Skip to main content

PRF

Napsáno od Eva Smolkova dne . Zveřejněno v PRF.

Mobility2: Rozvoj JU – Mezinárodní Mobility II

Přírodovědecká fakulta, Jelínek Petr
01/01/2020 – 30/06/2023
MŠMT OPVVV 02-18-053


Mobility2 (CZ.02.2.69/0.0/0.0/18_053/0016975)
Název CZ: Rozvoj JU – Mezinárodní Mobility II
Název EN: Development of USB – International Mobilities II
Koordinátor: Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Řešitel: Přírodovědecká fakulta, Jelínek Petr
Realizace: 01/01/2020 – 30/06/2023
Rozpočet: 21 997 393,00 Kč (projekt): 20 897 523,35 Kč (dotace MŠMT) + 1 099 869,65 Kč (5% spolufinancování JU)
7 379 194,00 Kč (PřF): 7 010 234,30 Kč (dotace MŠMT) + 368 959,70 Kč (5% spolufinancování PřF)
Poskytovatel: Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy ČR (MŠMT)
Program: Operační program Výzkum, vývoj a vzdělávání (OPVVV) 02_18_053

www

Abstrakt

Mobilita je zaměřena na založení a rozvoj nových výzkumných programů usilujících o zodpovězení klíčových ekologických, evolučních či vývojových otázek. Příchozí mobilitou se obohatí a rozšíří stávající výzkumné aktivity PřF, bude se sdílet nové know-how, implementují se nové metody a techniky, podpoří se mezioborový přístup a spolupráce. Nejcennějším výstupem příchozí mobility bude integrace tří excelentních výzkumníků do struktury PřF, zavedení nových výzkumných směrů, podání a získání navazujících výzkumných grantů, vznik nových nezávislých výzkumných skupin. Od příchozích seniorních postdoků se očekává velká míra nezávislosti, aktivity, kreativity a inovativnosti řešit vlastní výzkumné otázky. Pozice postdoků budou obsazeny v otevřeném mezinárodním výběrovém řízení daném evropskými standardy HR Award.

Cíle

Cílem projektu je získání tří nadějných seniorních postdoků s předchozí zkušeností na prestižní zahraniční výzkumné instituci. Zkušení postdoci přinesou na PřF nové zkušenosti, know-how, techniky, metodiky a přístupy a především vlastní výzkumné programy zaměřené na ekologické, evoluční či vývojové aspekty biologických procesů. Příchozí mobilita zvýší internacionalizaci PřF.

Výstupy

  • Příjezd juniorského postdoktorského výzkumníka na PřF (24 měsíců): Segrestin Jules
  • Příjezd juniorského postdoktorského výzkumníka na PřF (24 měsíců): Janda Martin
  • Příjezd juniorského postdoktorského výzkumníka na PřF (12 měsíců)
  • Výjezd THP zahraniční oddělení na University of Finland (3 dny)
  • Výjezd THP propagační oddělení na University of Finland (4 dny)
  • Výjezd THP propagační oddělení na University of Finland (4 dny)

Číst dál …Mobility2: Rozvoj JU – Mezinárodní Mobility II

  • Přečteno: 3568

Napsáno od Eva Smolkova dne . Zveřejněno v PRF.

INTERACT3: International Network for Terrestrial Research and Monitoring in the Arctic

Pechar Jan, Polární stanice
01/01/2020 – 31/12/2023
EC, H2020-INFRAIA-2019-1, ID 871120

INTERACT 3 (ID 871120)
Název CZ: Mezinárodní síť pro pozemní výzkum a monitorování v Arktidě
Název EN: International Network for Terrestrial Research and Monitoring in the Arctic
Řešitel: Pechar Jan, Polární stanice
Realizace: 01/01/2020 – 31/12/2023
Rozpočet:  1.120.937,50 CZK (PřF)
Poskytovatel: Evropská komise
Program: H2020-MSCA-ITN-2020
www

Abstrakt

Planeta Země čelí bezprecedentním změnám životního prostředí, které ovlivní všechny členy společnosti. Oteplování arktického klimatu je více než dvojnásobné oproti globálnímu tempu a nepředvídatelné extrémní události mají velký dopad na ekosystémy a lidi. Cirkulace arktické atmosféry však způsobuje extrémní události a společenské škody za Arktidou, které vyžadují mezinárodní výzkum a monitorování, aby bylo možné pochopit a předvídat. Kromě toho je třeba změnit postoje po celém světě prostřednictvím dosahu, zatímco další generace musí být vybavena pro život v jiném světě. INTERACT III inovuje panarktickou síť 86 výzkumných stanic v 16 severních zemích, aby poskytoval služby pro 155 globálních a regionálních sítí. Globální pověst INTERACT navíc přilákala přední světové partnery a podniky, aby se podíleli na snižování dopadů nebezpečných změn a zároveň maximalizovali příležitosti vyplývající z nových technologií. Konkrétně INTERACT III zajišťuje komplexní koordinaci 64 partnerů a 86 výzkumných stanic. Manažeři stanic navrhují osvědčené postupy, aby zajistili vynikající výzkum, monitorování, vzdělávání a dosah. INTERACT III staví na mimořádně úspěšném programu nadnárodního přístupu, který již zaplnil Artic 900 výzkumnými pracovníky, aby dále poskytoval vynikající vědu a zároveň omezoval ekologické stopy výzkumných pracovníků zlepšením vzdáleného a virtuálního přístupu. Nadnárodnost přístupu zajišťuje novou spolupráci, inovativní vědu a vědeckou diplomacii v době zvýšeného geopolitického napětí. Manažeři stanic, nadnárodní přístup a společné výzkumné aktivity spolupracují na řešení hlavních společenských výzev v plně integrované infrastruktuře, zatímco jejich data a porozumění jsou globálně zpřístupněny prostřednictvím mimořádného dosahu a vzdělávání a politických brífinků pro osoby s rozhodovací pravomocí.

Cíle

Výstupy

Číst dál …INTERACT3: International Network for Terrestrial Research and Monitoring in the Arctic

  • Přečteno: 2805

Napsáno od Eva Smolkova dne . Zveřejněno v PRF.

IMMUNETREH: Trehalóza jako zdroj pro nadřazenou imunitu v drozofile

Kazek Michalina, Katedra molekulární biologie a genetiky
01/01/2020 – 12/02/2023
EC, H2020-WF-01-2018, ID 867430

IMMUNETREH (ID 867430)
Název CZ: Trehalóza jako zdroj pro nadřazenou imunitu v drozofile
Název EN: Trehalose as a source for privileged immunity in Drosophila
Řešitel: Kazek Michalina
Mentor: Doležal Tomáš, Katedra molekulární biologie a genetiky
Realizace: 01/01/2020 – 12/02/2023
Rozpočet: 156 980,64 EUR (PřF)
Poskytovatel: EC, H2020-WF-01-2018
www

Abstrakt

Imunitní odpověď je energeticky náročný proces a imunitní buňky musí mít privilegovaný přístup k energii / živinám. Zatímco u savců je tohoto privilegovaného přístupu dosaženo např. na inzulínu nezávislém transportéru glukózy, jak je toho dosaženo u hmyzu není známo. Hostitelská laboratoř získala předběžné výsledky naznačující, že privilegovaného přístupu imunitních buněk octomilek k živinám lze dosáhnout použitím trehalózy místo glukózy. Je velmi dlouho známo, že primárním cukrem v hmyzu je trehalóza, ale že tento sacharid by mohl hrát důležitou roli v privilegovaném přístupu imunity ke zdrojům studováno dosud nebylo. Cílem tohoto projektu je proto otestovat, zda aktivované imunitní buňky octomilky přednostně absorbují trehalózu a přeměňují ji na glukózu intracelulárně, a jsou tedy nezávislé na systémové regulaci sacharidů, a jak důležité by to bylo pro efektivní imunitní odpověď. Projekt je založen na multidisciplinárních přístupech, kdy budou tkáňové specifické genetické nástroje použity k manipulaci metabolismu in vivo za účelem studia imunitní odpovědi pomocí technik molekulární biologie, vývojové biologie a imunologie a nejmodernějších metabolických přístupů. Cílem výzkumného pracovníka je naučit se používat genetiku octomilky a modely infekce dobře zavedené v hostitelské laboratoři a kombinovat je se svými odbornými znalostmi z fyziologie hmyzu, buněčných kultur a zejména metabolomiky.

Cíle

  • Chov a disekce octomilek.
  • Genetika octomilek včetně genetických křížení a různých genových manipulací.
  • Analýza genové exprese specifické pro tkáně / buňky / transkripty (zahrnuje použítí FlyBase).
  • Imunologie octomilek a modely infekce parazitoidními vosičkami a bakteriemi.
  • Aplikace biologie 13C a kombinace genetických manipulací s metabolomickou analýzou.
  • Soft skills – psaní návrhů a publikací a prezentace (zkušenosti školitele a prezentace na konferencích a seminářích fakulty, laboratorní schůzky), mentoring (práce se studenty v hostitelské laboratoři).

Výstupy

Číst dál …IMMUNETREH: Trehalóza jako zdroj pro nadřazenou imunitu v drozofile

  • Přečteno: 2904

Napsáno od Eva Smolkova dne . Zveřejněno v PRF.

ELIXIR-CZ: Česká národní infrastruktura pro biologická data

Vohnout Rudolf, Katedra informatiky
01/01/2020 – 31/12/2022
MŠMT, Výzkumné infrastruktury


ELIXIR-CZ (LM2018131)
Název CZ: Česká národní infrastruktura pro biologická data
Název EN: Czech National Infrastructure for Biological Data
Koordinátor: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v.v.i.
Partneři: Biologické centrum AV ČR, v. v. i., Biotechnologický ústav AV ČR, v. v. i., CESNET, zájmové sdružení právnických osob, České vysoké učení technické v Praze, Fakultní nemocnice u sv. Anny v Brně, Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích, Masarykova univerzita, Mikrobiologický ústav AV ČR, v. v. i., Univerzita Karlova, Univerzita Palackého v Olomouci, Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i., Vysoká škola chemicko-technologická v Praze, Západočeská univerzita v Plzni
Řešitel: Vohnout Rudolf, Katedra informatiky
Realizace: 01/01/2020 – 31/12/2022
Rozpočet: 146 845 000 Kč (projekt) / 6 283 000 Kč (PřF)
Poskytovatel: MŠMT
Program: Výzkumné infrastruktury

www.elixir-czech.cz

Abstrakt

Elixír CZ je velká významná infrastruktura v oblasti věd o živé přírodě zaměřená na biologická data, jejich zpracování, uchovávání, sdílení a analýzu. Český uzel ELIXIR reprezentovaný ÚOCHB AV ČR jako národní uzel pro bioinformatiku, který zahrnuje pokročilé výpočetní prostředí, vyhrazené datové sbírky a jedinečné nástroje poskytované komunitě pro vědu o živé přírodě. Uzel je vytvořen a provozován jako distribuovaná infrastruktura, která v současné době zahrnuje čtrnáct organizací. Partnerské instituce poskytují českým vědcům a mezinárodní vědecké komunitě nástroje a databáze v režimu otevřeného přístupu. Jedním z partnerů je i Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích.

Cíle

  • Poskytování služeb s nimi souvisejících nástrojů a databáze, a to na excelentní úrovni se zaměřením na bioinformatickou a Life Science uživatelskou komunitu v ČR a Evropě včetně podpory těchto nástrojů.
  • Zaměření se na nové disciplíny věd o živé přírodě generující data a nově vznikajících uživatelských komunit.
  • Poskytování řešení pro unifikovaný přístup k datům dodržováním a aplikací FAIR principů.
  • Aplikace principů pro unifikovanou správu dat a zajištění nástrojů pro generování Data managementu plánu na úrovni jak národní, tak evropské.
  • Propojení dat a nástrojů.
  • Tvorba nástrojů datové strategie a její aplikace v heterogenním národním prostředí.
  • Nedílnou součástí Node je specializované výpočetní a úložné prostředí spravované významnými národními akademickými poskytovateli cloud / grid a odrážející skutečné potřeby České republiky v Evropském měřítku a na úrovni ELIXIR Hub.
  • Důležitým rysem navrhovaného uzlu ELIXIR je těsné propojení a spolupráce s infrastrukturními projekty ESFRI v České republice – zejména INSTRUCT, EATRIS, BBMRI, EuroBioimaging a EU-OPENSCREEN a další.

Výstupy

Spojení mezi národními a celoevropskými výzkumnými strukturami ve třech silných oblastech:
1) Nejpokročilejší a nejrozvinutější oblast patří do oblasti strukturní bioinformatiky se zaměřením především na služby a vývoj konkrétních nástrojů. Strukturální oblast bioinformatiky je velmi úzce spojena s českými partnery pro IT infrastrukturu výzkumu - konkrétně CESNET a CERIT SC, které poskytují nejen výpočetní a úložnou kapacitu, ale také know-how v oblasti sítí a využívání heterogenních zdrojů.
2) Druhou největší oblast představují kurátorované databáze ve dvou hlavních oblastech - specifické sbírky genomových údajů o mikroorganismech a rostlinách a databáze cheminformatiky, které slouží také jako propojovací prvek mezi dalšími projekty biomedicínské infrastruktury, jako jsou EU-OPENSCREEN a EATRIS.
3) V neposlední řadě jsou IT specializovaná řešení pro infrastrukturu ELIXIR vyvíjena IT partnery a jejich zapojení do dalších projektů ELIXIR CZ představuje společnou platformu pro sjednocení a efektivitu celého procesu. Uzel slouží také jako koordinační platforma národních bioinformatických aktivit a je zodpovědný za jednotnost dat, aplikaci standardů ELIXIR a za celosvětovou přístupnost v celém výzkumném prostoru v České republice.

Číst dál …ELIXIR-CZ: Česká národní infrastruktura pro biologická data

  • Přečteno: 3335

Další články …

Přihlaste si
odběr newsletteru

formulář pro odběr

Zůstaňme v kontaktu na
sociálních sítích

Přijímací zkoušky

Studium

Věda & výzkum

Přihlásit se

Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

Branišovská 1645/31a, 370 05 České BudějoviceTel. 387 776 201 | Tato e-mailová adresa je chráněna před spamboty. Pro její zobrazení musíte mít povolen Javascript.

© 2024 Jihočeská univerzita v Českých Budějovicích
Cookies

1

0