Laboratoř vývojové epigenetiky a bioinformatiky
Laboratoř vývojové epigenetiky a bioinformatiky
Laboratoř byla založena v roku 2023. Studujeme nemodelové druhy savců s cílem objasnit evoluci a molekulární (hlavně epigenetické) mechanismy samičí plodnosti u dlouhověkých druhů na úrovni oocytů, jejich ovariální niky a úspěšného embryonálního vývoje.
Vedoucí skupiny: Mgr. Lenka Gahurová, Ph.D. (roz. Veselovská)
Členové laboratoře
-
Lenka Gahurová
vedoucí skupiny
-
Eva Kopecká
technik, vědecký pracovník
-
Nikolas Tolar
Ph.D. student
-
Minh Triet Le
Ph.D. student
-
Alyssa Malapit Fontanilla
Ph.D. student
-
Eliška Bláhová
Mgr. student
-
Jakub Kořenář
Mgr. student
-
Michaela Kazíková
Bc. student
-
Pavlína Chudá
Bc. student
-
Lenka Ošmerová
Bc. student
-
Anja Drobnjak
Bc. student
-
Vilja Langer
Bc. student
-
Laura Andessner-Angleitner
Bc. student
Výzkum
Savčí oocyty (=samičí vajíčka) jsou založeny během samičího embryonálnmího vývoje jako konečná populace. Jsou nevyhnutné pro pokračování druhu, ale zároveň jedny z nejstarších buněk v těle – u dlouhověkých druhů, jako je člověk, můžou být stare i několik dekád. Oocyty si udržují svojí kvalitu po velmi dlouhý čas, déle než většina jiných buněk, ale i tak je samičí plodnost jedna z prvních fyziologických funkcí, které přestávají správně fungovat v důsledku stárnutí – s věkem se snižuje kvantita a kvalita oocytů a to negativně ovlivňuje následný embryonální vývoj.
Samičí plodnost a biologie oocytů jsou většinou studovány na myši, klasickým modelovým druhu pro savce. Myši jsou ale plodné méně než 12 měsíců a nemůžou proto spolehlivě rekapitulovat procesy u dlouhověkých druhů, které jsou plodné několik desítek let. Množství studií take ukázalo že mechanismy objevené u myši se často liší od mechanismů pozorovaných u jiných druhů.
Na co se ptáme:
(1) Jaké jsou molekulární mechanismy podílející se na dlouhověké kvalitě oocytů, a co se může pokazit? Jak je kvalita a kvantita oocytů ovlivněna jejich ovariální nikou a fyziologickými procesy v ováriích (jako např. ovulacemi)?
(2) Jak dynamický vztah mezi hostitelským genomem a transpozony ovlivňuje biologii oocytů, reprogramování mezi oocytem a embryem, a embryonální vývoj? Mění se během stárnutí matky?
Co děláme:
Používáme různé genomické, transkriptomické a epigenomické metody sekvenování a metody pokročilé mikroskopie a studujeme tak oocyty, vaječníky a embrya několika dlouhověkých i krátkověkých druhů hlodavců z různých fylogenetických skupin, zejména africké rypoše, morčata, coruro, slepce a myši.
Číst dál …Laboratoř vývojové epigenetiky a bioinformatiky
- Přečteno: 18082
