Skip to main content

PRF

Publikace

Centrum polární ekologie

  • 2024

    Články

    Cooke S. J., Piczak M. L., Singh N. J., Åkesson S., Ford A. T., Chowdhury S., Mitchell G. W., Norris D. R., Hardesty-Moore M., McCauley D., Hammershlag N., Tucker M. A., Horns J. J., Reisinger R. R., Kubelka V., Lennox R. J. (2024): Animal migration in the Anthropocene: threats and mitigation options. Biological reviews 99(4), p. 1242-1260.
    https://doi.org/10.1111/brv.13066

    Dayal A., Hodson A., Šabacká M., Smalley A. (2024): Seasonal changes in the viability and abundance of bacterial cells in the snowpack ecosystem of a High Arctic ice cap. ARCTIC, ANTARCTIC, AND ALPINE RESEARCH 56 (1), 2407711.
    https://doi.org/10.1080/15230430.2024.2407711

    Dillenseger G. (2024): Active defence mechanisms in brood parasitism hosts and their consequences for parasite adaptation and speciation. Journal of Avian Biology. 
    https://doi.org/10.1111/jav.03252

    Dillenseger G., Rimoldi A., Barreto S., Ugarte M., Kubelka V. (2024): Courtship behavior and breeding phenology of Andean Lapwing (Vanellus resplendens) in the Peruvian altiplano. The Wilson Journal of Ornithology 135(4), p. 560-569.
    https://doi.org/10.1676/23-00013

    Engel Z, Láska K, Smolíková J, Kavan J. (2024): Recent change in surface mass-balance trends of glaciers on James Ross Island, north-eastern Antarctic Peninsula. Journal of Glaciology 2024:1-15. 
    https://doi.org/10.1017/jog.2024.16

    Janko K., Shain D. H., Fontaneto D., Kaštánková Doležálková M., Buda J., Štefková Kašparová E., Šabacká M., Rosvold J., Stefaniak J., Hessen D. O., Devetter M., Jimenez/Santos M. A., Horna P., Janková Drdová E., Yde J. C., Zawierucha K. (2024): Islands of ice: Glacier-dwelling metazoans form regionally distinct populations despite extensive periods of deglaciation. Diversity and Distribution 30(10).
    https://doi.org/10.1111/ddi.13859

    Kavan J., Stuchlík R., Carrivick J. L., Hanáček M., Stringer Ch. D., Roman M., Holuša J., Dagsson-Waldhauserová P., Láska K., Nývlt K. (2024): Proglacial lake evolution coincident with glacier dynamics in the frontal zone of Kvíárjökull, South-East Iceland.  Earth Surface Processes and Landforms 49 (5), p. 1487-1502.
    https://doi.org/10.1002/esp.5781

    Kostrzewa O., Szczypinska M., Kavan J., Senderak K., Novák M., Strzelecki M. C. (2024): A Boulder Beach Formed by Waves From a Calving GlacierRevisited: Multidecadal Tsunami–Controlled Coastal Changes in Front of Eqip Sermia, West Greenlan. Permafrost and Periglacial Processes, 35 (3), p. 312-325.
    https://doi.org/10.1002/ppp.2235

    Kvíderová J., Kubáč D., Lukavský J. (2024): Pilot plant cultivation of microalga Dictyosphaerium chlorelloides with night illumination from LEDs sources. Algal Research 84, 103759.
    https://doi.org/10.1016/j.algal.2024.103759

    Liebmann P., Bárta J., Vogel C., Urich T., Kholodov A., Varsadiya M., Mewes O., Dultz S., Waqaz M., Wang H., Shibistova O., Guggenberger G. (2024): Permafrost degradation and its consequences for carbon storage in soils of Interior Alaska. Biogeochemistry, 167, p. 199–223.
    https://doi.org/10.1007/s10533-024-01132-4

    Pushkareva E., Hejduková E., Elster J., Becker B. (2024): Microbial response to seasonal variation in Arctic biocrusts with a focus on fungi and cyanobacteria. Environmental Research, 263 (2), 120110.
    https://doi.org/10.1016/j.envres.2024.120110

    Pushkareva E, Elster J, Kudoh S, Imura S and Becker B (2024): Microbial communitycomposition of terrestrial habitats in East Antarctica with a focus on microphototrophs. Frontiers in Microbiology 14:1323148. 
    https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1323148.

    Roman M., Píšková A., Sanderson D. C. W., Cresswell A. J., Bulínová M., Pokorný M., Kavan J., Jennings S. J. A., Lirio J. M., Nedbalová L., Sacherová V., Kopalová K., Glasser N. F., Nývlt D. (2024): The Late Holocene deglaciation of James Ross Island, Antarctic Peninsula: OSL and 14C-dated multi-proxy sedimentary record from Monolith Lake. Quaternary Science Reviews 333, 108693.
    https://doi.org/10.1016/j.quascirev.2024.108693

    Savaglia V, Lambrechts S, Tytgat B,Vanhellemont Q, Elster J, Willems A,Wilmotte A, Verleyen E andVyverman W (2024): Geology definesmicrobiome structure and composition innunataks and valleys of the Sør Rondane Mountains, East Antarctica. Frontiers in Microbiology 15, p. 1 - 16.
    https://doi.org/10.3389/fmicb.2024.1316633.

    Tanner C. E., Jones W., Kubelka V., Caspers B. A., Krueger O., Mijoro T. J., Sandercock B. K., Zefania S., Székely T. (2024): Variation in nest survival of three species of tropical plovers in Madagascar with clutch size, age of nest, year and El Niño effect. Ecology and Evolution, 14 (9), e70269.
    https://doi.org/10.1002/ece3.70269

  • 2023

    Články

    Dayal, A., Hodson, A. J., Šabacká, M., Smalley, A. L. (2023): Seasonal snowpack microbial ecology and biogeochemistry on a high Arctic ice cap reveals negligible autotrophic activity during spring and summer melt. Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 128, e2022JG007176.
    https://doi.org/10.1029/2022JG007176.

    Edwards K.R., Bárta J., Mastný J., Picek T. (2023): Multiple environmental factors, but not nutrient addition, directly affect wet grassland soil microbial community structure: a mesocosm study. FEMS Microbiology Ecology, Volume 99 (7).
    https://doi.org/10.1093/femsec/fiad070.

    Elster J., Souquieres C. E., Jadrná I., Škaloud P., Søreide J. E., Kvíderová J. (2023): Invasive Vaucheria aff. compacta (Xanthophyceae) and its distribution over a high Arctic tidal flat in Svalbard. Estuarine, Coastal and Shelf Science, 281.
    https://doi.org/10.1016/j.ecss.2022.108206.

    Herrmann, T.M., Brunner Alfani, F., Chahine, A., Doering, N., Dudeck, S., Elster, J., Fjellheim, E., Henriksen, J.E., Hermansen, N., Holmberg, A., Kramvig, B., Keskitalo, A.M.N., Omma, E.M., Saxinger, G., Scheepstra, A., van der Schot, J. (2023). Comprehensive Policy-Brief to the EU Commission: Roadmap to Decolonial Arctic Research. University of Oulu, Helmholtz-Centre for Environmental Research- UFZ, The Indigenous Voices (IVO) research group – Álgoálbmogii jienat, Arctic University of Norway UiT, Saami Council. Áltá – Kárášjohka – Leipzig – Oulu.
    https://doi.org/10.25365/phaidra.400

    Hromádková T., Pavel V., Weidinger K. (2023): Incubation behaviour of Arctic (Sterna paradisaea) and Antarctic (Sterna vittata) terns under disturbance by humans and predators. Polar Biology 46 (12), p. 1265-1274.
    DOI: 10.1007/s00300-023-03199-5.

    Kavan, J., Luláková, P., Małecki, J., & Strzelecki, M. (2023): Capturing the transition from marine to land-terminating glacier from the 126-year retreat history of Nordenskiöldbreen, Svalbard. Journal of Glaciology, 1-11.
    https://doi:10.1017/jog.2023.92

    Liu J., Chai Z., Wang H., Ivanov A., Kubelka V., Freckleton R., Zhang Z., Székely T. (2023): Egg characteristics vary longitudinally in Arctic shorebirds. iScience, Volume 26 (6).
    https://doi.org/10.1016/j.isci.2023.106928

    Lukavský J., Kopecký J., Kubáč D., Kvíderová J., Procházková L., Řezanka T. (2023): The alga Bracteacoccus bullatus (Chlorophyceae) isolated from snow,as a source of oil comprising essential unsaturated fatty acidsand carotenoids. Journal of Applied Phycology 35:649–660.https://doi.org/10.1007/s10811-023-02916-1.

    Luláková P., Šantrůčková H., Elster J., Hanáček M., Kotas P., Meador T., Tejnecký V., Bárta J. (2023): Mineral substrate quality determines the initial soil microbial development in front of the Nordenskiöldbreen, Svalbard. FEMS Microbiology Ecology, 99 (10)
    https://doi.org/10.1093/femsec/fiad104

    Pushkareva E., Elster J., Becker B. (2023): Metagenomic Analysis ofAntarctic Biocrusts Unveils a RichRange of Cold-Shock Proteins. Microorganisms 11, 1932.
    https://doi.org/10.3390/microorganisms11081932.

    Souquieres C.-E., Kvíderová J.Elster J. (2023): Extensive microphytobenthos mats of invasive Vaucheria aff.compacta and abiotic environmental factors influencing its abundancein Adventfjorden tidal flat, Svalbard. Polar Biology 46 (2).
    https://doi.org/10.1007/s00300-023-03203-y.

    Székely T., Carmona-Isunza M. C., Engel N., Halimubieke N., Jones W., Kubelka V., Rice R., Tanner C. E., Tóth Z., Valdebenito J. O., Wanders K., McDonald G. C. (2023): The causes and implication of sex role diversity in shorebird breeding systems. Ibis 166(2).
    https://doi.org/10.1111/ibi.13277.

    Zawierucha K., Kašparová E.Š., McInnes S., Buda J., Ambrosini R., Devetter M., Ficetola G.F., Franzetti A., Takeuchi N., Horna P., Novotná Jaroměřská T., Ono M., Šabacká M., Janko K. (2023): Cryophilic Tardigrada have disjunct and bipolar distribution and establish long-term stable, low-density demes. Polar Biology 46(10), 1-17.
    https://doi.org/10.1007/s00300-023-03170-4.

  • 2022

    Články

    Barrio I. C., Ehrich D., Soininen E. M., Ravolainen V. T., Bueno C. G., Gilg O., Koltz A. M., Speed J. D. M., Hik D. S., Morsdorf M., Alatalo J. M., Angerbjorn A., Bety J., Bollache L., Boulanger-Lapointe N., Brown G. S., Eischeid I., Giroux M. A., Hájek T., Hansen B. B., Hofhuis S. P., Lamarre J-F., Lang J., Latty C., Lecomte N., Macek P., McKinnon L., Myers-Smith I. H., Pedersen A. O., Prevey J. S., Roth J. D., Saalfeld S. T., Schmidt N. M., Smith P., Sokolov A., Sokolova N., Stolz C., van Bemmelen R., Varpe O., Woodard P. F., Jonsdottir I. S. (2022): Developing common protocols to measure tundra herbivory across spatial scales(1). Arctic Science, 8 (3), 638-679. 
    https://doi.org/10.1139/as-2020-0020

    Dao, T. T., Mikutta, R., Sauheitl, L., Gentsch, N., Shibistova, O., Wild, B., Schecker J., Bárta J., Čapek P., Gittel A., Lashchinskiy N., Urich T., Šantrůčková H., Richter A., Guggenberger G. (2022): Lignin preservation and microbial carbohydrate metabolism in permafrost soils. Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 127, e2020JG006181
    https://doi.org/10.1029/2020JG006181.

    Ernakovich, J. G., Barbato, R. A., Rich, V. I., Schädel, C., Hewitt, R. E., Doherty, S. J., Whalen, E. D., Abbott, B. W., Barta, J., Biasi, C., Chabot, C. L., Hultman, J., Knoblauch, C., Vetter, M. C. Y., Leewis, M-C, Liebner, S., Mackelprang, R., Onstott, T. C., Richter, A. … Winkel, M. (2022). Microbiome assembly in thawing permafrost and its feedbacks to climate. Global Change Biology, 00, 1–20.
    https://doi.org/10.1111/gcb.16231

    Kubelka V., Sandercock B., Székely T. & Freckleton R. P. (2022): Animal migration to northern latitudes: environmental changes and increasing threats. Trends in Ecology & Evolution 37: 30–41.
    https://doi.org/10.1016/j.tree.2021.08.010

    Pedersen Å.Ø., Convey P., Newsham K.K., Mosbacher J.B., Fuglei E., Ravolainen V., Hansen B.B., Jensen T.C., Augusti A., Biersma E.M., Cooper E.J., Coulson S.J., Gabrielsen G.W., Gallet J.C., Karsten U., Kristiansen S.M., Svenning M.M., Tveit A.T., Uchida M., Baneschi I., Calizza E., Cannone N., de Goede E.M., Doveri M., Elster J., Giamberini M.S., Hayashi K., Lang S.I., Lee Y.K., Nakatsubo T., Pasquali V., Paulsen I.M.G., Pedersen C., Peng F., Provenzale A., Pushkareva E., Sandström C.A.M., Sklet V., Stach A., Tojo M., Tytgat B., Tømmervik H., Velazquez D., Verleyen E., Welker J.M., Yao Y.-F. & Loonen M.J.J.E. (2022): Five decades of terrestrial and freshwater research at Ny-Ålesund, Svalbard. Polar Research 41, 6310.
    http://dx.doi.org/10.33265/polar.v41.6310

    Prakash E. A., Hromádková T., Jabir T., Vipindas P. V., Krishnan K.P., Hatha M. A. A., Briedis M. (2022): Dissemination of multidrug resistant bacteria to the polar environment - Role of the longest migratory bird Arctic tern (Sterna paradisaea). Science of The Total Environment, Vol. 815 (152727).
    https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.152727

    Pushkareva E. , Elster J., Holzinger A. , Niedzwiedz S. , Becker B. (2022): Biocrusts from Iceland and Svalbard: Does microbial community composition differ substantially?. Frontiers in Microbiology 13.
    http://dx.doi.org/10.3389/fmicb.2022.1048522

    Šálek, M., Sládeček, M., Kubelka, V., Mlíkovský, J., Storch, D. and Šmilauer, P. (2022): Beyond habitat: effects of conspecific and heterospecific aggregation on the spatial structure of a wetland nesting bird community. Journal of Avian Biology, 2022(2): e02928. 
    https://doi.org/10.1111/jav.02928

    Varsadiya, M., Liebmann, P., Petters, S., Hugelius, G., Urich, T., Guggenberger, G., Bárta, J. (2022): Extracellular enzyme ratios reveal locality and horizon-specific carbon, nitrogen, and phosphorus limitations in Arctic permafrost soils. Biogeochemistry 161, 101–117.
    https://doi.org/10.1007/s10533-022-00967-z

    Wada T., Kudoh S., Koyama H., Iakovenko N., Elster J.Kvíderová J., Otani M., Shimada S., Imura S. (2022): Abundance and biomass of Bdelloid rotifers in the microbial mats from East Antarctica: The ecologiacel relations between microscopic phototrophs and invertebrates. Ecological Research, 1 - 14. 
    https://doi.org/10.1111/1440-1703.12368

  • 2021

    Články

    Vonnahme T.R., Persson E., Dietrich U., Hejdukova E., Dybwad C., Elster J., Chierci M., Gradinger R. (2021): Early spring subglacial discharge plumes fuel under-ice primary production at a Svalbard tidewater glacier. The Cryosphere, 15, 2083-2107,
    doi.org/10.5194/tc-15-2083-2021

    Kudoh, S., Wada T., Shimada, S., Otani, M., Elster, J., Uchida, M., Imura, S. (2021): Meteorological data from ice-free areas in Yukidori Zawa, Langhovde and Kizahashi Hama, Skarvsnes, and Skallen on Soya Coast, East Antarctica during January 2017 – December 2018 2021: Polar Data Journal, Vol. 5, 1-10. Arctic Data Archive System (ADS), Japan, 2019.
    https://doi.org/10.17592/001.2020103001

    Verleyen E., Van de Vijver B., Tytgat B., Pinseel E., Hodgson D. A., Kopalová K., Chown S. L., Ranst E. V., Imura S., Kudoh S., Nieuwenhuyze W. V., Elster J., Jones, V. J. Kohler T. J., McKnight D., McMinn A., Nedbalová L., Roberts D., Saunders K. M., Souffreau C., Sterken M., Tavernier I., Sabbe K., Vyverman W. (2021): Diatoms define a novel freshwater biogeography of the Antarctic. Ecography, 44: 1-13,
    doi: 10.1111/ecog.05374

    Jimel M., Kvíderová J., Elster J. (2021): Annual cycle of mat-forming filamentous algae Tribonema cf. minus (Stramenopile, Xanthophyceae) in hydro-terrestrial habitats in the Hight Arctic revealed by multiparameter fluorescent staining. J. Phycol., 57, 780-796,
    DOI: 10.1111/jpy.13109

    Hermans R., M.P.M., Ditrich O., Tyml T.,Gelnar M., Artois T., Kmentová N., (2021): Parasitic flatworms infecting thorny skate, Amblyraja radiata: Infection by the monogeneans Acanthocotyle verrilli and Rajonchocotyle emarginata in Svalbard. Parasitology International, Vol. 81, 102261, ISSN 1383-5769.
    https://doi.org/10.1016/j.parint.2020.102261.

    Myšková E.Brož M.Kváč M., Sak B. Ditrich O. (2021): Intestinal parasites of dogs (Canis lupus familiaris) in Svalbard (Norway): low prevalence and limited transmission with wildlife. Canadian Journal of Zoology, 4. pp. 249-255.
    DOI: 10.1139/cjz-2020-0186

    Hodson, A. J., Šabacká, M., Dayal, A., Edwards, A., Cook, J., Convey, P., et al. (2021). Marked seasonal changes in the microbial production, community composition, and biogeochemistry of glacial snowpack ecosystems in the maritime Antarctic. Journal of Geophysical Research: Biogeosciences, 126. 
    https://doi.org/10.1029/2020JG005706

    Lyčka, Z., Elster, J. (2021): Český polární výzkum a Arktický festival – Dny arktické a české vědy a kultury. Živa 1/2021: 2-5, LXIX.

    Elster, J., Lyčka, Z. (2021): Arktida a její reakce na globální oteplování – příběh české vědy. Živa 1/2021: XXI-XXII, LXIX.

    Kapitoly v knize

    Petkov, B.H., Vitale, V., Di Carlo P., Hansen G.H., Svendby T.M., Láska K., Sobolewski S., Solomatnikova A., Pavlova K., Johnsen B., Posyniak M. A., Elster, J., Mazzola M., Lupi A., Verazzo G. (2021): The extreme Arctic ozone depletion in 2020 as was observed from Svalbard (EXAODEP-2020) SESS  report 2021 – The State of Environmental Science in Svalbard.,
    Doi.org/10.5281/zenodo.5751922

    Di Prisco, G., Edwards H. G.M., Elster J., Huiskes A.H.L.(eds.) (2021): Life in Extreme Environments; Insights in Biological, Introduction, pp. 1 – 5,  Capability. Cambridge University Press,
    DOI: 10.1017/9781108683319.

    Pichrtová M., Hejduková E., Nedbalová L., Elster, J. (2021): How to survive winter? Adaptation and acclimation strategies in eukaryotic algae from polar terrestrial ecosystems. In Life in Extreme Environments; Insights in Biological Capability (Eds G. Di Prisco, G.,  H. G. M Edwards, J. Elster, A. H. L. Huiskes), pp. 101 - 125, Cambridge University Press,
    DOI: 10.1017/9781108683319.

    Elster, J. (2021): PART I I I - Introduction, Life in extreme environments and the responses to change; the example of polar environments. In Life in Extreme Environments; Insights in Biological Capability (Eds G. Di Prisco, G.,  H. G. M Edwards, J. Elster, A. H. L. Huiskes), pp. 149 – 150, Cambridge University Press,
    DOI: 10.1017/9781108683319.

    Knihy

    Di Prisco, G., Edwards H. G.M., Elster J., Huiskes A.H.L. (eds.) (2021): Life in Extreme Environments; Insights in Biological Capability, pp, 364, Cambridge University Press,
    DOI: 10.1017/9781108683319.

  • 2020

    Články

    Hejduková E., Elster J., Nedbalová L. (2020): Annual cycle of freshwater diatoms in the High Arctic revealed by multiparameter fluorescent staining. Microbial Ecology,  https://doi.org/10.1007/s00248-020-01521-w

    Lyčka Z., Elster J. (2020): Punk’s not dead, even at the Czech Arctic Scientific Station in Svalbard. Oceanologia, 000:1-6, https://doi.org/10.1016/j.oceano.2020.03.007

    Singh, P., Šnokhousová, J., Saraf, A., Suradkar, A., Elster, J. (2020):  Phylogenetic evaluation of the genus Nostoc and description of Nostoc neudorfense sp. nov., from the Czech Republic. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology.
    DOI 10.1099/ijsem.0.004102.

    Hromádková T, Pavel V, Flousek J, Briedis M (2020) Seasonally specific responses to wind patterns and ocean productivity facilitate the longest animal migration on Earth. Mar Ecol Prog Ser 638:1-12. 
    https://doi.org/10.3354/meps13274

    Shukla, S. P., Kvíderová, J., Adamec, L., Elster, J. (2020). Ecophysiological features of polar soil unicellular micro‐algae. Journal of Phycology

    Syrová, M., Hromádková, T., Pavel, V., Veselý, P. (2020). Responses of nesting Arctic terns (Sterna paradisaea) to disturbance by humans. Polar Biology, 1-9.

    Kapitoly v knize

    Søreide J. E., Pitusi V., Vader A., Damsgård B., Nilsen F., Skogseth R., Poste A., Bailey A., Kovacs K. M., Lydersen Ch., Gerland S., Descamps S., Strøm H., Renaud P. E., Christensen G., Arvnes M. P., Moiseev D., Singh R. K., Bélanger S., Elster J., Urbański J., Moskalik M., Wiktor J., and Węsławski J. M. (2020): Environmental status of Svalbard coastal waters: coastscapes and focal ecosystem components (SvalCoast), In: Moreno-Ibáñez at al. (eds.) SESS report 2020, Svalbard Integrated Arctic Earth Observing System, Longyearbyyen, pp. 143-174,
    doi.org/10.5281/zenodo.4293849.

    Knihy

    Bezděk A., Bernardová A., Burgert P., Ditrich O., Drvotová M., Hlaváč J., Horáček I., Hošek J., Hošková K., Juřičková L., Kapustka K., Kovačiková L., Krásný F., Kuželka V., Mangel T., Novák J., Prostředník J., Ptáková M., Sázelová S., Vondrovský V. (2020): Mezolit severních Čech III. Vývoj pravěké krajiny Českého ráje: Vegetace, fauna, lidé, pp. 600.
    ISBN 978-80-7524-036-1

    Knihy abstraktů

    Hromádková, T. (ed.) (2020) Polar Ecology Conference 2020. Centre for Polar Ecology, Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice, České Budějovice. ISBN: 978-80-7394-796-5

  • 2019

    Články

    Hawes, I., Jungblut, A. D., Elster, J., Van de Vijver, B., Mikucki, J. (2019). Inland aquatic biodiversity in Antarctica. Antarctic Environments Portal
    https://doi.org/10.18124/439s-wk64

    Hejduková, E., Pinseel, E., Vanormelingen, P., Nedbalová, L., Elster, J., Vyverman, W., & Sabbe, K. (2019). Tolerance of pennate diatoms (Bacillariophyceae) to experimental freezing: comparison of polar and temperate strains. Phycologia, 1-11.

    Dufková, K., Barták, M., Morkusová, J., Elster, J., Hájer, J. (2019). Screening of growth phases of Antarctic algae and cyanobacteria cultivated on agar plates by chlorophyll fluorescence imaging. Czech Polar Reports 9 (2): 170-181.

    Kvíderová, J., Souquieres, C. E., Elster, J. (2019). Ecophysiology of photosynthesis of Vaucheria sp. mats in a Svalbard tidal flat. Polar Science, 21, 172-185.

    Kvíderová, J., Elster, J. (2019). Photosynthesis ecophysiology of polar Vaucheria sp.–inter-annual comparison. Czech Polar Reports, 9(2), 141-151.

    Kvíderová, J., Kumar, D., Lukavský, J., Kaštánek, P., & Adhikary, S. P. (2019). Estimation of growth and exopolysaccharide production by two soil cyanobacteria, Scytonema tolypothrichoides and Tolypothrix bouteillei as determined by cultivation in irradiance and temperature crossed gradients. Engineering in Life Sciences, 19(3), 184-195.

    Lulakova, P., Perez Mon, C., Šantrůčková, H., Rüthi, J., Frey, B. W. (2019). HIGH-ALPINE PERMAFROST AND ACTIVE-LAYER SOIL MICROBIOMES DIFFER IN THEIR RESPONSE TO ELEVATED TEMPERATURES. Frontiers in Microbiology, 10, 668.

    Malard, L. A., Šabacká, M., Magiopoulos, I., Hodson, A., Tranter, M., Siegert, M. J., Pearce, D. A. (2019). Spatial variability of Antarctic surface snow bacterial communities. Frontiers in Microbiology, 10, 461.

    Myšková, E., Brož, M., Fuglei, E., Kvičerová, J., Mácová, A., Sak, B., Kváč, M., Ditrich, O. (2019). Gastrointestinal parasites of arctic foxes (Vulpes lagopus) and sibling voles (Microtus levis) in Spitsbergen, Svalbard. Parasitology Research 
    https://doi.org/10.1007/s00436-019-06502-8

    Orekhova, A., Barták, M., Özkar, A., Elster, J. (2019) The effect of shock freezing on physiological properties and consequent growth of Antarctic filamentous (Stigeoclonium sp.) and coccal alga (Diplosphaera chodatii) on agar plates. Czech Polar Reports, 9(1), 37-48

    Pushkareva, E., Wilmotte, A., Láska, K., Elster, J. (2019) Comparison of Microphototrophic Communities Living in Different Soil Environments in the High Arctic. Frontiers in Ecology and Evolution, 4, 393.

    Raabová, L., Kovacik, L., Elster, J., Strunecký, O. (2019) Review of the genus Phormidesmis (Cyanobacteria) based on environmental, morphological, and molecular data with description of a new genus Leptodesmis. Phytotaxa, 395 (1), 001-0016.

    Roman, M., Nedbalová, L., Kohler, T., Lirio, J., Coria, S.,H., Kopáček, J., Vignoni, P., Kopalová, K., Lecomte, K., Elster, J., Nývlt, D. (2019). Lacustrine systems of Clearwater Mesa (James Ross Island, north-eastern Antarctic Peninsula): geomorphological setting and limnological characterization. Antarctic Science. 1-20.

    Shukla, S. P., Kvíderová, J., Adamec, L., Elster, J. (2019). Ecophysiological features of polar soil unicellular micro‐algae. Journal of Phycology.

    Kapitoly v knize

    Kvíderová, J., Elster, J., & Komárek, J. (2019). Ecophysiology of Cyanobacteria in the Polar Regions. In Cyanobacteria (pp. 277-302). Academic Press.

    Petkov, B. H., Vitale, V., Hansen, G. H., Svendby, T. M., Sobolewski, P. S., Láska, K., Elster, J., Viola, A., Mazzola M., Lupi, A. (2019). Observations of the solar UV irradiance and ozone column at Svalbard. In:  Orr, E., Hansen, G., Lappalainen, H., Hübner, Ch. & Lihavainen, H. (Eds), SESS report 2018, Longyearbyen, The State of Environmental Science in Svalbard, Svalbard Integrated Arctic Earth Observing System (SIOS), ISSN 2535-6321, SSBN 978-82-691528-0-7, pp. 170 – 182

  • 2018

    Články

    Barcytė, D., Elster, J., Nedbalová, L. (2018): Plastid-encoded rbcL phylogeny suggests widespread distribution of Galdieria phlegrea (Cyanidiophyceae, Rhodophyta). Nordic Journal of Botany, 36(6), e01794. 

    Barcyté, D., Hodač, L., Nedbalová, L., Elster, J. (2018): Chloromonas arctica sp. nov., a psychrotolerant alga from snow in the High Arctic (Chlamydomonadales, Chlorophyta). International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 68(3), 851-859. 

    Barcytė, D., Hodač, L., Nedbalová, L., Elster, J. (2018): Chloromonas svalbardensis n. sp. with insights into the phylogroup Chloromonadinia (Chlorophyceae). Journal of Eukaryotic Microbiology, 65(6), 882-892. 

    Bjorkman, A.D., Myers-Smith, I.H., Elmendorf, S.C., Normand, S., Thomas, H.J.D., Alatalo, J.M., Alexander, H., Anadon-Rosell, A., Angers-Blondin, S., Bai, Y., Baruah, G., Beest, M.T., Berner, L., Björk, R.G., Blok, D., Buchwal, A., Buras, A., Carbognani, M., Christie, K., Collier, L.S., Cooper, E.J. Cornelissen, J.H.C., Dickinson, K., Dullinger, S., Elberling, B., Eskelinen, A., Forbes, B.C., Frei, E.R., Garcia, M.I., Good, M., Grau, O., Green, P., Grogan, P., Hájek, T., Martin Hallinger, M., Harper, K.A., Heijmans, M.M.P.D., Henry, G.H.R., Hermanutz, L., Hollister, R.D., Hudson, J., Hülber, K., Iversen, C.M., Jaroszynska, F., Johnstone, J., Jorgensen, R.H., Kaarlejärvi, E., Klady, R., Klimešová, J., Korsten, A., Kuleza, S., Kulonen, A., Lamarque, L.J., Lantz, T., Lavalle, A., Levesque, E., Little, C.J., Macek, P., Michelsen, A., Milbau, A., Molau, U., Morgan, J.W., Mörsdorf, M.A., Nabe-Nielsen, J., Nielsen, S.S., Ninot, J.M., Oberbauer, S., Olofsson, J., Onipchenko, V.G., Petraglia, A., Pickering, C., Prevéy, J.S., Rixen, C., Rumpf, S.B., Schaepman-Strub, G., Semenchuk, P., Shetti, R., Soudzilovskaia, N.A., Spasojevic, M., Speed, J.D.M., Street, L., Suding, K., Tape, K.D., Tomaselli, M., Trant, A., Treier, U., Tremblay, J.P., Tremblay, M., Venn, S., Vowles, T., Weijers, S., Wilmking, M., Wipf, S., Zamin, T. (2018): Tundra Trait Team: A database of plant traits spanning the tundra biome. Global Ecology and Biogeography, 27(12), 1402-1411. 

    Bohuslavová, O., Macek, P., Redčenko, O., Láska, K., Nedbalová, L., Elster, J. (2018): Dispersal of lichens along a successional gradient after deglaciation of volcanic mesas on northern James Ross Island, Antarctic Peninsula, Polar Biology, 41(11), 2221-2232. 

    Kvíderová, J. (2018): Internal structure and photosynthetic performance of Nostoc sp. colonies in the High Arctic. Acta Societatis Botanicorum Poloniae, 87(4), 3602. 

    Macek, P., Schöb, C., Núñez-Ávila, M., Hernández Gentina, I.R., Pugnaire, F.I., Armesto, J.J., (2018): Shrub facilitation drives tree establishment in a semiarid fog-dependent ecosystem. Applied Vegetation Science, 21, 113-120. 

    Macek, P., Schöb, C., Núñez-Ávila, M., Pugnaire, F.I., Armesto, J.J., (2018): Shrubs mediate forest start-up and patch dynamics in a semiarid landscape. Perspectives in Plant Ecology, Evolution and Systematics, 34, 140-149. 

    Maliniemi, T., Kapfer J., Saccone, P., Skog, A., Virtanen, R. (2018): Long-term vegetation changes of treeless heath communities in northern Fennoscandia: links to climate change trends and reindeer grazing. Journal of Vegetation Science, 29, 469-479. 

    Müllerová, J., Elsterová, J., Černý, J., Ditrich, O., Žárský, J., Culler, L.E., Kampen, H., Walther, D., Coulson, S.J., Růžek, D., Grubhoffer, L. (2018): No indication of arthropod-vectored viruses in mosquitoes (Diptera: Culicidae) collected on Greenland and Svalbard. Polar Biology, 41(8), 1581–1586.

    Petkov, B. H., Vitale, V., Svendby, T. M., Hansen, G. H., Sobolewski, P. S., Láska, K., Elster, J., Pavlova, K., Viola, A., Mazzola, M., Lupi, A., Solomatnikova, A. (2018): Altitude-temporal behaviour of atmospheric ozone, temperature and wind velocity observed at Svalbard. Atmospheric Research, 207, 100–110. 

    Pessi, I.S., Pushkareva, E., Lara, Y., Borderie1, F., Wilmotte, A., Elster, J. (2018): Marked succession of cyanobacterial communities following glacier retreat in the High Arctic. Microbial Ecology, 77 (1), 136–147. 

    Pistón, N., Michalet, R. Schöb, C., Macek, P., Armas, C., Pugnaire, F.I. (2018): The balance of canopy and soil effects determines intraspecific differences in foundation species’ effects on associated plants. Functional Ecology 32: 2253–2263. 

    Roy, J., Bonneville, J.M., Saccone, P., Ibanez S., Albert, H. C., Boleda, M., Gueguen, M., Ohlman, M., Rioux, D., Clément, J.C., Lavergne, S., Geremia, R. (2018): Differences in the fungal communities nursed by two genetic groups of the alpine cushion plant, Silene acaulis. Ecology and Evolution, 8(23): 11568–11581. 

    Schaeffner, B.C., Ditrich, O., Kuchta, R. (2018): A century of taxonomic uncertainty: re-description of two species of tapeworms (Diphyllobothriidea) from Arctic seals. Polar Biology, 41 (12), 2543–2559. 

    Smykla, J., Porazinska, D.L., Iakovenko, N.S., Devetter, M., Drewnik, M., Hii, S.Y., Emslie, S.D. (2018): Geochemical and biotic factors influencing diversity and distribution patterns of soil microfauna across ice-free coastal habitats in Victoria Land, Antarctica. Soil Biology and Biochemistry 116 265–276 10.1016/j.soilbio.2017.10.028. 

    Tyml, T., Lisnerová, M., Kostka, M., Dyková, I. (2018): Current view on phylogeny within the genus Flabellula Schaeffer, 1926 (Amoebozoa: Leptomyxida). European Journal of Protistology, 64, 40-53. 

    Tyml, T., Dyková, I. (2018): Sappinia sp. (Amoebozoa: Thecamoebida) and Rosculus sp. (SAR: Cercozoa) isolated from king penguin guano collected in the Subantarctic (South Georgia, Salisbury Plain) and their coexistence in culture. Journal of Eukaryotic Microbiology, 65, 544-555. 

  • 2017

    Články

    Devetter M., Háněl L., Řeháková K., Doležal J. (2017) Diversity and feeding strategies of soil microfauna a along elevation gradients in Himalayan cold deserts. PLoS ONE 12(11): e0187646.
    DOI: 10.1371/journal.pone.0187646

    Devetter M., Fontaneto D., Jersabek C.D., Welch D.B.M., May L., Walsh E.J. (2017) Preface: evolving rotifers, evolving science: Proceedings of the XIV International Rotifer Symposium. Hydrobiologia 796: 1–6.
    DOI: 10.1007/s10750-017-3241-0

    Elster J., Margesin R., Wagner D., Häggblom M. (2017) Polar and Alpine Microbiology - Earth's Cryobiosphere. FEMS Microbiology Ecology, 93, fiw221.
    DOI: 10.1093/femsec/fiw221

    Hodson A., Nowak A., Cook J., Šabacká M., Wharfe E.S., Pearce D., Convey P., Vieira G., (2017) Microbes influence the biogeochemical and optical properties of maritime Antarctic snow. JGR: Biogeosciences 122: 1456–1470.
    DOI: 10.1002/2016JG003694

    Hodson A., Nowak A., Šabacká M., Jungblut A.D., Navarro F., Pearce D.A., Ávila-Jiménez M.L., Convey P., Vieira G. (2017) Climatically sensitive transfer of iron to maritime Antarctic ecosystems by surface runoff. Nature Communications (8): 14499.
    DOI: 10.1038/ncomms14499

    Kumar D., Kvíderová J., Kaštánek P., Lukavský J. (2017) The green alga Dictyosphaerium chlorelloides biomass and polysaccharides production determined using cultivation in crossed gradients of temperature and light. Engineering in Life Sciences 9: 1030–1038.
    DOI: 10.1002/elsc.201700014

    Kvíderová J., Elster, J. (2017) Photosynthetic activity of Arctic Vaucheria (Xanthophyceae) measured in microcosmos. Czech Polar Reports 7(1): 52–61.
    DOI: 10.5817/CPR2017-1-6

    Nedbalová L., Mihál M., Kvíderová J., Procházková L., Řezanka T., Elster J. (2017): Identity, ecology and ecophysiology of planktic green algae dominating in ice-covered lakes on James Ross Island (northeastern Antarctic Peninsula). Extremophiles 21(1): 187–200.
    DOI: 10.1007/s00792-016-0894-y

    Nedbalová L., Nývlt D., Lirio J.M., Kavan J., Elster J. (2017) Current distribution of Branchinecta gaini on James Ross Island and Vega Island. Antarctic Science 29(4): 141–142.
    DOI: 10.1017/S0954102017000128

    Pouska V., Macek P., Zíbarová L., Ostrow H. (2017) How does the richness of wood-decaying fungi relate to wood microclimate? Fungal Ecology, 27: 178–181.
    DOI: 10.1016/j.funeco.2016.06.006

    Pushkareva E., Kvíderová J., Šimek M., Elster J. (2017) Nitrogen fixation and diurnal changes of photosynthetic activity in Arctic soil crusts at different development stage. European Journal of Soil Biology, 79, 21–30.
    DOI: 10.1016/j.ejsobi.2017.02.002

    Smykla J., Porazinska D.L., Iakovenko N.S., Devetter M., Drewnik M., Hii S.Y., Emslie S.D. (2018) Geochemical and biotic factors influencing diversity and distribution patterns of soil microfauna across ice-free coastal habitats in Victoria Land, Antarctica. Soil Biology and Biochemistry, 116: 265–276.
    DOI: 10.1016/j.soilbio.2017.10.028

    Schöb C., Macek P., Pistón N, Kikvidze Z., Pugnaire F.I. (2017) A trait-based approach to understand the consequences of specific plant interactions for community structure. Journal of Vegetation Science 28: 696–704.
    DOI: 10.1111/jvs.12523

    Tyml T., Lares‐Jiménez L. F., Kostka M., Dyková I. (2017) Neovahlkampfia nana n. sp. reinforcing an underrepresented subclade of Tetramitia, Heterolobosea. Journal of Eukaryotic Microbiology 64(1): 78–87.
    DOI: 10.1111/jeu.12341

    Tyml T., Dyková I. (2017) Phylogeny and taxonomy of new and re-examined strains of Tubulinea (Amoebozoa). European Journal of Protistology, 61, 41–47.
    DOI: 10.1016/j.ejop.2017.08.002

    Vítová A., Macek P., Lepš J. (2017): Disentangling the interplay of generative and vegetative propagation among different functional groups during gap colonization in Meadows. Functional Ecology 31: 458–468.
    DOI: 10.1111/1365-2435.12731

    Kapitoly v knize

    Devetter M., Přikryl I. (2017) Rotifera. In: Hejda R, Farkač J, Chobot K (eds) Červený seznam ohrožených druhů České Republiky. Bezobratlí. Příroda, Praha, 36, 1-612.

    Kvíderová J., Shukla S.P., Pushparaj B., Elster J. (2017) Perspectives of low-temperature biomass production of polar microalgae and biotechnology expansion into high latitudes. In: Margesin R. (ed) Psychrophiles: From Biodiversity to Biotechnology. Springer, Cham, 585-600.
    DOI: 10.1007/978-3-319-57057-0_25

    Ditrich, O.(2017) Zdravotní rizika mokřadů. In: Čížková, Vlasáková, Květ (eds) Mokřady. Episteme, České Budějovice, 515-521

    Knihy abstraktů

    Bernardová A. (ed.) (2017) The Arctic Science Summit Week 2017. Book of Abstracts. CZECH-IN, Praha. ISBN: 978-80-906655-2-1.

  • 2016

    Články

    Bradley J.A., Arndt S., Šabacká M., Benning L.G., Barker G.L., Blacker J.J., Yallop M.L., Wright K.E., Bellas C.M., Telling J., Anesio A.M. (2016) Microbial dynamics in a High Arctic glacier forefield: a combined field, laboratory, and modelling approach. Biogeosciences 13: 5677-5696.
    doi:10.5194/bg-13-5677-2016

    Cepák V., Kvíderová J., Lukavský J. (2016): The first description of snow algae on Mount Olympus (Greece). Nova Hedwigia 103: 457-473.
    doi: 10.1127/nova_hedwigia/2016/0365 

    Elster J., Margesin R., Wagner D., Häggblom M. (2017) Polar and Alpine Microbiology – Earth’s Cryobiosphere. Editorial.  FEMS Microbiology Ecology 93: fiw221, 4p.
    doi: 10.1093/femsec/fiw221

    Elster J., Nedbalová L., Vodrážka R., Láska K., Haloda J., Komárek J. (2016) Unusual biogenic calcite structures in shallow lakes, James Ross Island, Antarctica. Biogeoscience 13: 535-549.
    doi: 10.5194/bg-13-535-2016

    Hodač L., Hallmann, Ch., Spitzer K., Elster J., Fashauer F., Brinkmann N., Lepka D., Diwan, V., Friedl, T. (2016) Widespread green algae Chlorella and Stichococcus exhibit polar-temperate and tropical-temperate biogeography. FEMS Microbiology Ecology, 92: fiw122FEMS, 16p.
    doi: 10.1093/femsec/fiw122

    Kavan J., Ondruch J., Nývlt D., Hrbáček F., Carrivick J.L., Láska K. (2016) Seasonal hydrological and suspended sediment transport dynamics in proglacial streams, James Ross Island, Antarctica. Geografiska Annaler: Series A, Physical Geography.
    doi:10.1080/04353676.2016.1257914

    Krajcarová L., K. Novotný K., Chattová B., Elster J. (2016) Elemental analysis of soils and Salix polaris in the town of Pyramiden and its surroundings (Svalbard). Environmental Science and Pollution Research 23 (10): 10124-10137.
    doi: 10.1007/s11356-016-6213-4

    Kvíderová J., Elster J., Iliev I. (2015): Exploitation of databases in polar research – Data evaluation and outputs. Czech Polar Reports 5(2): 143-159.
    doi: 10.5817/CPR2015-2-13

    Macek P., Prieto I., Macková J., Pistón N., Pugnaire F.I. (2016) Functional plant types drive plant interactions in a Mediterranean mountain range. Frontiers in Plant Science 7: 662. 11p.
    doi: 10.3389/fpls.2016.00662

    Medová H., Koblížek M., Elster J., Nedbalová, L. (2016) Short note: Abundance of aerobic anoxygenic phototrophic bacteria in Antarctic freshwater lakes, James Ross Island, NE Antarctic Peninsula. Antarctic Science 28(2): 101-102.
    doi: 10.1017/S0954102015000590

    Obbels D., Verleyen E., Mano M.-J., Namsaraev Z., Sweetlove M., Tytgat B., Fernandez-Carazo R., De Wever A., D’hondt S., Ertz D., Elster J., Sabbe K., Willems A., Wilmotte A., Vyverman, W. (2016) Prokaryotic and eukaryotic biodiversity patterns in terrestrial habitats of the Sør Rondane Mountains, Dronning Maud Land, East Antarctica. FEMS Microbiology Ecology 92: fiw041, 13p.
    doi: 10.1093/femsec/fiw041

    Pichrtová M., Arc E., Stöggl W., Kranner I., Hájek T., Hackl H. & Holzinger A. (2016) Formation of lipid bodies and fatty acid composition changes upon pre-akinete formation in arctic and Antarctic Zygnema (Zygnematophyceae, Streptophyta) strains. FEMS Microbiology Ecology 92, 9 pp.
    doi: 10.1093/femsec/fiw096

    Pearce D.A., Alekhina I.A., Terauds A., Wilmotte A., Quesada A., Edwards A., Dommergue A., Sattler B., Adams B., Magalhães C.M., Chu W,. Lau M., Cary S.C., Smith D.J., Wall D.H., Eguren G., Matcher G., Bradley J.,De Vera J.P., Elster J., Hughes K.A., Benning L.G., Gunde - Cimerman N., Convey P., Hong S., Pointing S.B., Pellizari V.H., Vincent W.F. (2016) Aerobiology over Antarctica – A new initiative for atmospheric ecology. Frontiers in Microbiology 7: 16, 7p.
    doi: 10.3389/fmicb.2016.00016

    Pichrtová M., Hájek T., Elster J. (2016) Annual development of mat-forming conjugating green algae Zygnema spp. in hydro-terrestrial habitats in the Arctic. Polar Biology 39:1653–1662.
    doi: 10.1007/s00300-016-1889-y

    Pinseel E., Van de Vijver B., Kavan J., Verleyen E., Kopalová K. (2016) Diversity, ecology and community structure of the freshwater littoral diatom flora from Petuniabukta (Spitsbergen). Polar Biology.
    doi: 10.1007/s00300-016-1976-0

    Pouska V., Macek P., Zíbarová L. (2016) The relation of fungal communities to wood microclimate in a mountain spruce forest. Fungal Ecology 21: 1‒9.
    doi: 10.1016/j.funeco.2016.01.006

    Pushkareva E., Johansen J. R. and Elster J. (2016) Polar desert and semidesert soil crust ecosystem; a review of ecophysiological features of cyanobacteria and microalgae. Polar Biology 39: 2227-2240.
    doi: 10.1007/s00300-016-1902-5

    Raabová L., Elster J., Kováčik L. (2016) Phototrophic microflora colonizing substrates of man-made origin in Billefjorden Region, Central Svalbard. Czech Polar Reports 6(1): 21-30.
    doi: 19.5817/CPR2016-1-3

    Ryšánek D., Elster J., Kováčik L., Škaloud P. (2016) Diversity and dispersal capacities of a terrestrial algal genus Klebsormidium (Streptophyta) in polar regions, FEMS Micrologiology Ecology, 92: fiw039, 9p.
    doi: 10.1093/femsec/fiw039

    Tashyreva D., Elster J. (2016) Annual cycles of two cyanobacterial mat communities in hydro-terrestrial habitats of the high Arctic. Microbial Ecology 71 (4): 887-900.
    doi: 10.1007/s00248-016-0732-x

    Tyml T., Kostka M., Ditrich O., Dyková I. (2016) Vermistella arctica n. sp. nominates the genus Vermistella as a candidate for taxon with bipolar distribution. Journal of Eukaryotic Microbiology 63(2):210-219.
    doi: 10.1111/jeu.12270

    Tyml T., Skulinová K., Kavan J., Ditrich O., Kostka M., Dyková I. (2016) Heterolobosean amoebae from Arctic and Antarctic extremes: 18 novel strains of Allovahlkamfia, Vahlkampfia and Naegleria. European Journal of Protistology 56: 119-133.
    doi: 10.1016/j.ejop.2016.08.003

    Vinšová P., Pinseel E., Kohler T.J., Van de Vijver B., Žárský J.D., Kavan J., Kopalová K. (2015) Diatoms in cryoconite holes and adjacent proglacial freshwater sediments, Nordenskiöld glacier (Spitsbergen, High Arctic). Czech Polar Reports 5(2): 122-133.
    doi: 10.5817/CPR2015-2-11

    Vonnahme T.R., Devetter M., Žárský J.D., Šabacká M., Elster J. (2016) Controls on microalgal community structures in cryoconite holes upon high Arctic glaciers, Svalbard. Biogeoscience 13: 659-674.
    doi: 10.5194/bg-13-659-2016

    Kapitoly v knize

    Sabbe K., Obbels D., Vanormelingen P., Strunecký O., Van de Vijver B., Elster J., Wilmotte A., Verlyen E., Vyverman W. (2015) Microbial biodiversity in polar lake ecosystem: why is it different at the North and South Pole? In: Callaghan TV, Savela H (eds) INTERACT, International network for Terrestrial Research and Monitoring in the Arctic. Stories of Arctic Science. DCE – Danish Centre for Environment and Energy, Aarhus University, Denmark, 146-147.

    Knihy abstraktů

    Kavan J., Bernardová A. (eds.) (2016) Polar Ecology Conference 2016. Faculty of Science, University of South Bohemia, České Budějovice, Czech Republic, 134p. ISBN 978-80-7394-594-7.

  • 2015

    Články

    Elsterová J., Černý J., Müllerová J., Šíma R., Coulson S.J., Lorentzen E., Strøm H. & Grubhoffer L. (2015) Search for tick-borne pathogens in the Svalbard Archipelago and Jan Mayen. Polar Research 34: 27466.
    doi: 10.3402/polar.v34.27466

    Iakovenko  N.S.,  Smykla J., Convey P.,  Kašparová E.,  Kozeretska I.A.,  Trokhymets V., Dykyy I.,  Plewka M.,  Devetter M., Duriš Z. & Janko K.  (2015) Antarctic bdelloid rotifers: diversity, endemism and evolution. Hydrobiologia 761 (1): 5-43.
    doi: 10.1007/s10750-015-2463-2

    Kašparová E.,  Van de Putte A.P., Marshall C. & Janko K. (2015) Lifestyle and ice: the relationship between ecological specialization and response to Pleistocene climate change. PloS one 10.11: e0138766.
    doi: 10.1371/journal.pone.0138766

    Komárek J., Bonaldo G. D., Fatima F. M. & Elster J. (2015) Heterocytous cyanobacteria of the Ulu Peninsula, James Ross Island, Antarctica. Polar Biology 38: 475–492.
    doi: 10.1007/s00300/014/1609/4

    Kuchta R., Pearson R., Scholz T., Ditrich O. & Olson P.D. (2014) Spathebothriidea: survey of species, scolex and egg morphology, and interrelationships of a non-segmented, relictual tapeworm group (Platyhelminthes: Cestoda). Folia Parasitologica 61: 331-346.
    doi: 10.14411/fp.2014

    Laanisto L., Sammul M., Kull T., Macek P. & Hutchings M.J. (2015) Trait-based analysis of decline in plant species ranges during the 20th century: a regional comparison between the UK and Estonia. Global Change Biology 21: 2726-2738.
    doi: 10.1111/gcb.12887 

    Peng Y., Macek P., Macková J., Romoleroux K. & Hensen I. (2015) Clonal diversity and fine-scale genetic structure in a high Andean tree-line population. Biotropica 47: 59-65.
    doi: 10.1111/btp.12175

    Pistón N., Armas C., Schöb C., Macek P. & Pugnaire F.I. (2015) Phylogenetic distance among beneficiary species in a cushion plant species explain interaction outcome. Oikos, 124: 1354-1359.
    doi: 10.1111/oik.01979

    Schulz F., Tyml T., Pizzetti I., Dyková I., Fazi S., Kostka M. & Horn M. (2015) Marine amoebae with cytoplasmic and perinuclear symbionts deeply branching in the Gammaproteobacteria. Scientific Reports 5:13381.
    doi: 10.1038/srep13381

    Sklenář P., Kučerová A., Macková J. & Macek P. (2015) Temporal variation of climate in the high-elevation páramo of Antisana, Ecuador. Geografia Fisica e Dinamica Quaternaria 38: 67-78. 

    Stibal M., Gözdereliler E., Cameron K.A., Box J.E., Stevens I.T., Gokul J.K., Schostag M., Žárský J.D., Edwards A. & Irvine-Fynn T.D. (2015): Microbial abundance in surface ice on the Greenland Ice Sheet. Frontiers in Microbiology 6: 225. 
    doi: 10.3389/fmicb.2015.00225. 

    Tashyreva D.,  Elster J. (2015) Effect of nitrogen starvation on desiccation tolerance of Arctic Microcoleus strains (cyanobacteria). Frontiers in Microbiology 6: 278.
    doi: 10.3389/fmicb.2015.00278 

    Vonnahme T.R., Devetter M., Žárský J.D., Šabacká M. & Elster J. (2016) Controls on microalgal community structures in cryoconite holes upon high Arctic glaciers, Svalbard. Biogeosciences Discuss 12: 11751–11795.
    doi:10.5194/bgd-12-11751-2015.

    Kapitoly v knize

    Elster J. & Kvíderová J. (2015) Cyanobacteria. In. Encyclopedia of Astrobiology. M. Gargaud, W. Irvine, (eds). The second modified edition, SpringeR.
    doi: 10.1007/978-3-642-278333-4_378-2

    Hájek T. (2014) Physiological Ecology of Peatland Bryophytes. In: Hanson D.T. & Rice S.K. (eds.): Photosynthesis in Bryophytes and Early Land Plants, Advances in Photosynthesis and Respiration, 37: 233–252.

    Knihy abstraktů

    Kavan J.(ed.) (2015) Současné trendy v českém polárním výzkumu 2015. Sborník abstraktů. Centrum polární ekologie, Přírodovědecká fakulta, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, České Budějovice, 11p.

    Kvíderová J., Tashyreva D., Bernardová A. & Elster J. (eds.) (2015) 6th International Conference on Polar and Alpine Microbiology, Programme and Abstracts. Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice, České Budějovice, 264p.
    ISBN: 978-80-7394-528-2

    Ondruch J., Hrbáček F., Nývlt D. & Láska K. (eds.) (2015): Proceedings: Students in Polar Research Conference 2015. Masarykova univerzita, Brno, p. 54.

  • 2014

    Články

    Anthelme F., Jacobsen D., Macek P., Meneses R. I., Moret P., Beck S. & Dangles O. (2014) Biodiversity patterns and continental insularity in the tropical high-Andes. Arctic. Antarctic and Alpine Research 46: 811-828.
    doi: 10.1657/1938-4246-46.4.811

    Bartošová-Sojková P., Hrabcová M., Pecková H., Patra S., Kodádková A., Jurajda P., Tyml T. & Holzer A.S. (2014) Hidden diversity and evolutionary trends in malacosporean parasites (Cnidaria: Myxozoa) identified using molecular phylogenetics. International Journal for Parasitology 44: 565-577.
    doi: 10.1016/j.ijpara.2014.04.005

    Kodáková A., Dyková I., Tyml T., Ditrich O. & Fiala I. (2014) Myxozoa in high Arctic: Survey on the central part of Svalbard archipelago. International Journal for Parasitology: Parasites and Wildlife 3: 41-56.
    doi:10.1016/j.ijppaw.2014.02.001

    Kuchta R., Pearson R., Scholz T., Ditrich O. & Olson P.D. (2014) Spathebothriidea: survey of species, scolex and egg morphology, and interrelationships of a non-segmented, relictual tapeworm group (Platyhelminthes: Cestoda). Folia Parasitologica 61:331–346.
    doi: 10.14411/fp.2014.040

    Kvíderová J (2014) Sample database of the Centre for Polar Ecology – Database structure and data mamagement. Czech polar Reports 4 (2): 140-148.
    doi: 10.5817/CPR2014-2-14

    Pichrtová M., Hájek T. & Elster J. (2014) Osmotic stress and recovery in field piopulations of Zygnema sp. (Zygnematophyceae, Streptophyta) on Svalbard (High Arctic) subjected to natural dessication. FEMS Miocrobial Ecology 89: 270-280.
    doi:10.1111/1574-6941.12288.

    Pinseel E., Kopalová K., & Van de Vijver B. (2014) Gomphonema svalbardense sp. nov., a new freshwater diatom species (Bacillariophyta) from the Arctic Region. Phytotaxa 170 (4): 250-258.
    doi: 10.11646/phytotaxa.170.4.2

    Těšitel J., Těšitelová T., Bernardová A., Janková-Drdová E., Lučanová M. & Klimešová J. (2014) Demographic population structure and fungal associations of plants colonizing High Arctic glacier forelands, Petuniabukta, Svalbard. Polar Research 33: 20797.
    doi: 10.3402/polar.v33.20797

    Knihy abstraktů

    Kavan J., Bernardová A. (eds.) (2014) Polar Ecology Conference 2014. Abstracts & Contact List. Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice, České Budějovice, 172p.
    ISBN 978-80-7394-463-6.

    Ondruch J, Nývlt D, Láska K, Hrbáček F (eds.) (2014) Sborník abstraktů konference: Současné trendy v českém polárním výzkumu 2014. Masarykova univerzita, Brno, p.17.

  • 2013

    Články

    Hanáček M., Nývlt D. & Nehyba S. (2013) Písečník u Javorníku - drumlin se zachovalou sukcesí subglaciálních a supraglaciálních sedimentů. Geologické výzkumy na Moravě a ve Slezsku 20: 22-29.
    doi: 10.5817/GVMS2013-1-2-22

    Hanáček M., Nývlt D., Flašar J., Stacke V., Mida P., Lehejček J., Tóthová G., Břežný M., Procházková B., Uxa T.  & Křenovská I. (2013) New methods to reconstruct clast transport history in different glacial sedimentary environments: Case study for Old Red sandstone clasts from polythermal Hørbyebreen and Bertilbreen valley glaciers, Central Svalbard. Czech Polar Reports 3 (2): 107-129.
    doi: 10.5817/CPR2013-2-13

    Hindák F., Kvíderová J. & Lukavský J. (2013) Growth characteristics of selected thermophilic strains of cyanobacteria using crossed gradients of temperature and light. Biologia 68(5): 830-837.
    doi: 10.2478/s11756-013-0215-1

    Kopalová K., Nedbalová L., Nývlt D., Elster J. & de Vijver B. V. (2013) Diversity, ecology and biogeography of the freshwater diatom communities from Ulu Peninsula (James Ross Island, NE,  Antarctic Peninsula). Polar Biology 36: 933-948.
    doi: 0.1007/s00300-013-1317-5

    Kvíderová J. & Elster J. (2013) Algal growth potential and/or algal primary production rates of the maritime Antarctic stream’s waters (King George Island, South Shetlands). Polar Research 32: 11191.
    doi: 10.3402/polar.v32i0.11191

    Kvíderová J., Hájek J. & Worland R.M. (2013) The ice nucleation activity of extremophilic algae. CryoLetters 34 (2): 137-148.

    Láska K., Chládová Z., Ambrožová A. & Husák J. (2013) Cloudiness and weather variation in central Svalbard in July 2013 as related to atmospheric circulation. Czech Polar Reports 3(2): 184-195.
    doi: 10.5817/CPR2013-2-19

    Mareš J., Hrouzek P., Kaňa R., Ventura S., Strunecký O. & Komárek, J. (2013) The primitive thylakoid-less cyanobacterium Gloeobacter is a common rock-dwelling organism. PloS one 8: e66323.
    doi: 10.1371/journal.pone.0066323

    Marteinsson V., Vaishampayan P., Kvíderová J., Mapelli F., Medori M., Calfapietra C., Aguilera A., Hamisch D., Reynisson E., Magnússon S., Marasco R., Borin S., Diaz C., Souza-Egipsy V., González-Toril E., Amils R., Elster J. & Hänsch R.A (2013): Laboratory of the Extremophiles: Iceland CAREX field campaign. Life 3: 211-233.
    doi: 10.3390/life3010211

    Nedbalová L., Nývlt D., Kopáček J., Šobr M. & Elster J. (2013) Freshwater lakes of Ulu Peninsula (James Ross Island, NE Antarctic Peninsula): I. Origin, geomorphology and physico-chemical limnology. Antarctic Science 25 (3): 358-372.
    doi: 10.1017/S0954102012000934

    Pushkareva E. & Elster J. (2013) Biodiversity and ecological classification of cryptogamic soil crusts in the vicinity of Petunia Bay, Svalbard. Czech Polar Records, 3 (1): 7-18.
    doi: 10.5817/CPR2013-1-3

    Shukla S.P., Kvíderová J., Tříska J. & Elster J. (2013) Chlorella mirabilis as a potential species for biomass production in low temperature environment. Frontiers in Microbiology 4 (97): 1-12.
    doi: 10.3389/fmicb.2013.00097

    Singh P., Singh S.S., Elster J. & Mishra A.K. (2013) Molecular phylogeny, population genetics and evolution of heterocytous cyanobacteria using nifH gene sequences. Protoplasma 250: 751-764.
    doi: 10.1007/s00709-012-0460-0

    Stacke V., Mida P., Lehejček J., Tóthová G. & Nývlt D. (2013) Recent landscape changes in terminoglacial area of the Nordensköldbreen, central Spitsbergen, Svalbard. Short communication. Czech Polar Reports 3: 3-6.
    doi: 10.5817/CPR2013-1-2

    Strunecký O., Komárek J., Johansen J., Lukešová A. & Elster J. (2013) Molecular and morphological criteria for revision of the genus Microcoleus (Oscillatoriales, Cyanobacteria). Journal of Phycology 49(6): 1167–1180.
    doi: 10.1111/jpy.12128

    Škaloud P., Nedbalová L., Elster J. & Komárek J. (2013) A curious occurrence of Hazenia broadyi spec. nova in Antarctica, and the review of the genus Hazenia (Ulotrichales, Chlorophyceae). Polar Biology 36: 1281-1291.
    doi: 10.1007/s00300-013-1347-z

    Tashyreva D., Elster J. & Billi D. (2013) A novel staining protocol for multiparameter assessment of cell heterogeneity in Phormidium populations (Cyanobacteria) employing fluorescent dyes. Plos One, 8/2: 1-12.
    doi: 10.1371/journal.pone.0055283

    Kapitoly v knize

    Elster J. & Komárek, J. (2013) Život v moři. In: Prošek P. a kol: Antarktida. Academia, Praha, 132-135.

    Elster J., Komárek J. & Nedbalová L. (2013) Biodiverzita sinic a řas. In: Prošek P. a kol: Antarktida. Academia, Praha, 303-311.

    Elster J., Komárek J. & Nedbalová L. (2013) Sinice a řasy. In: Prošek P. a kol: Antarktida. Academia, Praha, 88-101.

    Gloser J. & Nedbalová L. (2013) Bezobratlí živočichové. In: Prošek, P. a kol.: Antarktida. Academia, Praha, 117-119.

    Nedbalová L. (2013) Zooplankton. In: Prošek, P. a kol.: Antarktida. Academia, Praha, pp. 135-137.

    Nedbalová L. (2013) Bakterie. In: Prošek, P. a kol.: Antarktida. Academia, Praha, 133.

    Nedbalová L. (2013) Větší bezobratlí živočichové. In: Prošek, P. a kol.: Antarktida. Academia, Praha, 137-142.

    Nedbalová L. & Prošek P. (2013) Kytovci. In: Prošek, P. a kol.: Antarktida. Academia, Praha, 149-155.

    Nedbalová L. & Prošek P. (2013) Ploutvonožci. In: Prošek, P. a kol.: Antarktida. Academia, Praha, 145-148.

    Pavel V. & Weidinger K. (2013) Ptáci a jejich biodiverzita. In: Prošek P. a kol: Antarktida. Academia, Praha, 119-129.

    Pavel V. & Weidinger K. (2013) Avifauna ostrova Jamese Rosse. In: Prošek P. a kol: Antarktida. Academia, Praha, 322-326.

  • 2012

    Články

    Barták M., Váczi P. & Hájek J. (2012) Photosynthetic activity in three vascular species of Spitzbergen vegetation during summer season in response to microclimate. Polish Polar Research 33 (4): 443-462.
    doi: 10.2478/v10183-012-0018-z

    Bernardová A. & Košnar J. (2012) What do Holocene sediments in Petuniabukta, Svalbard reveal? Polish Polar Research 33 (4): 329-346.
    doi: 10.2478/v10183-012-0023-2

    Bohuslavová O., Šmilauer P. & Elster J. (2012) Usnea lichen community biomass estimation on volcanic mesas, James Ross Island, the Antarctica. Polar Biology 35: 1563-1572.
    doi: 10.1007/s00300-012-1197-0.

    Elster J., Kvíderová J., Hájek T., Láska K. & Šimek M. (2012) Impact of warming on Nostoc colonies (Cyanobacteria) in a wet hummock meadow, Spitzbergen. Polish Polar Research 33 (4): 395-420.
    doi: 10.2478/v10183-012-0021-4

    Elster J. & Rachlewicz G. (2012) Petuniabukta, Billefjorden in Svalbard: Czech-Polish long term ecological and geographical research. Polish Polar Research 33 (4): 289-295.
    doi: 10.2478/v10183−012−0024−1.

    Klimešová J., Doležal J., Prach K. & Košnar J. (2012) Clonal growth forms in Arctic plants and their habitat preferences: a case study from Petuniabukta, Spitsbergen. Polish Polar Research 33 (4): 421-442.
    doi: 10.2478/v10183-012-0019-y

    Klimešová J., Prach K. & Bernardová A. (2012) Using available information to assess the potential effects of climate change on vegetation in the High Arctic - North Billjefjorden, central Spitsbergen (Svalbard). Ambio 41 (5): 435-445.
    doi: 0.1007/s13280-011-0235-4

    Komárek J., Kováčik Ľ., Elster J. & Komárek O. (2012) Cyanobacterial diversity of Petunia-Bukta, Billefjorden, central Svalbard. Polish Polar Research 33 (4): 347-368.
    doi: 10.2478/v10183−012−0024−1.

    Kopalová K., Veselá J., Elster J., Nedbalová L., Komárek  J. & Van de Vijver B. (2012) Diatom communities in seepages and streams on James Ross Island (NW Weddell Sea, Antarctica). Plant Ecology and Evolution 145 (2): 190-208.
    doi: 10.5091/plecevo.2012.639

    Kvíderová J. (2012): Research on cryosestic communities in Svalbard: the snow algae of temporary snowfields in Petuniabukta, Central Svalbard. Czech Polar Reports 2 (1): 8-19.

    Láska K., Witoszová D. & Prošek P. (2012) Weather patterns of the coastal zone of Petuniabukta (Central Spitsbergen) in the period 2008–2010. Polish Polar Research 33 (4): 297-318.
    doi: 10.2478/v10183-012-0025-0

    Prach K., Klimešová J., Košnar J., Redcheko O. & Hais M. (2012) Variability of contemporary vegetation around Petuniabukta, central Svalbard. Polish Polar Research 33 (4): 383-394.
    doi: 10.2478/v10183-012-0026-z

    Prach K. & Rachlewicz G. (2012) Succession of vascular plants in front of retreating galciers in central Spitzbergen. Polish Polar Research 33 (4): 319-328.
    doi: 10.2478/v10183-012-0022-3

    Segečová J., Elster J. & Kováčik Ľ. (2012): Effects of exposition to various stress conditions on filamentous green alga Klebsormidium (Streptophyta) strains, isolated from both polar regions and Slovakia. Acta Botanica Universitatis Comenianae Vl. 47: 19-26.

    Stibal M., Šabacká, M.  & Žárský J. (2012) Biological processes on glacier and ice sheet surfaces. Nature Geoscience 5 (11): 771-774.
    doi: 10.1038/ngeo1611

    Strunecký O., Elster J. & Komárek J. (2012) Molecular clock evidence for survival of Antarctic cyanobacteria 1 (Oscillatoriales, Phormidium autumnale) from Paleozoic times. FEMS Microbial Ecology 82: 482-490.
    doi: 10.1111/j.1574-6941.2012.01426.x

    Strunecký O., Komárek J. & Elster J. (2012) Biogeography of Phormidium autumnale (Oscillatoriales, Cyanobacteria) at western and central Svalbard. Polish Polar Research 33 (4) 369-382.
    doi: 10.2478/v10183−012−0020−5.

    Váczi P., Barták M., Nedbalová L. & Elster J. (2012) Comparative analysis of temperature courses in Antarctic lakes of different morphology: Study from James Ross Island, Antarctica. Czech Polar Reports 1 (2): 78-87.

    Kapitoly v knize

    Raabová L., Elster J. & Kováčik Ľ (2012) Niektoré dominantné cyanobakterie a riasy osídľujúce akvatické a hydroterestrické biotopy zátoky Petuniabukta na Svalbarde v Arktidě. In Študentská vedecká konferencia PriF UK. Zborník recenzovaných prispevkov. Univerzita Komenského 573-578.
    ISBN 978-80-233-3213-2.

    Segečová J., Elster J. & Kováčik, Ľ (2012) Stresová rezistencia jednodruhových kmeňov kultúr vláknitej zelenej riasy z rodu Klebsormidium (Streptophyta) izolovaných z polárnych oblastí a zo Slovenska. In Študentská vedecká konferencia PriF UK. Zborník recenzovaných prispevkov, Universita Komenského 600-605.
    ISBN 978-80-233-3213-2.

    Tashyreva D. & Elster J. (2012) Production of dormant stages and stress resistance of polar cyanobacteria.  In: Hanslmeier A., Kempe S. & Seckbach J (eds.): Life on Earth and other Planetary Bodies. Springer, 367-386.
    doi: 10.1007/978-94-007-4966-5_21.

    Knihy abstraktů

    Bernardová A., Kavan J. & Strunecký O. (eds.) (2012) Polar Ecology Conference, Abstracs. Faculty of Science, University of South Bohemia in České Budějovice.
    ISBN 978-80-7394-375-2

  • 2011

    Hanáček M., Flašar J. & Nývlt D. (2011) Sedimentary petrological characteristics of lateral and frontal moraine and proglacial glaciofluvial sediments of Bertilbreen, Central Svalbard. Czech Polar Reports 1: 11-33.

    Klimešová J. & Doležal J. (2011) Are clonal plants more frequent in cold environments than elsewhere? Plant Ecology and Diversity 4: 373-378.
    https://doi.org/10.1080/17550874.2011.586734

    Klimešová J., Doležal J. & Sammul M. (2011) Evolutionary and organismic constraints on the relationship between spacer length and environmental conditions in clonal plants. Oikos 120: 1110-1120.
    https://doi.org/10.1111/j.1600-0706.2011.19332.x

    Kvíderová J., Elster J. & Šimek, M. (2011) In situ response of Nostoc commune s.l. colonies to desiccation, in Central Svalbard, Norwegian High Arctic. Fottea 11(1): 87-97.

    Segečová J., Elster J. & Kováčik Ľ. (2011) Filamentous green alga Klebsormidium flacidum as a laboratory model for the study of dormancy. Acta Botanica Comenianae, Vol. 46: 49-53.

    Shukla S.P., Kvíderová J. & Elster, J. (2011) Nutrient requirements of polar Chlorella-like species. Czech Polar Reports 1: 1- 10.

    Strunecký O., Elster J. & Komárek, J. (2011) Taxonomic revision of the fresh-water cyanobacterium „Phormidium“ murrayi = Wilmottia murrayi.  Fottea 11(1): 57-71.

    Taton A., Wilmotte A., Šmarda J., Elster J. & Komárek J. (2011) Plectolyngbya hodgsonii – a remarkable filamentous cyanobacterium from Antarctic lakes; comparison with related cyanobacterial types. Polar Biology 34: 181-191.
    DOI: 10.1007/s00300-010-0868-y

    Kapitoly v knize

    Elster, J. & Kvíderová, J. (2011) Cyanobacteria. In: Gargaud M., Amils R., Quintanilla J.C., Cleaves H.J., II, Irwine W.M., Pinti D.L. & Viso M. (eds.): Encyclopedia of Astrobiology. Springer, 394-397.
    doi: 10.1007/978-3-642-11274-4

    Květ J. & Elster J. (2011) Josef Svoboda. In: S. Štrbáňová a A. Kostlán, eds., Sto českých vědců v exilu, Encyklopedie významných vědců z řad pracovníků Československé akademie věd v emigraci. Academia, Praha, 509-513.
    ISBN 978-80-200-1915-5

    Kvíderová J. (2011) Biofilm. In: Gargaud M., Amils R., Quintanilla J.C., Cleaves H.J., II, Irwine W.M., Pinti D.L. & Viso M. (eds.): Encyclopedia of astrobiology. Springer, 170-171.
    doi: 10.1007/978-3-642-11274-4

    Segečová J., Elster J. & Kováčik, Ľ. (2011) Študium dormancie na kmeňových kultúrach vláknitej zelenej riasy z rodu Klebsormidium izolovaných z polárných oblastí a zo Slovenska. Študentská vedecká konferencia PriF UK, Biólogia 682-688.
    ISBN: 978-80-223-3013-8

Číst dál …Publikace

  • Přečteno: 3384

Projekty

Centrum polární ekologie

Seznam probíhajících a již ukončených projektů řešených na CPE

  • Mezinárodní projekty

    2022 – 2025, Origin of resistance to desiccation and cryoinjuries in biological soil crust microalgae of High Arctic.
    Deutsche Forschungsgemeinschaft (DFG) and GAČR.
    22-08680L

    2021 – 2023   The terrestrial Ecology Flagship in Ny-Ålesund: reinforcement and futher development – activities for 2021-2023.
    Norwegian Polar Institute (NO),  Rijksuniversiteit Groningen (NL), Ghent University (BE), University of Tromsø - The Arctic University of Norway (NO), National Institute of Polar Research (JP) National Research Council of Italy (IT), JU (CZ) a Adam Mickiewicz University (PL)
    Svalbard Science Forum – ES610235.

    2021 – 2024  EU-PolarNet 2 Co-ordinating and Co-designing the European Polar Research Area 
    H2020-LC-CLA-2020-1

    2015-2027   Nutrient Network Petunia site
    JU (CZ) a Estonian University of Life Sciences (EE)
    (RiS ID 10812)

  • Národní projekty

    20232027 Migrace zvířat v měnícím se světě – Přesuny za reprodukcí do vyšších zeměpisných šířek: stále výhodná strategie nebo maladaptivní chování?
    JU (CZ)
    MŠMT ERC-CZ 317-LL2412

    20232025 SoWaFUN - Ekologie hub na rozhraní půda-voda
    JU (CZ) a Ústav půdní biologie BC AV ČR (CZ)
    GAČR 23-06429S

    20222025 Glaciální ekosystémy: od tropů k pólům
    JU (CZ)
    GAČR 22-26348S

    2022-2024 Unikátní společenstvo ledovcových želvušek a vířníků v evolučním, fyziologickém a ekologickém kontextu
    Ústav živočišné fyziologie a genetiky AV ČR (CZ), Ústav půdní biologie BC AV ČR (CZ) a JU (CZ
    GAČR 22-28778S

  • Ukončené projekty

Číst dál …Projekty

  • Přečteno: 1072

Výzkumné skupiny

Centrum polární ekologie

  • Algologie a biotechnologie

    Algologie:

    • Molekulární diverzita, ekologie a biogeografie sinic a řas polárních oblastí
    • Funkční vlastnosti sinic a řas polárních oblastí
    • Úloha sinic a řas v jednotlivých biotopech a vztahy mezi jednotlivými složkami ekosystémů
    • Biotechnologické využití sinic a řas polárních oblastí

    Výzkum algologické skupiny začíná popisem druhové diverzity sinic a řas, které jsou studovány ve všech typech terestrických biotopů. V daných biotopech pak probíhá měření základních faktorů prostředí (fyzikálně-chemické parametry půdy a vody, denní průběhy teplot, záření, průhlednosti, pH, koncentrace kyslíku, konduktivita, atd.).

    Pro taxonomické určení jednotlivých druhů řas a sinic se kombinuje klasické mikroskopické pozorování s daty získanými ze sekvencí DNA. Ekofyziologické vlastnosti polárních sinic a řas jsou zjišťovány pomocí terénních měření i laboratorních experimentů. Terénní experimenty na Svalbardu jsou zaměřeny například na sledování fotosyntetické aktivity, fixace dusíku, studium tvorby dormantních stádií sinic a řas či na studium fotochemických procesů v různých typech biotopů. Laboratorní experimenty se zaměřují na určení ekofyziologických požadavků jednotlivých druhů a detailní studium jejich reakcí na různé ekologické faktory.

    Od roku 2009 probíhají na Svalbardu na několika lokalitách experimenty s otevřenými skleníčky (Open Top Chambers, OTC), kde se sleduje vliv mírného oteplení a změny vlhkosti půdy na společenstva sinic a řas a na rychlost dekompozice vybraných biotopů. V důsledku zvyšování teplot v Arktidě dochází k rozvoji využívání přírodních zdrojů v polárních oblastech a rozvoji lidských sídel. Pro snížení důsledků lidské činnosti na polární ekosystémy (např. eutrofizace vod) a zvýšení efektivity využívání místních zdrojů (př. chov ryb) bude třeba vyvinout řadu nových technologií, z nichž některé budou založeny na využívání původních mikroorganismů.  Algologická skupina již provedla první testy pro výběr biotechnologicky zajímavých kmenů a otestovala možnost kultivace v nízkých teplotách.

    Algologická skupina spolupracuje s celou řadou pracovišť, například s ústavy Biologického centra Akademie věd ČR, Karlovou univerzitou či s Kolínskou univerzitou v Německu.

    Složení skupiny: Josef ElsterJana Kvíderová, Eva Hejduková, Oleksandr Bren, Anastasiia Kolomiiets

  • Polární mikrobiální ekologie

    Naše skupina se zabývá cykly uhlíku, dusíku ve spojitosti se složením a fungováním mikrobiálních společenstev a jejich vztahy s dalšími organismy v ekosystémech jako je tundra, tajga, pevninské ledovce, jezera.

    Hlavním cílem naší skupiny je:

    • zlepšit odhady organického uhlíku a dusíku v kryosolích (půdy ovlivněné permafrostem) se zaměřením na euroasijskou Arktidu
    • pochopit zranitelnost těchto zásob uhlíku v budoucím klimatu
    • vylepšit stávající modely, aby bylo možné lépe předpovídat reakce permafrostu na budoucí klimatické podmínky
    • popis fungování mikrobiálních společenstev v extrémních arktických podmínkách

    Zajímá nás především, jak se působením přirozených vlivů (tání permafrostu) mění fungování těchto ekosystémů, tedy rychlosti přeměn uhlíku a živin a jejich ztráty z ekosystému, druhová a funkční diverzita půdního mikrobiálního společenstva a vztahy mezi půdou a vegetací.

    Zaměřujeme se především na popis mikroorganismů jak z hlediska jejich diverzity tak i funkce. Mikrobiální společenstva zahrnují všechny tři domény života (bakterie, archae a eukaryota). Z toho vyplývá, že studium takto komplexního systému je velmi složité a představuje pro vědce nemalou výzvu. V posledních deseti letech se v půdní mikrobiologii stále více uplatňují nové genetické a molekulárně biologické techniky (PCR, sekvenování, atd.). Právě ty nám umožňují lépe popsat procesy a mikroorganismy za ně zodpovědné v složitém půdním prostředí. Umožňují studovat vzájemné komplexní interakce mezi organismy. Na tyto nové metody se zaměřuje naše laboratoř molekulární biologie.

    Znalost chemického a mikrobiologického složení organické hmoty a procesů, jak je uhlík stabilizován, je nezbytná k předpovědi rozsahu a časového měřítka, v němž bude SOC remobilizován z rozmrzajícího permafrostu při změně klimatu.

    Dlouhodobě spolupracujeme s ústavy Biologického centra Akademie věd ČR, a se zahraničními univerzitami v Helsinkách, Hannoveru, Vídni a v Uppsale. Tato spolupráce otevírá našim studentům možnost vycestovat na zahraniční stáž na některou ze spřátelených univerzit.

    Složení skupiny: Jiří Bárta, Muhammad Waqas, Marria Dimova, Monika Strejčková, Simona Zelenková, Sára Turková, Annika Schmidinger, Laura Nosková, Jonas Pröger, Marie Šabacká

  • Parazitologie

    Parazitologie a infekční biologie

    • Studium životních cyklů motolic čeledi Opecoelidae z plžů Buccinium spp.a čeledi Gymnophalidae z mlžů Mya truncata a Hiatella arctica.

    • Studium životních cyklů dalších helmintů ryb a mořských bezobratlých živočichů.

    • Vyšetřování tkání a orgánů vybraných bezobratlých i obratlovčích hostitelů s cílem histologických studií parazitů ze skupin Apicomplexa, Myxozoa, Microsporidia, Ciliata a izolace amfizoických améb.

    • Mapování biodiverzity litorálních biocenóz
    • Střevní paraziti suchozemských savců a ptáků.
      Vyšetření trusu pomocí klasických koprologickýchi metod a molekulárních analýz. Zvláštní pozornost je věnována parazitům polárních lišek (Vulpes lagopus) a ledních medvědů (Ursus maritimus), jakož i parazitům introdukovaných savců (hraboši Microtus levis a psi).

    • Pátrání po arbovirech a viru ptačí chřipky
      Komáři Aedes nigripes (larvy a dospělé samice) a klíšťata Ixodes uriae jsou pomocí molekulárních metod vyšetřována na přítomnost arbovirů. Orofaryngeální a kloakální výtěry jakož i trus vybraných ptačích druhů jsou testovány na přítomnost virů chřipky. Protilátky proti viru ptačí chřipky byly nalezeny v sérech racků tříprstých (Rissa tridactyla).

    Složení skupiny: Oleg Ditrich

  • Zoologie

    Ornitologie

    Ornitologická skupina má široké pole působnosti. Jejich výzkum se zaměřuje mimo jiné na:

    • Evoluční ekologii
    • Dopady a adaptace na změnu klimatu a lidskou činnost,
    • Populační dynamiku a demografii,
    • Predaci, interakci predátor-kořist,
    • Migraci, behaviorální ekologii,
    • Role pohlaví, páření a rodičovství,
    • Významné ptačí oblasti a ochranu přírody.

    Při našem výzkumu kombinujeme data ze tří různých zdrojů - data přímo získaná naším týmem v terénu s využitím detailní metodologie a experimentálních návrhů; data shromážděná podle jednotných postupů, stejných pro více než 40 spolupracujících týmů po celém světě a data získaná z publikací a online zdrojů.

    Nejprve identifikujeme klíčové klimatické změny, lidský tlak a další faktory ovlivňující míru přežití, stejně tak i globální populační trendy volně žijicích zvířat s využitím nejnovějších demografických modelů. Dále zkoumáme prostorové a časové změny v životní historii, populační dynamice a sociálním chování. To nám umožňuje sledovat historické vzorce a nedávné dopady změny klimatu a lidského tlaku na volně žijící zvířata v rychle se měnícím světě. Také klademe důraz na ochranářské důsledky našeho výzkumu - naše vědecké výstupy jsou šířeny mezi ochránce přírody, zákonodárce a širokou veřejnost v různých zemích, abychom propagovali nové specifické postupy ochrany přírody, zmírňující dopad nedávných změn životního prostředí.

    Složení skupiny: Vojtěch Kubelka, Guillaume Dillenseger, Kateřina Kubelková, Miguel Angelo Silva Monteiro a Andreas Rimoldi

    Odkazy:

    ÉLVONAL Shorebird Science

Číst dál …Výzkumné skupiny

  • Přečteno: 2757

Archeobotanická letní škola v Ochridu, Severní Makedonie

Laboratoř archeobotaniky a paleoekologie

Archeobotanická letní škola v Ochridu, Severní Makedonie

Archeobotanická letní škola v Ochridu, Republika Severní Makedonie jako součást mezinárodního výzkumného projektu Frontier Studies

doba trvání: 2019-současnost

Archeobotanická letní škola má již delší tradici. Jejím hlavním smyslem je spojení přírodovědy s archeologií, speciálně s obory archeobotaniky. V tomto duchu jsou studenti botaniky a archeologie obou fakult (PřF a FF JČU) trénovaní přímo v rámci několika výzkumných projektů, v tomto případě v rámci Frontier Studies.

ochrid_img_0292

Frontier Studies je mezinárodní výzkumný project, zaměřený na město Ochrid a jeho okolní krajinu a prostředí. Je situován na severní břeh stejnojmenného jezera v hraniční oblasti Albánie a Severní Makedonie. Od doby zahájení v roce 2017 bylo výzkumné úsilí definováno spoluprácí mezi Univerzitou Karlovou v Praze (Marek Verčík, ÚKAR FF UK) a Archeologickým muzeem ve Skopje (Pero Ardjanljev), od roku 2019 také s Českou geologickou službou (Jan Hošek) a Jihočeskou univerzitou v Českých Budějovicích (LAPE). Cílem první výzkumné sezóny, podpořené konáním letní školy archeobotaniky JČU, byl extenzivní terénní průzkum historické krajiny a výzkum dynamiky sídelních struktur regionu, zachycených ve vývojovém sledu.

Úkolem letní archeobotanické školy v tomto projektu je získat a poskytnout především archeobotanická data, sloužící k vysvětlení krajinně ekologických otázek, soustředěných na historická mikroprostředí, zajímavá pro popis vegetace v jednotlivých fázích vývoje pravěkého a starověkého osídlení. Specifickým cílem je take vytvoření referenční database pro další rekonstrukce.

ochrid_dsc1502

V prvním roce projektu se účastníci letní školy podíleli na testování několika lokalit (Trebeniste, Grasinca I/II, Daljan, Gorno Lakocerej- Tri topoli, Bobansko ezero) a to prostřednictvím geologických sond bagrem nebo vrtnou soupravou. Byly vzorkovány tyto čtyři locality. Vzorky byly podrobeny analýze rostlinných makrozbytků, dřeva a uhlíků, radioarbonovému datováním AMS, analýze pylu a dalším metodám…

Už nyní poskytly analýzy zajímavé výsledky. Nejenom jsme překvapení přítomností nákolního sídliště z Grašnice (z doby pozdní antiky), ale především evidencí organické vrstvy z mladší doby bronzové na bázi geologické sondy, jejíž existence pod mocným jezerním sedimentem svědčí o významné tektonické události. Analýzy, které se provádějí, potvrzují datování keramických fragment do závěru mladší doby bronzové. Také však zachycují stav krajiny v závěru prehistorické periody, kdy bylo centrální sídliště v Ochridu obklopenou vodou jezera a pobřežních lagun.

ochrid_dsc1634

ochrid_img_0170

Začala letní archeobotanická škola v makedonském Ochridu

Zpět na Vědu a výzkum

Číst dál …Archeobotanická letní škola v Ochridu, Severní Makedonie

  • Přečteno: 8656

Antrakologie

  • Seznam štítků: PŘF

Laboratoř archeobotaniky a paleoekologie

Antrakologie

Analýza rostlinných makrozbytků dřev je prováděna metodou antrakologie, která se aplikuje na nespálené i spálené fragmenty. V nedávné době se v archeobotanice vyčlenil obor výzkumu zuhelnatělých fragmentů dřev, který nese souborný název antrakologie.
Mikroskopické určování dřev a uhlíků patří ke standardním postupům archeobotaniky. Nálezy fragmentů nespáleného dřeva a uhlíků tvoří viditelnou a nápadnou frakci archeologických uloženin a situací. Informují nás především o skladbě paliva, které bylo na archeologické lokalitě spotřebováváno. Na základě analýzy větších souborů uhlíků lze vytvořit antrakologický snímek archeologické lokality, který nás poměrně podrobně informuje o okolní stromové vegetaci v době života sídliště, o procesech odlesňování okolí sídliště atp. Při analýze uhlíků ze žárových pohřebišť lze sledovat i některé kulturní prvky využití různých druhů dřev. Xylotomická analýza nespálených fragmentů dřev ze středověkých nalezišť městského typu může poskytnout cenné údaje o charakteru, případně i typu řemeslné výroby. v určitých případech sleduje xylotomická analýza druh a charakter dřevěných konstrukcí.

podelny_rez_uhlikem_lipy_tilia_sp

Podélný řez uhlíkem lípy (Tilia sp.). Foto J. Beneš.

Jaké soubory jsou vhodné pro analýzu?

Pro analýzu uhlíků a dřev se hodí především větší soubory (100 a více určení), tedy takové soubory, se kterými je možné pracovat statisticky. Je také kvalitativní rozdíl mezi uhlíky vybíranými archeologickým pracovníkem z výplní objektů a vrstev a plaveným materiálem. Obecně platí, že plavený materiál zachycuje druhy dřev reprezentativněji a v bohatším spektru, než materiál vybíraný (nevýhodu může vyvažovat větší množství vybraných uhlíků z lokality). z hlediska botanické taxonomie lze většinu uhlíků a dřev určovat do botanického rodu. Například botanický rod jedle, Abies, je v našich ekologických podmínkách zastoupen pouze jediným druhem a to jedlí bělokorou (Abies alba).
Do botanického druhu sice lze některé dřeviny zařadit ale velmi obtížně. Pro prezentaci výsledků archeologické veřejnosti se používá pojem "druh dřeva", chápaný však spíše technologicky.

3d_seminar_mikrofotografie_jaromira_benese_na_rimske_univerzite_p70531

3D seminář mikrofotografie Jaromíra Beneše (vlevo) na Římské univerzitě La Sapienza. Foto L. Sadori.

Co můžeme pomocí antrakologie zjistit?

Na několika studovaných lokalitách (neolitické Bylany, Lovosice doby železné) byl dokonce zachycen vývoj od přirozeného lesa v okolí k mozaice prosvětlených ploch. Ve Starých Prachaticích v Pošumaví byla v roce 1997 prozkoumána laténská polozemnice. z její výplně pochází zhruba 500 určitelných uhlíků. Jejich analýza prokázala postupné ovlivňování okolní vegetace a změny ve struktuře palivového dříví v měřítku desítiletí.
Jako příklad analýzy nespálených dřev můžeme jmenovat výplně hlavního a odvodňovacího příkopu v Praze v ulici Na příkopě. Zde byla například prokázána přítomnost blízké řemeslnické dílny, produkující jedlový odpad.

podelny_rez_uhlikem_smrku_picea_sp

Podélný řez uhlíkem smrku (Picea sp.). Foto J. Beneš

Pedoantrakologie

Dlouhodobá dynamika dřevinné sklady lesní vegetace (v měřítku tisíciletí a století)  může být spolehlivě odhalena pomocí pedoantrakologické analýzy, tj. analýzy uhlílů z půdních horizontů. Uhlíky se totiž hojně nacházejí i v půdách, kde není zachován pyl. Je to způsobeno tím, že uhlíky na rozdíl od jiných organických zbytků se za přístupu nerozkládají. Proto jsou uhlíky vhodné k rekonstrukci dřevinné skladby lesa a požárových historií (např. Poschlod & Baumann, 2010; Touflan et al. 2010; Novák et al. 2012).

tracheje_uhliku_javoru_acer_sp

Tracheje uhlíku javoru (Acer sp.). Foto J. Beneš

Literatura:

Novák J., Sádlo J. & Svobodová-Svitavská H. (2012): Unusual vegetation stability in a lowland pine forest area (Doksy region, Czech Republic). The Holocene 22: 947–955.

Poschlod, P., Baumann, A. 2010: The historical dynamics of calcareous grasslands in the central and southern Franconian Jurassic mountains: a comparative pedoanthracological and pollen analytical study. The Holocene 20: 13-23.

Touflan, P., Talon, B., Walsh, K., 2010. Soil charcoal analysis: a reliable tool for spatially precise studies of past forest dynamics. A case study in the French Southern Alps.The Holocene 20, 45–52

Zpět na Vědu a výzkum

Číst dál …Antrakologie

  • Přečteno: 9256

Přihlaste si
odběr newsletteru

Zůstaňme v kontaktu na
sociálních sítích

Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Branišovská 1645/31a, 370 05 České BudějoviceTel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

© 2024 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Cookies

1

0