DOIs (Digital Object Identifier) provide a persistent and unique identifier for datasets. DOIs remain stable, ensuring long-term access to the data.
By assigning a DOI to a dataset, researchers can easily cite it in their publications, just like they would cite a journal article or a book. DOIs increase the visibility and discoverability of datasets by making them easily searchable and citable.
Many funding agencies and publishers now require researchers to make their datasets publicly available and assign DOIs to facilitate data sharing and reuse.
There are various methods to acquire a globally unique persistent identifier:
1. Publishing into an existing public repository is usually the best option for most types of data. This is because the repository will assign a globally unique persistent identifier. Generic repositories (such as Zenodo, Figshare) use versioning DOI to update a public dataset or document.
2. Create your own DOI which involves registering your content with a DOI registration agency or a DOI service provider. Some well-known DOI registration agencies include CrossRef, DataCite, mEDRA.
For more information on persistent identifiers, visit PID Forum.
Metadata provides essential details about the content, structure, and characteristics of the data, facilitating its discovery, interpretation, and use.Generating metadata in a machine-readable format makes your data more FAIR (Findable, Accessible, Interoperable, Reusable).
ELIXIR is an intergovernmental organization that brings together life science resources from across Europe. These resources include databases, software tools, training materials, cloud storage and supercomputers.
ELIXIR aims to coordinate these resources across Europe so that researchers can more easily find, analyze and share data, exchange expertise, and implement best practices. This allows them to gain greater insights into how living organisms work.
Why ELIXIR is needed?
To manage the huge increase in life science data.
To deal with the increasing complexity of data.
To make it easier to find the right tools and training.
To build a more robust bioinformatics infrastructure.
To drive innovation and industry usage.
ELIXIR CZ is dedicated to the organization, storage, sharing and facilitation of interoperability of life-science data for further processing and analysis. The teams of experts develop and operate a wide range of tools, maintain specialized databases of biological data from diverse research areas across life sciences, and provide e-infrastructure services.
The Data Steward position at the Faculty of Science aims to assist in managing research data. The primary responsibilities involve data management, data governance, and data policy enforcement.
How can a Data Steward assist you?
Managing metadata, providing thorough documentation, creation of Data Management Plan (DMP) to support effective data management which has been a mandatory part of Horizon, GAČR and TAČR projects.
Implementing the FAIR principles, focusing on findability, accessibility, interoperability, and reusability.
Assist in storing research data in a trusted repository such as Figshare, Dryad, Zenodo, or university's data repository. These repositories enable public access and long-term preservation.
Making your research data available under an appropriate license, which defines the degree of publicity and rights to use your data.
For assistance with research data and management, please contactMSc. Manali DasatThis email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Workplace: Building C (Faculty of Science, Room Number-00055)
Office Hours:Monday (10:00 AM- 6:00 PM), Wednesday (10:00 AM -6:00 PM), Thursday (10:00 AM - 6:00 PM)
Is low-quality data hindering your research?
The key issues are reliability, accuracy, completeness and relevance.
Data that lacks metadata or explanation about how it was collected, processed, or interpreted.
Data that does not adhere to established standards or protocols.
Data collected without proper consent or in violation of privacy laws and regulations.
High quality research data avoids these pitfalls. Good quality data facilitate reproducibility and reuse by providing organized raw data along with comprehensive supplemental documentation.
Provide access to the raw, granular data from observations, surveys, sensors, etc.
Use widely-compatible, non-proprietary, and machine-readable file formats that can be utilized by others.
Data is formatted in a standardized, consistent, and structured manner.
Contains detailed contextual documentation and descriptive variable labels/codebooks to allow others to interpret the data.
Katedra chemie nabízí uchazečům několik studijních programů zaměřených na chemii korespondujících s výzkumným zaměřením katedry, čímž je zajištěná jednak vysoká kvalita výuky a současně i rozsáhlé možnosti pro práci studentů v rámci kvalifikačních prací. Ve všech studijních programech včetně bakalářských jsou vyžadovány praktické kvalifikační práce, díky čemu získávají studenti praktické zkušenosti přímo v laboratořích při řešení vědeckých problémů, kterými se zabývají jednotlivé vědecké skupiny. Bakalářské práce jsou primárně zaměřené na to, aby se studenti naučili a do hloubky procvičili různé laboratorní metody, které využijí k získání vědeckých dat. Absolventi mají díky tomu větší šance najít si odpovídající zaměstnání, popř. pokračovat v navazujícím magisterském studiu, kde můžou stavět na svých zkušenostech a rozvíjet zvolené téma diplomové práce; v této souvislosti je dobré zmínit, že magisterské práce studentů jsou mnohokrát součástí vědeckých publikací, kde jsou studenti spoluautory.
Garant: doc. RNDr. Martin Kabeláč, Ph.D.
V bakalářském studijním programu Chemie získá student přehled v různých chemických oblastech (obecná, anorganická, organická, fyzikální, analytická chemie a biochemie), které může dále rozvíjet ve specializovanějších navazujících magisterských programech.
Neustále se snažíme vylepšovat studijní programy tak, aby reflektovaly vývoj v oboru i požadavky společnosti. I proto do bakalářského programu Chemie postupně doplňujeme další volitelné předměty zaměřené například na molekulární biologii, biostatistiku, imunologii a jiné medicínské obory.
Studium chemie na Přírodovědecké fakultě Jihočeské univerzity nabízí studentům jedinečnou možnost kombinace dynamicky se rozvíjející chemie, vynikající biologické výzkumné a vzdělávací základny a příjemného a přátelského studijního a pracovního prostředí. Katedra disponuje nejmodernějšími přístroji, s kterými můžete pracovat již od bakalářského studia, což je jedna výhod studia na naší katedře a fakultě. Výzkumné zaměření katedry zahrnuje obory biochemie, strukturní biologie, environmentální a analytické chemie, počítačového modelování v chemii a biochemii, aplikované biochemie v biomedicíně, hmotnostní spektrometrie, biologického výzkumu na úrovni jednotlivých molekul a studiu fotosyntetických procesů a struktur.
Kromě bakalářského odborně zaměřeného studijního programu Chemie nabízí katedra i bakalářský studijní program Chemie pro vzdělávání a ve spolupráci s Johannes Kepler University v rakouském Linzi také přeshraniční double-degree program Biological Chemistry (v angličtině). Absolventi bakalářského studia mohou dále studovat v navazujících programech Biochemie, Chemie životního prostředí a přeshraničním joint-degree programu Biological Chemistry (v angličtině) a posléze v doktorském studijním programu Biochemie.
Informace o studiu
Povinné předměty
1. ročník
V 1. ročníku vám nejdříve řekneme něco o tom, jak to na vysoké škole funguje, jaká jsou různá pravidla a termíny, které musíte sledovat a také vás naučíme pracovat s informacemi tak, abyste je mohli rychle a jednoduše vyhledávat.
Předměty: Úvod do studia a života na VŠ, Práce s informačními zdroji
Získáte dále první informace z odborné chemie – anorganické a obecné chemie.
Předměty: Anorganická chemie I+II, Obecná chemie
Jelikož práce v laboratoři je důležitou součástí studia a v praxi i práce chemika, při různých praktických cvičeních si procvičíte základy práce v laboratoři a následně i aplikujete vědomosti z přednášek při specificky zaměřených praktických cvičeních.
Předměty: Chemická laboratorní technika, Chemické výpočty a názvosloví anorganické chemie, Laboratorní cvičení z anorganické chemie, Obecná chemie pro chemiky – praktikum
Pro pochopení chemie jsou nezbytné základy i dalších vědních oborů, ze začátku především matematiky.
Jelikož jsou bakalářské práce prakticky zaměřené, budete na jejich vypracování dostatečný čas. Proto vám již v letním semestru 1. ročníku představíme možná témata bakalářských prací i zaměření jednotlivých vědeckých skupin – z kterých si budete moci vybrat a případně již v 1. ročníku začít pracovat v laboratoři.
Předměty: Chemický seminář pro 1. ročník
2. ročník
V 2. ročníku si budete prohlubovat znalosti v jednotlivých oblastech chemie
Současně budete nabyté znalosti aplikovat při práci v laboratořích
Předměty: Praktikum z biochemie, Laboratorní cvičení z analytické chemie, Laboratorní cvičení z fyzikální chemie a fyziky, Pokročilé praktikum z biochemie, Laboratorní cvičení z organické chemie, Instrumentální metody biochemie a biofyziky
Protože práce v chemické laboratoři znamená práce s chemikáliemi, u kterých je jasné, že mohou být toxické, získáte i vědomosti o různých toxických sloučeninách a jejich vlastnostech … a samozřejmě i o tom, jak předcházet otravě
Předměty: Úvod do toxikologie
I nadále si budete rozšiřovat vědomosti také v jiných vědách – po matematice to bude v 2. ročníku fyzika
Předměty: Obecná fyzika I+II
V 1. ročníku jsme vám představili možná témata bakalářských prací i vědecké skupiny katedry; v druhém a třetím ročníku pak při seminářích budete mít možnost vidět, na čem pracují vaši kolegové studenti, jaké mají pokroky v práci a současně představíte ostatním svou práci. Prezentace výsledků je dobrou příležitostí k tomu, aby si člověk udělal přehled toho co dělá a jak pokročil, současně je to příprava na obhajobu vaší práce na konci studia – čím vícekrát si vyzkoušíte prezentování „nanečisto“ při semináři, tím jednodušší to bude „naostro“ při obhajobě.
Předměty: Chemický seminář pro 2. ročník, Katedra chemie – seminář
3. ročník
V 3. ročníku vás již moc povinných předmětů nečeká – budete pracovat na svých bakalářských pracích a budete si zapisovat některé z povinně volitelných předmětů podle toho, co vás zajímá a co budete chtít studovat v budoucnu, popř. jestli budete chtít jít do praxe již po bakalářském studiu. Tomu odpovídají pouze dva odborné předměty.
Předměty: Biochemie II - pro chemiky, Chemická struktura a spektroskopie
I nadále budete moci při seminářích katedry sledovat postup práce vašich kolegů a ještě jednou si „nanečisto“ vyzkoušíte prezentování svých vlastních výsledků.
Předměty: Katedra chemie – seminář
V 3. ročníku se předpokládá, že prací v laboratoři trávíte hodně času, proto za tu práci získáte i nějaké kredity, díky čemuž si budete moci zapsat méně předmětů a na bakalářskou práci vám zbude víc času.
Předměty: Bakal. diplomová praxe I+II
Součástí studia na PřF JU je také angličtina, která je nezbytná především pokud se budete věnovat v budoucnu vědě. Budete si moci vybrat, zda budete chtít skládat zkoušku na úrovni A2 anebo B2; po složení zkoušky můžete získat i oficiální certifikát TOEIC.
Předměty: Bakalářská zkouška z angličtiny A2 anebo B2
Další informace
Povinně volitelné předměty
V současnosti nabízíme tři skupiny povinně volitelných předmětů zaměřených obecně na chemii, na bioinformatiku a modelování a na biologické vědy. Od akademického roku 2025/2026 plánujeme u těchto předmětu změnu tak, aby jedna skupina nabízela předměty pro studenty, kteří chtějí po bakalářském studiu nastoupit do praxe, druhá skupina bude nabízet předměty připravující studenty na navazující studium v programu Chemie životního prostředí a třetí skupina bude připravovat na navazující studium v programu Biochemie. Důležité! Pokud budete mít zájem, budete moci využít tyto změny i vy – na naší fakultě je možné změnit studijní plán na novější.
Skupina 1: Chemie přírodních látek , Historie chemie, Makromolekulární chemie, Základy chemických technologií
Skupina 2: Úvod do Pythonu pro AI, Objektové programování I, Statistické vyhodnocení experimentálních dat, Molekulové modelování v biologických a chemických vědách, Fyzika pevných látek, Úvod do diferenciálních rovnic
Skupina 3: Ekologie, Základy buněčné biologie, Evoluční biologie, Biostatistika, Genetika, Imunologie
Kredity
Za absolvování každého předmětu získáte určitý počet kreditů, odpovídající náročnosti. Za pouze informativní předměty, například Práce s informačními zdroji to je nula kreditů, takových předmětů je ale jen málo; v bakalářské Chemii jsou takové předměty pouze 2. Za všechny ostatní předměty to bude 1 až 5 – 6 kreditů. V každém semestru byste měli získat 30 kreditů (pokud v některém semestru získáte méně kreditů, vaše studium ještě nekončí, jen to budete muset dohnat) a celkově za studium alespoň 180 kreditů, klidně ale i více například pokud si zapíšete více povinně volitelných a volitelných předmětů, které vás budou zajímat. Povinně volitelné předměty a volitelné předměty slouží pak především k tomu, abyste se připravili na další navazující magisterské studium.
Bakalářská práce
Bakalářská práce je nezbytnou součástí vašeho studia, na naší katedře vyžadujeme pouze praktické práce – ať již v laboratoři anebo bioinformatické práce (tj práce na počítači). Takový požadavek se někdy studentům zdá být příliš přísný, má to ale své důvody – díky tomu se již v bakalářském studiu dostane do praktického kontaktu s vědou, vyzkoušíte si různé metody, což bude pro vás v budoucnu velká výhoda. Současně jsou bakalářské práce vypracovávané v některé z vědeckých skupin a jsou zaměřené na konkrétní vědecký problém, na který v této skupině pracují – nebude to tedy pouze osahání si nějaké metody, ale naučíte se současně jak postupovat při řešení vědeckého problému, jak si vyhledávat (relevantní) informace, jak napsat odborný text – a to byste se divili, kde všude schopnost napsat text, který má hlavu a patu využijete . Bakalářská práce představuje práci v laboratoři (anebo s počítačem v případě bioinformatických prací) a následně sepsání práce ve formě textu obsahujícího popis tématu, metody, které jste použili, výsledky a také porovnání vašich výsledků s tím, co již zjistil někdo jiný.
Svou bakalářskou práci byste měli představit na semináři katedry minimálně dvakrát v průběhu studia – obvykle v 2. ročníku, kde svým kolegům představíte téma a plán práce a poté ve 3. ročníku, kdy již budete sepisovat bakalářskou práci a připravovat se na její obhajobu, to bude spíše zkouška před samotnou obhajobou.
Státní závěrečná zkouška a obhajoba
Státní závěrečná zkouška má čtyři části – tři zkoušky z tematických okruhů (například biochemie, anorganická chemie …) a z obhajoby. Pro každý tematický okruh jsou k dispozici sady otázek, z kterých si budete jednu až dvě tahat a které musíte zodpovědět.
Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
Branišovská 1645/31a, 370 05 České Budějovice Tel. 387 776 201 | This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.
