Skip to main content

PRF

Molekulární a buněčná biologie

Molekulární a buněčná biologie

Koordinátor:
doc. Hassan Hashimi, Ph.D. (PARÚ BC AV ČR)
Vědecké skupiny a školitelé:

Laboratoř molekulární integrativní fyziologie drozofily - doc. Mgr. Tomáš Doležal, Ph.D. 

Dmel macrophages squad - Mgr. Adam Bajgar, Ph.D. 

Laboratoř vývojové biologie - RNDr. Alena Krejčí, Ph.D.

Laboratoř molekulární biologie prvoků - prof. RNDr. Julius Lukeš, CSc
                                                                   - doc. Hassan Hashimi, Ph.D

Laboratoř funkční biologie protist - RNDr. Alena Panicucci Zíková, Ph.D

Laboratoř RNA biologie prvoků - RNDr. Zdeněk Paris, Ph.D. 

Laboratoř imunologie vektorů - RNDr. Petr Kopáček, CSc
                                                    - RNDr. Daniel Sojka, Ph.D. 
                                                    - RNDr. Radek Šíma, Ph.D

Laboratoř rybí protistologie - Dr. Astrid Holzer, Ph.D. 

Laboratoř molekulární genetiky - prof. RNDr. Michal Žurovec, CSc. 

Laboratoř výzkumu telomer - RNDr. Radmila Čapková Frydrychová, Ph.D. 

Katedra chemie - Makrokomplex - RNDr. Zdeněk Franta, Ph.D


Ukázka publikací našich studentů:


Nenarokova A., Záhonová K., Krasilnikova M., Gahura O., McCulloch R., Zíková A., Yurchenko V., Lukeš J. (2019) Causes and effects of loss of classical nonhomologous end joining pathway in parasitic eukaryotes. mBio 10: e01541-19. DOI: 10.1128/mBio.01541-19

Krejcova G, Danielova A, Nedbalova P, Kazek M, Strych L, Chawla G, Tennessen JM, Lieskovská J, Jindra M, Dolezal T, Bajgar A (2019) Drosophila macrophages switch to aerobic glycolysis to mount effective antibacterial defense. eLife 14;8. pii: e50414. doi: 10.7554/eLife.50414.

Kaurov I, Vancová M, Schimanski B, Cadena LR, Heller J, Bílý T, Potěšil D, Eichenberger C, Bruce H, Oeljeklaus S, Warscheid B, Zdráhal Z, Schneider A, Lukeš J, Hashimi H. The Diverged Trypanosome MICOS Complex as a Hub for Mitochondrial Cristae Shaping and Protein Import. Current Biology. 2018 Nov 5;28(21):3393-3407.e5. doi: 10.1016/j.cub.2018.09.008.

Číst dál …Molekulární a buněčná biologie

  • Přečteno: 7076

Laboratoře

  • Seznam štítků: PŘF

Laboratoře

Na naší katedře se nachází celkem 6 laboratoří. Jedná se o pokročilá výzkumná zařízení. Naleznete u nás Laboratoř 3D modelování a aditivní výroby, Laboratoř komunikačních systémů a IoT, Laboratoř embedded systémů a UAV, Laboratoř umělé inteligence (AI Lab), Laboratoř aplikovaného vývoje a výzkumu a Laboratoř bioinformatiky.

  • Laboratoř 3D modelování a aditivní výroby

    Laboratoř 3D modelování a aditivní výroby je úzce propojena s laboratoří vestavných systémů a UAV. Zaměření laboratoře je především podpora aktivit a projektů fakulty, univerzity a Biologického centra AV. Specializujeme se na návrh a výrobu prototypů, technologický a materiálový výzkum. Realizujeme tvorbu komplexních 3D modelů, jejich analýzu a optimalizaci.

    Členové laboratoře:

    Mgr. Geyer Jakub
    PhDr. Milan Novák, Ph.D.

    Technologie

    Primární technologií laboratoře 3D modelování a aditivní výroby je 3D tisk. Jedná se především o tiskárny českého výrobce Prusa Research z oblastí FFF (fused filament fabrication) a SLA (stereolithography). Disponujeme vlastními modifikacemi těchto tiskáren, např. Prusa i3 MK3 s dvojnásobnou tiskovou plochou nebo upravený Prusa MMU2 (multi-material upgrade). Díky tomu jsme schopni tisknout nejen z běžných materiálů (např. PET, PLA, ABS), ale rovnež z filamentů s příměsemi (např. dřevo, karbon. vlákno, apod.) nebo náročnějších materiálů (nylon, polykarbonát, flexibilní TPE/TPU, apod.) a s využitím rozpustných podpor. Často tiskneme například z PET-G s příměsí karbonového vlákna, FRJet (PET-G s retardérem hoření - samozhášivost) a HT-CPE. Na tiskárnách SLA vytváříme velmi detailní součástky, na kterých díky míchání pryskyřic můžeme realizovat specifické vlastnosti (tepelná odolnost, požadovaná pružnost, atd.).
    3D tisk (aditivní proces výroby) lze také vhodně kombinovat se subtraktivními výrobními procesy (CNC, laserové řezení, atd.), díky čemuž lze realizovat komplexní prototypy.

    7443m-2

    Velkoformátový CO2 Laser (XM1490) umožňuje přesné řezání materiálů jako polykarbonát, PET nebo dřevo. Umožňuje také gravírování těchto materiálů a skla; nebo s použitím speciálních laků také permanentní značení/popisování kovů.
    Výkon: 150W, Max. šířka materiálu: 140cm

    7444m-2

    CNC fréza (High-Z S-720/T) slouží k přesnému obrábění plastových, kovových či dřevěných dílů. Vhodná je také k modifikacím již existujících dílů (vrtání děr, frézování kapes, apod.).
    Max. plocha 70x40x15cm.

    7439m 

    Přehled software
    OnShape, Fusion360, SolidWorks, FreeCAD, Blender, SketchUp, PrusaSlicer, Cura, Simplify3D, Meshmixer, OctoPrint, Meshroom, VXelements, ConstruCAM, WinPC-NC, LightBurn, a další

    Publikace a výstupy

    Publikace

    Novák M., Geyer J., et al. (2021) Construction of a Multisensor UAV System for Early Detection of Forest Pests. In: Shakhovska N., Medykovskyy M.O. (eds) Advances in Intelligent Systems and Computing V. CSIT 2020. Advances in Intelligent Systems and Computing, vol 1293. Springer, Cham. https://doi.org/10.1007/978-3-030-63270-0_78

    Příručka 3D modelování a tisk pro SŠ a příručka 3D modelování a tisk pro ZŠ, Impuls pro kariéru, 2021

    Patenty, užitné vzory
    Patent: Digital remote control of analog potentiometers for guitar amplifier (EP 19160447.9, 2021), Ptáček L., Novák M.
    Užitný vzor: Systém ke sledování kůrovcových aktivit (U1: 35641, 2021), Novák M., Ptáček L., Doležal P., Geyer J., Davídková M.

    Závěrečné práce
    Beránek Karel, Modifikace 3D tiskárny Prusa i3 MK3 na uzavřený koncept s dvojnásobnou tiskovou plochou
    Čechová Jana, Tvorba 3D modelů existujících budov
    Scholz Luděk, Systém pro řízení chytré domácnosti
    Švarc Jakub, Konstrukce a řízení kolového robotického prostředku (probíhající)
    Trtílek Ondřej, Konstrukce robotické ruky pro mobilní podvozek (probíhající)

      

  • Laboratoř embedded systémů a UAV

    Laboratoř poskytuje zázemí pro projekty zaměřené na vestavěné systémy, elektroniku, robotiku, bezpilotní systémy. Laboratoř se podílí na vývoji specifických systémů pro dílčí projekty ve spolupráci s ostatními součástmi PřF. Jedná se především o senzorické systémy pro bezpilotní prostředky, systém pro regulaci a automatizaci apod.

    Laboratoř embedded systémů a UAV disponuje několika bezpilotními stroji:

    1. DJI Matrice 600Pro
    2. DJI S1000
    3. DJI Phantom 4 Adv

    Kromě uvedených strojů, které se využívají pro získávání převážně environmentálních dat se zabýváme vývojem vlastních UAV pro speciální aplikace s využitím autopilotů Pixhawk.

    Pro testování algoritmů a výuku využíváme platformu CrazyFlie.

    Bezpilotní prostředky jsou nosiči pro snímače, které se využívají v závislosti na potřebách získávání dat: Nejčastěji se jedná o termokamery WIRIS 2gn, WIRIS PRO, spektrální a hyperspektrální kamery nebo specifické senzory.

    K vývoji specifických zařízeních jako jsou senzorické sítě, elektronické komponenty nebo snímače pro UAV jsou v laboratoři k dispozici:

    1. Oscioloskopy.
    2. Spektrální analyzér.
    3. Generátory.
    4. Pájecí stanice.
    5. CNC fréza LPKF E44 pro výrobu PCB.
    6. A vše potřebné pro práci s procesory při vytváření prototypových zařízeních.

    Laboratoř disponuje také experimentální fotovoltaickou elektrárnou pro testování elektroniky pro aktivní chlazení FVP apod.

    IMG_7927.jpegIMG_7926.jpegIMG_4941.jpegIMG_5159.jpegIMG_4943.jpegIMG_6682.jpgIMG_5899.jpgIMG_5151.jpgIMG_2721.jpeg
  • Laboratoř komunikačních systémů

    Tým se zabývá komunikačními technologiemi a to jak drátovými, tak bezdrátovými a to v široké škále aplikací. Od optických komunikačních systémů až po bezdrátové senzorické sítě, či efektivní hospodařením se spotřebou elektrické energie. Tým spolupracuje úzce s týmem Vestavných systému a aditivní výroby a provozuje laboratoř Komunikačnách systému a IoT. Spolupracuje se dalšími partnery v ČR a zahraničí, např. se sdružením CESNET.

     Vedoucí týmu:

    Ing. Rudolf Vohnout, Ph.D.

     Příklady projektů:

    SmartGrid – Chytré sítě ve venkovských oblastech a MSP, projekt č. 144, přeshraniční spolupráce Česká republika - Svobodný stát Bavorsko Cíl EÚS 2014 – 2020. Více na: http://smartgrid.science/

    ELIXIR CZ – Česká národní infrastruktura pro biologická data, projekt velké výzkumné infrastruktury, ID  LM2015047 +  LM2018131. Řešení společně s týmem Bioinformatiky. Více na: https://elixir-czech.cz/

Číst dál …Laboratoře

  • Přečteno: 6227

Seznam nákupů

Číst dál …Seznam nákupů

  • Přečteno: 752

Lidé

Centrum pro přírodovědné vzdělávání

Je místem setkávání a tvůrčí činnosti  studentů středních a vysokých škol, studentů učitelských oborů, VŠ i SŠ pedagogů.

  • doc. RNDr. Ing. Jana Kalová, Ph.D.
    Vedoucí centra

  • +420 775 111 861

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • Mgr. Eva Gardianová
    Manažerka pro celoživotní vzdělávání

  • +420 777 673 503

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Realizuje akce celoživotního vzdělávání především pro pedagogy a žáky středních škol.  Zejména vzdělávací víkendy, workshopy, exkurze a různá oborová setkání pedagogů. 

  • Mgr. Alexandra Bernardová
    Koordinátorka programů CPV a DVPP pro rozšíření učitelské kvalifikace

  • +420 389 032 250

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • Mgr. Josef Juráň, Ph.D.
    Vedoucí Science EduLab
    Realizace Příměstského tábora s Přírodovědou, garant učitelství biologie

  • *2320

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Další kontakty:

  • Mgr. Jarmila Ichová
    Oborová didaktička, provázející učitelka

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • Mgr. Roman Kneifl
    Vedoucí praxí, oborový didaktik, školitel DVPP

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • Mgr. Karel Pazourek, Ph.D.
    Oborový didaktik, provázející učitel, školitel DVPP

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • Ing. Vít Podroužek
    Oborový didaktik, provázející učitel, školitel DVPP

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • Mgr. Zbyněk Vrba
    Oborový didaktik, provázející učitel

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • RNDr. Olga Tichá
    Oborová didaktička

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

  • Mgr. Jana Hudáková
    Oborová didaktička, provázející učitelka

  • Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Číst dál …Lidé

  • Přečteno: 99104

Přihlaste si
odběr newsletteru

Zůstaňme v kontaktu na
sociálních sítích

Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Branišovská 1645/31a, 370 05 České BudějoviceTel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

© 2024 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Cookies

1

0