolupráce s Biologickým centrem AV ČR, které rozšiřuje spektrum potenciálních školitelů nad rámec PřF JU, je součástí kampusu a ve kterém je řada špičkových mezinárodních vědeckých týmů, do jejichž zkoumání se můžete zapojit už od prvního ročníku studia.

SZZ se skládá z obhajoby bakalářské práce a složení zkoušek ze tří tématických okruhů. Na výběr je z těchto šesti okruhů: (1) Biologie rostlin (2) Biologie živočichů (3) Buněčná biologie a genetika (4) Ekologie (5) Fyziologie a vývojová biologie živočichů a rostlin (6) Biologická chemie. Ke každému okruhu jsou specifikovány doporučené předměty, které poskytnou informační základ, a státnicové otázky, které jsou volně k dispozici na webu PřF JU.

Bakalářský studijní program Biologie poskytuje všeobecný přehled, který absoventům umožňuje studovat navazující magisterské programy s biologickým zaměřením. Na PřF JU jsou pro absoventy Biologie relevantní tyto navazující magisterské programy: Aplikovaná ekologie a ochrana přírody, Biologie ekosystémů, Botanika, Fyziologie a buněčná biologie rostlin, Klinická biologie, Molekulární a buněčná biologie a genetika, Parazitologie a Zoologie. Pro zájemce o učitelství máme nový unikátní navazující magisterský program Science, pokud chcete studovat v angličtině, nabízíme magisterské programy Ecology a Functional genetics and bioinformatics. Na cestě k vybranému navazujícímu magisterskému programu poslouží doporučené studijní plány, které pomohou s výběrem předmětů poskytujících dobrý základ pro studium daného magisterského programu.