Katedra biologie ekosystémů (Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity) je zodpovědná za doktorský program Biologie ekosystémů. Tento program je zaměřen na studium procesů na úrovni celých ekosystémů, tj. na toky hmoty, energie a informací mezi jejich jednotlivými kompartmenty. Program je vysoce interdisciplinární a propojuje ekologii rostlin a živočichů v suchozemském i vodním prostředí. Inovativní metody výzkumu, jako je sekvenování nové generace, stabilní izotopy, stechiometrie, mezokosmové experimenty a mnoho dalších jsou přístupné každému žadateli. Velký důraz je kladen na experimentální přístup, schopnost studentů navrhovat, analyzovat a hodnotit experimenty. Výzkum doktorských prací je často prováděn v úzké spolupráci s Biologickým centrem AV ČR, v.v.i. a Botanickým ústavem AV ČR, v.v.i..
Absolventi jsou připraveni pro vedoucí a řídící místa v institucích zaměřených na biologický a ekologický výzkum a management. Mohou najít uplatnění ve výzkumných a vzdělávacích institucích, na univerzitách, v ústavech aplikovaného výzkumu v zemědělství, lesnictví a ochraně přírody, v muzeích, institucích státní a veřejné správy, v komerčních organizacích, i v neziskových organizacích v oblasti životního prostředí.
Předpokládaná uplatnitelnost absolventů na trhu práce:
- Vědecko-výzkumný nebo vědecko-pedagogický pracovník vysokých škol a výzkumných ústavů, muzeí.
- Pracovník orgánů státní správy různých stupňů, především řídicí funkce odborných sekcí státní správy (RŽP, MŽP).
- Pracovník orgánů ochrany přírody (Agentura ochrany přírody a krajiny, Správy Národních parků a Chráněných krajinných oblastí, ČIŽP, atd.).
- Samostatný odborný pracovník tuzemských i zahraničních agentur pro regionální rozvoj, životní prostředí, fondy EU atd..
- Podnikatelská sféra – manager v oblasti environmentální problematiky, firemní ekolog, poradce pro environmentální problematiku (projekty, expertní posudky), pracovník servisních ekologických laboratoří
- Pracovník neziskových organizací v oblasti životního prostředí.