Skip to main content

PRF

Magisterské programy

Back to Dept. of Chemistry

Magisterské programy

  • Chemie životního prostředí

    Garant: doc. RNDr. Šárka Klementová, CSc.

    Navazující magisterský program Chemie, obor Chemie životního prostředí, je koncipován tak, aby poskytl studentům s chemickým bakalářským vzděláním vyšší specializované vzdělání v oblastech chemie souvisejících s životním prostředím. Důraz je kladen nejen na získání teoretických znalostí v této rozsáhlé vědní disciplíně ale též na ovládnutí praktických experimentálních zkušeností, kčemuž má sloužit i poměrně rozsáhlá a kreditově vysoce ohodnocená diplomová práce.

  • Biochemie

    Garant: prof. RNDr. Ivana Kutá Smatanová Ph.D.

    Navazující magisterský program Chemie, obor Biochemie je připraven tak, aby poskytnul studentům bakalářských oborů s chemickým zaměřením možnost vyššího specializovaného vzdělávání v oblasti biochemie.

     

     Studijní obor je koncipován tak, aby připravil odborníky zejména pro práci v biochemických a biotechnologických laboratořích se zaměřením na výzkumnou, vývojovou, výrobní a kontrolní činnost. Studenti získají potřebné základní poznatky z pokročilých biochemických disciplín včetně praktických zkušeností s moderními instrumentálními metodami a laboratorními postupy. Absolventi získají potřebné znalosti pro samostatnou odbornou a výzkumnou práci v oblastech chemické podstaty živých soustav, strukturních a funkčních vlastností jejich složek a povahy jejich vzájemných interakcí. Samostatná pozornost bude věnovaná rovněž rozvoji komunikačních schopností a prezentace včetně potřebné jazykové přípravy. Absolventi studia budou schopni pracovat samostatně jako odborní pracovníci na dílčích výzkumných projektech, předpokládá se jejich uplatnění také ve vysoce kompetitivním prostředí mezinárodního výzkumu a vývoje, v biotechnologických výrobách, v případě zájmu mohou pokračovat v dalším studiu v rámci doktorských studijních programů.

    S ohledem k zaměření výzkumných programů a personálnímu zastoupení v unikátní badatelsko-vzdělávací základně Přírodovědecké fakulty a Biologického centra AV ČR (působí zde více než 40 vysokoškolsky vzdělaných odborníků z různých oborů chemie včetně biochemie, fyziky/biofyziky, molekulární biologie v příznivé věkové kategorii do 45 let) doplní navazující magisterský studijní obor Biochemie zcela přirozeně již existující obory na PřF JU.

  • Biologická chemie/Biological Chemistry v anglickém jazyce zajišťovaná Přírodovědeckou fakultou JU a Johannes Kepler University v rakouském Linzi

    Guarantors: prof. RNDr. František Vácha, Ph.D. (PřF JU); prof. Mario Waser (JKU)

    Cross-border program - Unviersity of South Bohemia in České Budějovice and Johannes Kepler Unviersity in Linz. Study in English only.

    The joint Master's degree program in Biological Chemistry is organized and supported by the Faculty of Engineering and Natural Sciences at the JKU Linz and the Faculty of Sciences at the University of South Bohemia in České Budějovice, Czech Republic.

    The primary goal of the study program is to provide state-of-the-art education that encompasses molecular and cellular biology, biochemistry, and biophysics. The program represents an alternative extension of modern molecular, cellular and structural biology towards biochemistry, bio-organic chemistry, and biophysics.

    The length of the study is 2.5 years (5 semesters). The first year of master's study takes place in Linz and involves the study of chemistry, structural biochemistry, and biophysical chemistry. The second year of instruction focuses on structural, molecular, and systems biology. Instruction takes place in Ceske Budejovice. During the fifth and final semester, students may choose at which university they wish to complete their studies.

    A fee for studying in the joint Master's degree program in Biological Chemistry at FSc USB in a foreign language is 0 CZK, as based on the USB - JKU agreement. Za studium v magisterském joint studijním pogramu Biological Chemistry se na PřF JU platí poplatek 0 Kč za rok, dle smlouvy USB - JKU.

    The program is conducted entirely in English. Applicants from study programs other than Bachelor Biological Chemistry and other universities must provide a sufficient TOEFL score or pass an exam (see below).

    The emphasis during the study is laid on modern forms of study focused on practical instruction with the use of modern information technology. A significant portion of the study program consists of practical training, praxis in research laboratories, and involvement in research projects.

    Successful completion of the master's degree program will open the door to continuing on to doctoral studies in biochemistry, molecular biology, biophysics, or bioorganic chemistry. Graduates of the cross-border Biological Chemistry study program will receive a professional qualification at the frontier of modern chemistry and biology. This will clear the path for a wide range of employment positions at institutions undertaking basic and applied research and development, in chemical and biological laboratories, at biotechnology firms, universities, institutes of the Academy of Sciences, and private companies. Excellent knowledge of the English language will prepare graduates of this attractive discipline for involvement in international research teams or work abroad.

     

    ENTER BOOK
    a helpful booklet on how to survive the first year in Linz, written by the first students of the study program.

     

    Admission

    Admission to the study program is based primarily on the applicant's academic credentials and his/her knowledge of biology/chemistry/biophysics and the English language. Admission is granted without regard to sex, age, religion, race, color, national origin, sexual orientation, or marital status. The master’s “Biological Chemistry” study program welcomes qualified candidates for transfer admission from accredited universities with a completed bachelor's degree in molecular and cellular biology, chemistry, biochemistry, biophysics, or related fields showing substantial knowledge of biology and chemistry comparable to graduates of our bachelor Biological Chemistry program.

    An official TOEFL level of at least B2 (SERR) will be required. The candidates without this TOEFL level will have to pass the internal English test at the Faculty of Science, University of South Bohemia (FS USB).

    A) Students who successfully graduated in the bachelor program Biological Chemistry from USB and JKU are admitted to the master's program automatically.

    B) Applicants for masters program Biological Chemistry from other programs or universities

    Applicants with sufficient background in chemistry and biology will have to pass a written exam composed of three parts:

    • Biochemistry
    • Molecular Biology
    • General, Organic, and Analytical Chemistry.

     

    Tuition fee
    According to the JKU - USB agreement, students do not pay a tuition fee.

     

    However, a tuition fee can be introduced in the near future. The tuition fee reflects extra administration and operational costs related with running the study program in a foreign language. The precise amount will be declared by the dean of the Faculty of Science at the beginning of each calendar year, in accordance with the Study and Exam Guidelines of the University of South Bohemia in České Budějovice.

    Students are supported by various stipends from USB and JKU during their studies - the Dept. of Study Affairs will provide more information. Further possibilities fo stipends for students outside Austria.

     

    Requirements for successful completion of studies
    The requirements follow the Internal guidelines of the University of South Bohemia in České Budějovice. Further requirements are specified in the Internal guidelines of the Faculty of Science of the University of South Bohemia in České Budějovice. To complete the master’s study program in Biological Chemistry, four basic requirements have to be fulfilled. The student has to pass all required exams and acquire a sufficient amount of credits (≥ 150). The student is also required to defend a master's thesis and subsequently pass a final oral exam.

     

    Bachelor and Master theses

    The requirements for theses is very different at JKU and USB, especially for the bachelor thesis. please, read the information on theses writing!

     

    Contacts

    Facebook group of Biological Chemistry students

    University of South Bohemia in České Budějovice
    Faculty of Science

    Branišovská 31
    CZ

    370 05 České Budějovice

    Czech Republic

    Johannes Kepler University Linz
    Faculty of Engineering and Natural Sciences

    Altenbergerstr. 69

    A - 4040 Linz

    Austria

    Student Services Departments:

     

    Tel.: +420 387 772 249
    e-mail: studijni (at) prf.jcu.cz

    Jindřiška Trefná jtrefna (at) prf.jcu.cz

    Tel.: +43 732 2468 1312
    e-mail: lss (at) jku.at

    Guarantors:

     

    Prof. RNDr. František Vácha, Ph.D.
    e-mail: vacha (at) jcu.cz
    Tel.: +420 389 036 201

    Dr. Ján Štěrba
    e-mail: sterbaj (at) jcu.cz
    Tel.: +420 389 036 220

    Univ.-Prof. Mario Waser
    e-mail: mario.waser (at) jku.at
    Tel.: +43 732 2468 5411

    Dr. Adriana Rathner

    e-mail: adriana.rathner (at) jku.at

     

    Univ.-Prof. Frans Mulder
    e-mail: frans.mulder (at) jku.at
    Tel.: +43 732 2468 9300

    https://uch.prf.jcu.cz www.biologicalchemistry.jku.at

     

  • Učitelství chemie pro střední školy

    Garant: doc. RNDr. Martin Kabeláč, Ph.D.

    Magisterský studijní obor Učitelství chemie pro střední školy navazuje na bakalářský obor Chemie pro vzdělávání a uzavírá přípravu učitelů pro střední školy. Studenti si vedle chemie zapisují druhý aprobační obor podle svého zaměření z bakalářského stupně studia. Absolvent je vzdělán jako učitelchemie pro střední školy s možnou druhou aprobací.

     

Číst dál …Magisterské programy

  • Přečteno: 14139

Doktorské programy

Back to Dept. of Chemistry

Doktorské programy

  • Doktor přírodních věd (RNDr.) - Biochemie

    PřF JU získala právo udělovat tzv. "malý" doktorát, t.j titul Doktor přírodních věd (rerum naturalium doctor) RNDr. v oboru Biochemie. Titul RNDr. je udělován po obhájení rigorózní práce a úspěšném absolvování státní rigorózní zkoušky. Pro bližší informace kontaktujte Prof. Ivanu Kutou Smatanovou (kuta (at) prf.jcu.cz).

  • Biochemie / Biochemistry

    Garant: prof. Mgr. Ivana Kutá Smatanová, Ph.D.

    Kontakt: tel. 387 776 234; e-mail: kuta (at) prf.jcu.cz

    Studium možné v českém i anglickém jazyce.

    Pozor! A fee for studying at FSc USB in a foreign language is 500 CZK (or equivalent in EURO), as stated in the Provision of the Dean No. 83. Za studium v cizím jazyce se na PřF JU platí poplatek 500 Kč (anebo 20 EURO) za rok, viz Opatření děkanky D83.

    Charakteristika: Studijní obor Biochemie je zaměřen na přípravu kvalifikovaných vědeckých pracovníků s nejvyšším stupněm vzdělání pro práci ve všech oborech biochemie, která v dnešní době představuje multidisciplinární obor zahrnující vědy chemické, biologické a fyzikální. V poslední době se nedílnou součástí biochemického výzkumu stává i bioinformatika. Absolventi programu - budoucí vedoucí pracovníci s vědeckými předpoklady pro práci v biochemických a biotechnologických laboratořích se zaměřením na výzkumnou, vývojovou, výrobní a kontrolní činnost - získají teoretické znalosti z oblasti funkční a strukturní biochemie a také praktické dovednosti zahrnující použití různých metodologických postupů a využití mnoha moderních instrumentálních metod při studiu struktury a funkce živých organizmů na molekulární úrovni. Skladba, rozmanitost a velké množství různých výzkumných projektů řešených na pracovištích zajišťujících výuku v programu poskytuje řadu možností pro zaměření studentů individuálním směrem podle jejich zájmů a možností. Studenti navážou na získané poznatky z biochemických disciplín a rozšíří si praktické zkušenosti o další pokročilé laboratorní postupy a moderní instrumentální metody analytické/biofyzikální chemie pro studium molekul a komplexů v biologických systémech. Získají pokročilé znalosti ze studia molekulárních mechanismů metabolických procesů probíhajících v roztocích, biologických membránách a živých organizmech s využitím různých typů biochemických analýz a použití různých biofyzikálních metod. Základní biochemické pojmy budou diskutovány v návaznosti na novinky v současném výzkumu a také budou probírány paralelní témata zahrnující strukturu a funkci významných biologických molekul a biochemické funkce společné všem oblastem života a humánní medicíny. Pozornost bude věnována také moderním technikám molekulární a buněčné biologie v rozsahu, který umožní absolventům doktorského programu samostatně pracovat s biologickým materiálem a využívat přitom odpovídajících technik analytické a preparativní biochemie a molekulární biologie.

    Požadavky na uchazeče: Ukončené magisterské nebo inženýrské vzdělání biologického, chemického nebo biochemického zaměření.

    Okruhy témat doktorských prací:

    Krystalizace a proteinová krystalografie s cílem určit struktury proteinů pomocí rentgenové difrakční analýzy. Znalost detailní struktury proteinů je zásadní pro pochopení jejich funkce. Studenti se zabývají celým procesem vedoucím k určení struktury proteinu od izolace a purifikace proteinu pomocí molekulárně biologických a biochemických metod, přes vlastní přípravu krystalů až po rentgenovou strukturní analýzu.
    Kontaktní osoba: prof. Ivana Kutá Smatanová (kuta (at) prf.jcu.cz)

    Modelování interakcí mezi biomolekulami a složitými biologickými systémy. Studenti pracují s výpočetními metodami pro modelování biologických systémů a zabývají se především analýzou dynamických změn v těchto systémech. Studenti pomocí tzv. molekulárního modelování studují vztah mezi strukturou a funkcí proteinů. Výsledky teoretických přístupů jsou následně srovnávány s experimentálními daty.
    Kontaktní osoba: dr. Michal Kutý (kuty (at) prf.jcu.cz)

    Studium mechanismu a dynamiky makrokomplexů. Studenti budou pomocí biofyzikálních a strukturních metod a jejich aplikací zkoumat mechanismus skládání a fungování velkých makromolekulárních komplexů jako jsou anténní komplexy fotosyntetických pigmentů, roli RNA v replikaci a skládání virů a v regulaci buněčných pochodů, mechanismus rekombinace v leukocytech a jak může způsobovat některé druhy leukemie, mechanismus přestavby chromatinu a fungování membránových komplexů v bakteriích.
    Kontaktní osoba: dr. Roman Tůma (rtuma (at) prf.jcu.cz)

    Hlavním cílem projektu bude objasnit souvislosti mezi experimentálními a výpočtovými studiemi hexamerní virové RNA helikasy P4 z bactreriofágu Phi8 (Phi8P4). Pro splnění tohoto cíle budou studovány struktury s vysokým rozlišením pro ATP/ADP a analogové přechodové stavy pomocí rentgenové krystalografie, hmotnostní spektrometrie spojené s metodou výměny vodíku za deuterium, jednomolekulární fluorescenční spektroskopií společně s klasickou molekulární dynamikou (MD), ab initio MD a QM/MM výpočty.
    Kontaktní osoba: dr. Zdeněk Franta (zfranta (at) prf.jcu.cz), dr. Filip Dyčka (fdycka (at) prf.jcu.cz), dr. Tomáš Fessl (fessl (at) prf.jcu.cz), dr. David Řeha (reha (at) nh.cas.cz)

    Molekulární mechanismy infekce u klíšťaty přenášených patogenů. Zkoumány jsou procesy probíhající v infikovaných buňkách savčího hostitele i klíštěcího přenašeče (vektora) klíšťaty přenášených patogenů - viru klíšťové encefalitidy a bakterií Lymské boreliozy Borrelia burgdorferi sensu lato. Využívány jsou kromě metod molekulární biologie a biochemie také hmotnostní spektrometrie, next generation seuqencing (transkriptomika, genomika, epigenetika), fluorescenční a elektronová mikroskopie. Struktury proteinů jsou zkoumány ve spolupráci s The Austro-Czech RERI-uasb NMR Center na JKU v Linzi (za JU výzkum zajišťují Mgr. Libor Hejduk a Prof. Norbert Müller).

    Kontaktní osoba:Dr. Ján Štěrba (sterbaj (at) prf.jcu.cz), Dr. Martin Selinger (selinm01 (at) prf.jcu.cz), Prof. Norbert Müller (nmuller (at) prf.jcu.cz), Dr. Ryan Rego (rrego (at) prf.jcu.cz)

    Elektronová mikroskopie (EM) a mikroskopie atomárních sil (AFM). V EM studenti využívají technicky náročné metody, které umožňují lokalizaci jednotlivých komponent v buněčné ultrastruktuře či povrchové morfologii vzorku. Zabývají se 3D rekonstrukcí studovaných objektů a součástí studia je rovněž příprava biologických preparátů pro elektronovou a korelativní mikroskopii. AFM umožňuje detailní zobrazení povrchu a elastických vlastností živých buněk, biologických membrán, proteinů a jejich komplexů, peptidů, polynukleotidových řetězců, organických polymerů a sloučenin a to jak v plynné tak kapalné fázi. Tento typ mikroskopie také slouží k měření sil působících mezi všemi výše zmíněnými objekty až na úroveň studia nekovalentních vazeb vznikajících mezi jednotlivými molekulami.
    Kontaktní osoby: ing. Jana Nebesářová (nebe (at) paru.cas.cz), ing. Zdenko Gardian (zdenogardian (at) gmail.com), dr. David Kaftan (dkaftan (at) prf.jcu.cz)

    Analýza struktury a funkce pigmentů a pigment-proteinových komplexů z fotosyntetických organismů. Účinnost fotosyntetických procesů v rostlinách, řasách i bakteriích závisí na souhře proteinů, pigmentů a enzymů. Studenti se zabývají analýzou fotosyntetického aparátu od úrovně pigmentů až po fotosyntetickou membránu. Pro pochopení funkce jednotlivých složek i celé fotosyntetické membrány jsou používány biochemické, biofyzikální a bioinformatické metody.
    Kontaktní osoba: Dr. Radek Litvín (rlitvin (at) prf.jcu.cz)

    Studium ultrarychlých dějů v molekulách a proteinech pomocí femtosekundové laserové spektroskopie. Studenti se zabývají studiem excitovaných stavů molekul, především fotosyntetických pigmentů, řeší problémy spojené s přenosem energie a/nebo náboje v syntetických i přírodních systémech, např. fotosyntetických proteinech.
    Kontaktní osoba: prof. Tomáš Polívka (tpolivka (at) jcu.cz)

    Studium spektroskopických vlastností molekul a proteinů pomocí spektroskopie jednotlivých molekul. Díky unikátní kombinaci mikroskopie a laserové spektroskopie tato metoda umožňuje zkoumat vlastnosti jednotlivých proteinových komplexů a odhalit specifické detaily, které při standardním měření zůstávají skryty díky průměrování přes velké množství molekul/proteinů.
    Kontaktní osoba: prof. František Vácha (vacha (at) jcu.cz)

    Studium role lipidového metabolismu v imunitní odpovědi u D. melanogaster a role genu Impl2  během imunitní odpovědi u D. melanogaster. Studenti pomocí molekulárně biologických a biochemických metod studují metabolismus D. melanogaster.
    Kontaktní osoba: dr. Adam Bajgar (BajgarAdam (at) seznam.cz)

Číst dál …Doktorské programy

  • Přečteno: 13539

Informace ke studiu

Back to Dept. of Chemistry

Informace ke studiu

  • Pravidla a doporučení k psaní kvalifikačních prací

    Kvalifikační práce se na PřF JU odevzdávají již jen elektronicky (opatření studijního proděkana P5).

    DŮLEŽITÉ UPOZORNĚNÍ!!! Pokud váš školitel požádá o pozdržení zveřejnění vaší práce (maximálně na tři roky) - musíte odevzdat jeden vytištěný výtisk, který bude zaslán na MŠMT.

    Pravidla a doporučení pro vypracování kvalifikačních prací na Katedře chemie Přírodovědecké fakulty Jihočeské univerzity - platné od akademického roku 2024/2025 - v současnosti platná nejnovější verze.

    Pravidla a doporučení pro vypracování kvalifikačních prací na UCH - platné do konce akademického roku 2023/2024.

    Závazná pravidla pro psaní prací na Katedře chemie platná do akad. roku 2022/2023

    Důležitá doporučení pro vypracovávání bakalářských a magisterských prací platná do akad. roku 2022/2023

    Podívejte se i na ostatní opatření děkana a proděkanů týkající se studentů

  • Zadávací protokoly bakalářských a magisterských prací

    Zadávací protokol bakalářské a magisterské (docx, pdf, dostupné v dokumentech pro studenty) práce je potřebné vyplnit a odevzdat (u bakalářských oborů doporučujeme nejpozději během 3. semestru a dle opatření D48 nejpozději na konci 4. semestru a u magisterských oborů doporučujeme během 1. semestru). Zadávací protokol by měl být připraven pro studenta školitelem. Školitele je možné předem konzultovat s vedoucím katedry (Ján Štěrba), především v případě externistů a školitelů z jiných fakult. Připravený a školitelem elektronicky podepsaný protokol student elektronicky podepíše (návod na el. podpis zde). Následně student získá elektronické podpisy příslušných osob s výjimkou vedoucího katedry a přepošle na sekretariát katedry chemie (K. Žižková - Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript. ). Postup na vytvoření jednoduchého el. podpisu:

     

     

    Připravili  jsme pro vás pomůcku k vyplnění zadávacího protokolu:

     

     

  • Nabídka témat

    Read more

  • E-mailová schránka končících studentů/E-mail account of finishing students

    Read more

  • FAQs for Biological Chemistry study programmes

    Read more

  • Upozornění pro studenty a jejich školitele oheldně zadávání témat kvalifikačních prací u studentů z krajin pod sankcemi EU

    Read more

  • Proplacení finančních nákladů ke studiu

    Pokud u povinného či povinně volitelného předmětu (pod katedrou chemie) výuka probíhá mimo České Budějovice, student si může zažádat o proplacení nákladů. Doklady spojené s výukou prosím zašlete na sekretariát katedry chemie (K. Žižková - Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript. ).

  • informace o průběhu obhajob kvalifikačních prací

    Read more

Číst dál …Informace ke studiu

  • Přečteno: 14209

Info for supervisors

Back to Dept. of Chemistry

Information for supervisors of Dept. of Chemistry students

Thank you for supervising our students and we hope students will learn a lot in your laboratory and you will get a helpful colleague.

There are just a few points to remind you:

- all theses at our department must be practical (bioinformatics is also considered practical, of course)

- once you agree with a student on the topic, fill in please the assignment form - see info in the section for students

you will be asked every semester to confirm, if you are satisfied with the work of your student. If you ar enot (and thus, the student will not get the credits for the bachelor/master thesis), explain please to the students, what is the problem and what should be changed to improve their work

- we have some expectations, how the bachelor/master thesis should look like. Please, check the Requirements_and_recommendations_for writing bachelor and master theses at the Department of Chemistry valid from the academic year 2024/2025 - currently valid newest version.

- if your student is the citizen of one of the EU sanctioned countries, please check info on the regulations and limitations

- only an employee of the FSci USB; otherwise, also a faculty guarantor is needed, somebody who understands the topic and IS RESPONSIBLE for the quality of the thesis (not a formal position anymore)

- supervisor is also responsible for the quality of the work, quality of the thesis; not only the student

- If the work is to include information classified according to a special regulation or on the basis of a contract with a partner of USB, the student, in cooperation with the supervisor, is to request the Dean's consent to use this information on the form in Annex 2 of this Provision.  Check the provision D48, please.

 

 

 

 

Číst dál …Info for supervisors

  • Přečteno: 7942

Selected publications at the Dept. of Chemistry

Back to Dept. of Chemistry

Selected publications at the Department of Chemistry

  • 2022 Tick-borne encephalitis virus capsid protein induces translational shut-off as revealed by its structural-biological analysis

    manuscript accepted into a prestigious Journal of Biological Chemistry

    https://doi.org/10.1016/j.jbc.2022.102585

  • 2022 Content of trans-resveratrol, trans-ε-viniferin and trans-δ-viniferin in young spring grapevine canes – the influence of samples drying

    A paper by our department co-authored by our former student Lukas Toupal.

Číst dál …Selected publications at the Dept. of Chemistry

  • Přečteno: 9285

Přihlaste si
odběr newsletteru

Zůstaňme v kontaktu na
sociálních sítích

Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Branišovská 1645/31a, 370 05 České BudějoviceTel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

© 2024 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Cookies

1

0