RNDr. Alena Krejčí, Ph.D.

vedoucí Laboratoře včelí biologie

Přírodovědecká fakulta JU
Branišovská 31, 37005 České Budějovice
budova B, přízemí, číslo dveří 192
 
Email: Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.
Tel. +420 387772270

ORCID ID: 0000-0001-7589-4035 

• Aktivní člen místní pobočky Českého svazu včelařů a zájmový včelař (15 včelstev).
• Spoluvedoucí experimentálního a výukového včelstva v Biologickém centru v Českých Budějovicích (30 včelstev).
• Populárně naučné přednášky o včelách pro studenty a veřejnost
• Televizní a rozhlasové pořady o včelách, rozhovory v novinách
• Aktuální grant Technologické agentury ČR na protivirové účinky přírodních ingrediencí v chovu včel.
• Spolupráce s Katedrou robotiky a vestavěných systémů Jihočeské univerzity - návrh úlové tématiky, senzorů teploty a CO₂, analýza obrazu pomocí neuronových sítí a strojového učení

• Školitel 2 úspěšně obhájených doktorandů (plus 1 píšícího), 4 magisterských studentů a 14 bakalářských studentů.

• Kurz molekulární biologie (bakalářské studium)
• Kurz vývojové biologie (bakalářské studium)

• Bruce Krejčí A, Krištůfek V: Mravenčí trápení (Tha ant's sorrow). Moderní včelař (Modern Beekeeper) 03, 34-35, 2022.
• Bruce Krejčí A, Svobodová K, Krištůfek V: Testování kvality vosku stanovením jeho teploty tuhnutí (Testing the wax quality by assesing its setting temperature). Moderní včelař (Modern Beekeeper) 02, 16-18, 2022.
• Krištůfek V, Bruce Krejčí A, Svobodová K, Chalupský J: Snižují houby virózy a úmrtnost včel? (Do mushrooms lower virus loads and mortality of honey bee colonies?)  Moderní včelař (Modern Beekeeper) 06, 28-30, 2021.
• Urajová P., Krištůfek V., Bruce Krejčí A: Kyselina para-kumarová a výživa včel (Para-coumaric acid and bee nutrition). Moderní včelař (Modern Beekeeper) 07, 28-30, 2020.
• Perez-Gomez R, Perez-Gomez R, Magnin V, Mihajlovic Z, Slaninova V and Krejci A: Downregulation of respiratory complex I mediates major signalling changes triggered by TOR activation. Scientific Reports 10, 4401, 2020.
• Mihajlovic Z, Tanasic D, Bajgar A, Perez-Gomez R, Steffal P, Krejci A: Lime is a new protein linking immunity and metabolism in Drosophila. Developmental Biology 452(2):83-94, 2019.
• Krejci A, Tennessen JM.: Metabolism in time and space - exploring the frontier of developmental biology. Development 144(18):3193-3198, 2017.
• Horvath M, Mihajlovic Z, Slaninova V, Perez-Gomez R, Moshkin Y, Krejci A: The silent information regulator 1 (Sirt1) is a positive regulator of the Notch pathway in Drosophila. Biochemical journal 473(22):4129-4143, 2016.
• Slaninova V, Krafcikova M, Perez-Gomez R, Steffal P, Trantirek L, Bray SJ and Krejci A: Notch stimulates growth by direct regulation of genes involved in the control of glycolysis and the tricarboxylic acid cycle. Open Biology, 2016 Feb;6(2)., 2016. doi: 10.1098/rsob.150155.
• Housden BE, Fu AQ, Krejci A, Bernard F, Fischer B, Tavare S, Russell S, Bray SJ: Transcriptional Dynamics Elicited by a Short Pulse of Notch Activation Involves Feed-Forward Regulation by E(spl)/Hes Genes. Plos Genetics, 9(1):e1003162, 2013.
• Djiane A, Krejci A, Bernard F, Fexova S, Millen K, Bray SJ.: Dissecting the mechanisms of Notch induced hyperplasia.  EMBO Journal 32, 60 - 71, 2013. doi:
• Endo K, Karim MR, Taniguchi H, Krejci A, Kinameri E, Siebert M, Ito K., BraySJ, Moore AW: Chromatin modification of Notch targets in olfactory receptor neuron diversification. Nature Neuroscience, 15(2):224-33, 2012. doi: 10.1038/nn.2998.
• Terriente-Felix A, Li J, Collins S, Mulligan A, Reekie I, Bernard F, Krejci A,  Bray SJ: Notch co-operates with Lozenge/Runx to lock hemocytes into a differentiation programme. Development, 140(4):926-37, 2013. doi: 10.1242/dev.086785
• Bernard F, Krejci A, Housden B, Adryan B, Bray SJ: Specificity of Notch pathway activation: twist controls the transcriptional output in adult muscle progenitors. Development, 137(16):2633-42, 2010. doi: 10.1242/dev.053181
• Krejci A*, Bernard F*, Housden BE*, Collins S, Bray SJ.: Direct response to Notch activation: signaling crosstalk and incoherent logic. Science Signal.,2(55), 2009. doi:10.1126/scisignal.2000140
• Narasimha M, Uv A, Krejci A, Brown NH, Bray SJ.: Grainy head promotes expression of septate junction proteins and influences epithelial morphogenesis. J Cell Sci. 2008. doi: 10.1242/jcs.019422
• Goodfellow H*, Krejcí A*, Moshkin Y*, Verrijzer CP, Karch F, Bray SJ.: Gene-specific targeting of the histone chaperone asf1 to mediate silencing. Dev Cell.13(4):593-600, 2007.PMID: 17925233
• Krejci A and Bray S: Notch activation stimulates transient and selective binding of Su(H)/CSL to target enhancers.  Genes Dev. 21(11):1322-7, 2007. PMID: 17545467
• Bruce AW, Krejci A, Ooi L, Deuchars J, Wood IC, Dolezal V, Buckley NJ. :The transcriptional repressor REST is a critical regulator of the neurosecretory phenotype. J Neurochem. 98(6):1828-40, 2006. PMID: 16945103
• Nagel AC, Krejci A, Tenin G, Bravo-Patino A, Bray S, Maier D, Preiss A. : Hairless-mediated repression of notch target genes requires the combined activity of Groucho and CtBP corepressors. Mol Cell  Biol. 25(23):10433-41, 2005. PMID: 16287856
• Jakubik J, Krejci A, Dolezal V: Asparagine, valine, and threonine in the third extracellular loop of muscarinic receptor have essential roles in the positive cooperativity of strychnine-like allosteric modulators. J Pharmacol Exp Ther. 313(2):688-96, 2005.
• Krejci A, Bruce AW, Tucek S, Dolezal V, Buckley NJ: Multiple promoters drive tissue specific expression of the human M₂ muscarinic acetylcholine receptor gene. J Neurochem. 91(1):88-98, 2004.
• Tucek S, Krejci A, Lysikova M, Jakubik J, Dolezal V: Roles of external loops of muscarinic receptors in interactions between N-methylscopolamine and allosteric modulators. In Cholinergic mechanisms: Function and disfunction. Ed. I. Silman, 71-76, 2004.
• Krejci A, Michal P, Jakubik J, Ricny J, Dolezal V: Regulation of signal transduction at M₂ muscarinic receptor. Physiol. Res., 53, suppl.1:S131-40, 2004.
• Krejci A, Tucek S: Quantitation of mRNAs for M₁ to M₅ subtypes of muscarinic receptors in rat heart and brain cortex. Mol Pharmacol.  61(6):1267-72, 2002.
• Krejci A, Tucek S: Changes of cooperativity between N-methylscopolamine and allosteric modulator alcuronium and gallamine induced by mutations of external loops of muscarinic M₃ receptors. Mol. Pharmacol. 60 : 761-767, 2001.

Oborové rady DSP

Studium v doktorských studijních programech (DSP) probíhá pod vedením školitelek a školitelů podle Individuálního studijního plánu (ISP) studujícího. Za odbornou úroveň daného programu doktorského studia odpovídá oborová rada (OR), jejíž členy jmenuje a odvolává děkan po schválení vědeckou radou fakulty, a to nejvýše na dobu platnosti akreditace daného studijního programu. OR má nejméně pět členů a je složena z významných odbornic a odborníků daného oboru.

Mezi činnosti a kompetence OR patří mimo jiné příprava přijímacího řízení, iniciace a koordinace programu přednášek, seminářů a dalších forem studia, schvalování a určování požadavků na ISP studujících a témata disertačních prací, kontrola činnosti studujících, školitelek a školitelů, podávání návrhu o úpravě stipendií a ukončení studia děkanovi, určování požadavků ke státním doktorským zkouškám a řešení specifických případů.

Předsedkyní nebo předsedou OR jsou garanti doktorského studijního programu, a může jimi být pouze docent nebo profesor jmenovaný v oboru, který odpovídá danému studijním programu nebo programu blízkého nebo příbuzného obsahového zaměření, a který v daném oboru v posledních pěti letech vykonával vědeckou činnost. Garant musí mít plný pracovní úvazek na PřF JU. Předsedkyně nebo předseda OR mimo jiné zodpovídá za činnost oborové rady, přípravu materiálů pro akreditaci studijního programu, komunikuje opatření fakulty/univerzity týkající se dokt. studia školitelkám a školitelům a řeší specifické případy.
Podrobné informace o organizaci a činnostech oborové rady najdete v opatření děkana D62 – O organizaci studia v doktorských studijních programech na PřF JU.

V souladu se Stipendijním řádem JU je podpora pro daný kalendářní rok vyplácena ve formě stipendia za vynikající výzkumné, vývojové a inovační, nebo další tvůrčí výsledky přispívající k prohloubení znalostí studentům doktorského stupně studia, kteří splňují následující podmínky:

• Student je v prezenční formě studia 2. a vyššího ročníku školen kmenovým zaměstnancem* PřF JU

• Student během předchozího ročníku splnil všechny povinnosti stanovené ISP a výroční zpráva byla oborovou radou hodnocena stupněm “A”

• Studium nepřesáhlo standardní dobu studia, tj. 4 roky

O výši stipendia na každý kalendářní rok rozhoduje děkan. Pro rok 2024 je stanovena na
3000 Kč měsíčně a stipendium lze vyplácet zpětně.

V Českých Budějovicích, 20.2.2024

doc. RNDr. Eva Nováková, PhD.
proděkanka pro doktorská studia

*statut kmenového zaměstnance určuje děkan PřF JU

Vedoucí laboratoře: Mgr. Michaela Fencková, Ph.D.

Lucie Hrádková (technický asistent, lab manager)

Tereza Koníková (technický asistent, vědecký pracovník)



Pavla Nedbalová (postdoc)
Maria Constanza Gonzalez Ramirez (postdoc)

Petra Havlíčková (PhD student)
Anna Koutská (PhD student)

Lukáš Martínek (Mgr student)
Matyáš Suchý (Mgr student)

Aneta Medková (Bc student)
Anna Vápeníková (Bc student)
Sera Gruber (Bc student)

CO DĚLÁME

Studujeme geny důležité pro kognitivní funkce a zkoumáme, jak mohou jednotlivé genetické defekty vést k dramatickým a závažným neurovývojovým poruchám, jako je mentální postižení (ID) nebo autismus (porucha autistického spektra, ASD).

 JAK TO DĚLÁME

Do genů ovocné mušky drozofily zavádíme ekvivalentní mutace, které se vyskytují u jedinců s ID nebo ASD. V závislosti na typu mutace používáme různé přístupy, například RNA interferenci (k napodobení ztráty funkce), nadměrnou expresi (k napodobení zisku funkce) nebo úpravu genomu pomocí CRISPR/Cas9 (k modelování missense a variant specifických pro pacienta).

U genetického modelu octomilky se kontrolují kognitivní fenotypy. Zaměřujeme se hlavně na habituaci, konzervovanou formu učení, kterou jsme shledali relevantní pro ID a ASD. Během habituace postupně slábne reakce na opakované irelevantní podněty. Ty jsou odfiltrovány a náš mozek se může soustředit na důležité věci. Typickým příkladem je schopnost naučit se ignorovat zvuk tikajících hodin. Habituace chrání náš mozek před informačním přetížením a je nutná pro vyšší kognitivní funkce, jako je paměť. Lze ji hodnotit jak u jedinců s ID/ASD, tak u jejich drozofilích modelů, což ji činí vhodnou pro zkoumání mechanismů onemocnění a cílů pro léčbu.

Více informací o genetice, molekulární kontrole a klinickém významu habituačního učení si můžete přečíst v našem review.

Stejně jako si lidský mozek zvyká = habituuje se na tikání hodin, mohou octomilky potlačit svou skokovou reakci na opakování podnětu vypínání světla. Zpočátku jej vnímají jako nebezpečí a reagují skokem. Po několika opakováních se naučí, že jim to nijak neškodí, a přestanou skákat. Mouchy s habituačním deficitem nejsou schopny potlačit reakci a pokračují ve skákání, jako na videu níže. Náš habituační test se proto nazývá habituace na zhasnutí světla. Pomocí tohoto testu můžeme otestovat 24 much za méně než 30 minut.

Používáme nástroje buněčné a časově specifické (Gal4 a split-Gal4, TARGET) k určení neuronových substrátů a vývojového původu genově specifického habituačního deficitu a genetických interakcí k identifikaci dysfunkčních drah a cílů léčby. Zabýváme se také biologií synapsí, protože habituace souvisí se synaptickou funkcí (viz příklad zde). K určení účinku chybějících variant defektů habituace nebo variant specifických pro pacienta používáme strukturní modelování a molekulární analýzy. Nakonec se pokoušíme deficity korigovat pomocí léků specifických pro daný mechanismus.

PROČ JE TO DŮLEŽITÉ

ID a ASD jsou závažné a souběžně se vyskytující neurovývojové poruchy. ID/ASD mají většinou monogenní příčiny - jsou způsobeny mutacemi v jednotlivých genech. K dnešnímu dni známe >1500 takových genů. Představují možnost nahlédnout do biologických drah a cílů léčby, ale jejich studium na málo výkonných modelech, jako jsou laboratorní myši, by trvalo příliš dlouho. Je třeba vytvořit vysoce výkonný model. Drozofila je skvělou příležitostí, protože má velkou genetickou konzervovanost (75 % genů nemocí lze nalézt i u octomilek), high-throughput kompatibilitu a účinné nástroje pro vytváření mutací a analýzu molekulárních mechanismů. Díky high-throughput light-off jump habituaci můžeme posoudit to, co je nejdůležitější - kognitivní funkce. Zavedené postupy habituace u lidí usnadní převedení těchto poznatků do léčebných studií.