Skip to main content

PRF

Grants

Department of Physics

  • Ongoing

     

     

    2024-2028 "PHOTOMACHINES - Reorganizace fotosyntetických buněk za účelem vysoké produkce terapeutických peptidů“, OP JAK Špičkový výzkum CZ.02.01.01/00/22_008/0004624, Tomáš Polívka, spoluřešitel
    2024-2028 HORIZON-MSCA-2022-SE-01-01 — MSCA Staff Exchanges 2022, DynaSun -  Dynamics of the solar corona in the era of data intensive observations, Petr Jelínek, spoluřešitel
    2024-2026 "Ultrarychlé zhášení ve fotosyntéze", standardní projekt GAČR 24-11344S, Tomáš Polívka, řešitel
    2023-2026 "Compact mems pirani manometer for robust technological applications", TAČR TREND FW10010337, Vítězslav Straňák, spoluřešitel
    2023-2026 "Sensing for the 21st century", TAČR NCK MATCA TN02000069/001N, Vítězslav Straňák, spoluřešitel
    2023-2026 "Diagnostics of Chemicals in Water", TAČR NCK MATCA TN02000069/007, Vítězslav Straňák, spoluřešitel
    2022-2024 Počítačové modelování nelineárních optických signálů na rozhraních", standardní projekt GAČR 22-02972S, Milan Předota, řešitel
    2021-2024 "Kapacitní deionizace: Porozumění pomocí molekulárního modelování", standardní projekt GA ČR 21-27338S, Milan Předota, řešitel
    2021-2024 "Opticky polopropustné nanostruktury oxidu titanu na površích s komplexní geometrií pro zvýšení fotokonverze a citlivosti snímačů", mezinárodní Lead Agency projekt GAČR 21-05030K, Vítězslav Straňák, spoluřešitel

     

  • Finished

     

    2021-2023 "Sub-THz pásmo: nový přístup ke studiu původu slunečních a hvězdných erupcí pomocí pozorování a numerických simulací", mezinárodní bilaterální projekt GAČR 21-16508J
    2021-2023 "Plazmový surfatron s definovaným tokem iontů pro čištění citlivých povrchů s nízkou energetickou zátěží" projekt OP PIK CZ.01.1.02/0.0/0.0/20_321/0023906
    2019-2023 "Vztah mezi strukturou a funkcí karotenoidů: Nové cesty k řešení nezodpovězených otázek", GAČR EXPRO 19-28323X
    2021-2022 "Bezdrátová sonda pro monitoring kůrovce", projekt TAČR GAMA-2 TP01876221
    2021-2022 "Laserový nano -tisk z plazmonických nanočástic připravených pomocí plynně agregačního zdroje", projekt TAČR GAMA-2 TP01010019
    2020-2022 "Přenos elektrického náboje na nabitých heterogenních rozhraních s redoxními metaloproteiny", juniorský projekt GAČR 20-02067Y
    2020-2022 "Zařízení pro přenos MIDI signálů s expanzní konstrukcí", projekt TAČR GAMA-2 TP01010019
    2020-2021 "Antivirové povrchy pro zdravotnický materiál", projekt TAČR GAMA-2 TP01010019 COV-01
    2019-2022 "Výzkum a vývoj nových produktů - Suchá pístová vývěva a chemicky odolná suchá pístová vývěva", projekt OP PIK CZ.01.1.02/0.0/0.0/17_176 /0015637
    (2019)-2021 "Plasma Coating 2" – Třetí etapa aplikovaného výzkumu depozičního procesu ochranných tribologických vrstev na substráty s komplexním tvarem. TAČR NCK MATCA TN10000038/11, https://matca.cz
    2019-2021 "Biosenzory na optickém vlákně pro detekci spirochét Lymské boreliózy", projekt MŠMT Mobility 8JPL19012
    2019-2021 "Nanostruktury pro LSPR senzory na optickém vlákně", standardní projekt GAČR 19-20168S
    2019-2020 "Vývoj automatizovaného zařízení pro manipulaci s elektronickými součástkami", projekt JVTP 91-0071, Jihočeský vědeckotechnický park
    2018-2020 "Ultrarychlá časová spektroskopie jako nástroj pro studium vztahu mezi strukturou a funkcí karotenoproteinů u sinic", standardní projekt GAČR 18-21631S
    2018-2019 "Waves in expanding magnetic flux tubes embedded in the solar atmosphere", Mobility MŠMT ČR, projekt 8J18AT031, spolupráce JU a Karl-Franzens-Universität, Graz, Rakousko
    2018-2019 “Optimalizace logistických procesů zavedením elektronické výměny dat”, projekt JVTP 91-0064, Jihočeský vědeckotechnický park
    2017-2021 “Molekulární simulace procesů na rozhraní pevná látka - kapalina”, projekt LTAUSA17163, INTER-EXCELLENCE, podprogram INTER-ACTION, spolupráce s Oak Ridge National Laboratory (USA)
    2017-2019 “Ultra-Sensitive Opto-Electrochemical Detection of Liquid Explosives”, projekt NATO, SPS G5147
    2017-2019 "Konstrukce boxu pro měření dýchacího ústrojí drobných hlodavců", projekt KTT č. 48: Vybudování znalostního a technologického transferu v příhraničním prostoru Jihočeského kraje a Dolního Bavorska/ Aufbau des Wissens- und Technologietransfers im Grenzraum Südböhmen/Niederbayern, EUS
    2017-2019 "Snímání průtoku vzduchu", projekt KTT č. 49: Vybudování znalostního a technologického transferu v příhraničním prostoru Jihočeského kraje a Dolního Bavorska/ Aufbau des Wissens- und Technologietransfers im Grenzraum Südböhmen/Niederbayern, EUS
    2017-2019 “Vývoj a výzkum součástí elektronového mikroskopu pro čištění tubusu, vytvoření vakua a rozvody inertních plynů v tubusu", projekt OP PIK, CZ.01.1.02/0.0/0.0/15_019/0004732
    2017-2019 “Molekulární popis jevů v elektrické dvojvrstvě - predikce a interpretace experimentálních dat počítačovými simulacemi”, standardní projekt GAČR 17-10734S
    2017-2018 “Dálková regulace elektronických přístrojů s využitím servomotoru”, projekt TAČR GAMA TG03010027
    2017-2018 "Demonstrační zařízení pro snímání a regulaci neelektrických fyzikálních veličin", projekt JVTP, FIS 011.400.222
    2016-2018 “Výzkum růstu tenkých nanostrukturovaných vrstev připravovaných pomocí plazmatu”, standardní projekt GAČR 16-14024S
    2016-2018 “Magnetoakustické vlny v diagnostice plazmatu ve sluneční koróně: nový pohled prostřednictvím pokročilých numerických simulací”, standardní projekt GAČR 16-13277S
    2016-2018 “Světlosběrné a fotoprotektivní funkce karotenoidů - nové přístupy pomocí multipulsní femtosekundové spektroskopie”, standardní projekt GAČR 16-10417S
    2016-2017 Smluvní výzkum pro firmu BOSCH
    2016-2017 “Plasma-assisted deposition of thin antimicrobial films” bilaterální projekt Mobility MŠMT ČR - DAAD SRN, spolupráce s Department of Physics, University of Greifswald
    2016-2017 “Zpracování soustavy kompaktních elementů do výukového programu fyziky”, projekt JVTP,  FIS 011.600.490.
    2015-2017 “Studium stavů přenosu náboje u karotenoidů pomocí multidimenzionální Starkovy spektroskopie”, MŠMT Kontakt II, LH15126, spolupráce s Department of Physics, University of Michigan, USA
    2013-2016 “Počítačové modelování interakcí organické hmoty a biomolekul s minerálními povrchy”, standardní projekt GAČR 13-08651S
    2012-2018 “Centrum fotosyntetického výzkumu”, projekt na podporu excelence v základním výzkumu GBP501/12/G055
    2011-2015 “Přenos excitační energie v pigment-proteinových komplexech mikroorganismů”, standardní projekt GAČR GAP205/11/1164
    2011-2013 “Pokročilý experimentální výzkum výbojových zdrojů plazmatu použitých pro přípravu nanostrukturovaných tenkých vrstev”, standardní projekt GAČR, GAP205/11/0386
    2010-2012 Energetické procesy ve sluneční atmosféře: vztahy mezi simulacemi a pozorováními”, standardní projekt GAČR, GAP209/10/1680
    2010-2012 “Fotofyzika a fotochemie samoorganizovaných nanostruktur”, standardní projekt GAČR, GAP208/10/1678
    2009-2012 Excitované stavy karbonylových karotenoidů a jejich role ve fotochemických reakcích, MŠMT - Kontakt, ME09037, spolupráce s Department of Chemistry, University of Connecticut
    2009-2012 “Excitované stavy karotenoidových agregátů”, standardní projekt GAČR, GA202/09/1330
    2009-2012 “Studium struktury a dynamiky minerálních povrchů a biomembrán a jejich interakcí s organickými a anorganickými ligandy pomocí počítačového modelování”, MŠMT - Kontakt, ME 09062, spolupráce s Departmenf of Chemical and Biomolecular Engineering, Vanderbilt University, Nashville
    2008-2011 Počítačové modelování strukturních, dynamických a transportních vlastností tekutin v nanorozměrech”, standardní projekt GAČR 203/08/0094

     

Read more …Grants

  • Hits: 232

Achivements

Katedra molekulární biologie a genetiky

Jak fungují proteinové „stroje“ v buněčných elektrárnách eukaryotických organismů

Jak přesně fungují proteinové „stroje“ v buněčných elektrárnách eukaryotických organismů popisuje nová studie parazitologů z Jihočeské Univerzity, která byla publikována na začátku listopadu v prestižním vědeckém časopise Current Biology. Editoři časopisu vybrali studii jako stěžejní článek aktuálního vydání a zpřístupnili ho bezplatně jako tzv. open access  on-line.

Mitochondrie, důležité a starobylé součásti eukaryotických buněk (mezi eukaryota patříme my, lidé, houby a rostliny), fungují jako buněčné elektrárny, které vyrábí energii pro celou buňku. Tyto elektrárny mají složitou stavbu, kterou rámují dvě membrány - vnější a vnitřní. Mezi oběma membránami se nachází mezimembránový prostor a zcela uvnitř mitochondrie, uzavřený vnitřní membránou je tzv. matrix, vnitřní prostor.

Vnitřní membrána má poměrně komplikovanou strukturu. Je zvlněna do záhybů, tzv. krist, které tvarem připomínají prsty natahující se do matrixu. Kristy jsou sidla proteinových komplexů; můžeme si je představit jako molekulární stroje, ve kterých pracuje množství nejrůznějších bílkovin, z nichž každá představuje nepostradatelnou součástku pro správné fungování životně důležitých buněčných procesů, jako je dýchání a vyrábění energie.

Vzhledem k tomu, že mitochondrie i jejich kristy jsou evolučně starobylé části buněk, vyskytují se v široké škále nejrůznějších eukaryot. Máme je my, lidé, houby a rostliny, ale také naši vzdálenější příbuzní, jednobuněčná eukaryota, tzv. prvoci. Do této různorodé a fascinující skupiny prvoků patří i původce spavé nemoci, parazit Trypanozoma spavičná (Trypanosoma brucei). A právě tohoto parazita si vybral tým molekulárních biologů z Přírodovědecké fakulty JU a Parazitologického ústavu BC AV ČR pod vedením Hassana Hashimiho jako modelový organismus pro výzkum funkcí bílkovinných komplexů vnitřní mitochondriální membrány.

Vědci se rozhodli zodpovědět následující otázky: jaké části výše zmiňovaných molekulárních strojů jsou společné napříč celou říší eukaryot, a jaké části se naopak odlišují a jsou specifické jen pro určité druhy eukaryot? Zaměřili se na bílkovinný komplex MICOS (mitochondrial contact site and cristae organization system). U kvasinek (blízkého příbuzného hub) a člověka (nadále je budeme společně nazývat "kvověk") je známé, že tento proteinový komplex dává kristám tvar, vytváří místa, kde vnitřní a vnější membrána přicházejí do těsného kontaktu a také kde se připojují kristy ke zbytku vnitřní membrány. Pokud se tento MICOS „stroj“ rozbije, kristy se oddělí od vnitřní membrány a plují v matrixu.

V trypanozomě byl původně nalezen pouze jeden gen pro jedinou bílkovinu MICOSového komplexu.  Díky této informaci dokázali vědci u trypanozomy izolovat celý bílkovinný komplex MICOS, stejným způsobem jako, když vytáhnete viditelnou úchytku šuplíku, abyste zjistili, co je uvnitř,  a podívat se na to, v čem je podobný a v čem naopak rozdílný ve srovnání s MICOSem u kvověka. Badatelé zjistili, že kontaktní místo vnitřní a vnější membrány i připojení krist k vnitřní membráně jsou stejnéjak u trypanosomy, tak i u kvověka. Vzhledem k tomu, že tyto dva typy organismů jsou si příbuzensky tak vzdálené, jak jen si lze představit, lze s jistotou tvrdit, že tato role MICOSu je shodná a zásadní napříč všemi eukaryoty.

S pomocí kolegů z Laboratoře elektronové mikroskopie na Biologickém centru mohl tým vědců rovněž přímo pozorovat komplex MICOS na mitochondriálních kristách a sledovat i to, jaké důsledky má  genetické odstranění MICOSu na tvar krist.

Překvapující byly rozdíly, které vědci objevili. Kromě již zmiňované osamělé bílkoviny MICOSového komplexu se ostatní proteiny velmi liší od těch, které najdeme u kvověka. Navíc se ukazuje, že jeden z proteinů má úplně odlišnou roli než jakýkoli známý protein u kvověčího MICOSu, a to, že pomáhá zachytit proteiny, které patří do mezimembránového prostoru.  Mezi proteiny v mezimembránovém prostoru jsou totiž malé proteiny, které jsou součástí bílkovinných komplexů, respiračního řetězu nacházejícího se v kristách.

Tato studie prokazuje, že bílkovinný komplex MICOS u trypanozomy nejen pomáhá dát kristám tvar, ale také umístit proteinové komplexy v té části mitochondrií, která je zodpovědná za buněčné dýchání. Nezodpovězenou otázkou zatím zůstává, zda je MICOS u trypanozomy výjimkou, protože tuto funkci má, anebo zda je výjimkou MICOS u kvověka, když takový protein vůbec nemá.

Iosif Kaurov, Marie Vancová, Bernd Schimanski, Lawrence Rudy Cadena, Jiří Heller, Tomáš Bílý, David Potěšil, Claudia Eichenberger, Hannah Bruce, Silke Oeljeklaus, Bettina Warscheid, Zbyněk Zdráhal, André Schneider, Julius Lukeš, Hassan Hashimi

Read more …Achivements

  • Hits: 80

Doctoral studies

Katedra molekulární biologie a genetiky

V našem programu máme více než 50 PhD studentů, z nichž polovina je zahraničních. Studenti se podílejí na špičkových vědeckých projektech, jejich práce se nedávno objevily například v časopisech eLife nebo Current Biology (podívej se na Research Achievements). Studenti využívají skvělého zázemí fakulty a několika ústavů akademie věd, mají přístup k jednomu z nejlépe vybavených středisek elektronové mikroskopie v ČR, konfokálním mikroskopům, metabolomických a proteomických center (fakulta například disponuje nejmodernějším přístrojem „Bruker Daltonics timsTOF Pro“ pro proteomiku ve střední Evropě). Studenti si mohou vybrat z různých kurzů a každý týden se účastní katedrového semináře, kde prezentují zvaní přednášející. Jednou ročně pořádáme pro PhD studenty katedrový retreat, který je skvělou příležitostí prezentovat svou práci a potkat se na celý víkend ve velmi neformální atmosféře. Každý rok také pořádáme pro studenty soutěž o nejlepší vědecký obrázek.

Aktuální informace pro zájemce o studium:

Podávání příhlášek do 22. 6. 2020, příjímací řízení budou probíhat v druhé polovině července.

Informace o programu:

Garant oboru: doc. Mgr. Tomáš Doležal, Ph.D.

  • Složení oborové rady

    Obor Molekulární a buněčná biologie a genetika se standardní dobou studia 4 roky

    Rozšíření akreditace: Biologické centrum AV ČR, v.v.i. České Budějovice
    Rozšíření akreditace: Mikrobiologický ústav AV ČR, v.v.i.

    Předseda oborové rady: Doc. Mgr. Tomáš Doležal, Ph.D. (PřF JU)
    telefon: 38 777 2229 e‐mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.

    Zástupce: Prof. Ing. Miroslav Oborník, Ph.D. (PřF JU, BC AV ČR ‐ PaÚ Č. Budějovice)

    Členové oborové rady:
    MVDr. Martin Anger, Ph.D. (CEITEC Brno)
    doc. Mgr. Marek Eliáš, Ph.D. (PřF OU Ostrava)
    Prof. RNDr. Libor Grubhoffer, CSc. (PřF JU, BC AV ČR ‐ PaÚ Č. Budějovice)
    Prof. RNDr. Marek Jindra, CSc. (BC AV ČR – EntÚ Č.Budějovice)
    Prof. RNDr. Julius Lukeš, CSc. (BC AV ČR ‐ PaÚ Č. Budějovice, PřF JU)
    RNDr. Jiří Macas, Ph.D. (BC AV ČR – ÚMBR České Budějovice)
    Prof. RNDr. Jiří Masojídek, CSc. (MBÚ AV ČR Třeboň)
    Prof. RNDr. František Marec, CSc. (BC AV ČR ‐ EntÚ Č. Budějovice)
    Prof. RNDr. Ivo Šauman, CSc. (PřF JU, BC AV ČR – EntÚ Č.Budějovice)
    RNDr. Martin Tichý, Ph.D. ( MBÚ AV ČR Třeboň)
    RNDr. Ladislav Anděra, CSc. (ÚMG AV ČR Praha)
    Prof. RNDr. Jan Tachezy, CSc. (PřF UK Praha)

  • Práva a povinnosti doktorandů

    Základní práva a povinnosti studentů studujících v doktorských studijních programech na PřF JU

    Práva a povinnosti studentů vyplývají z novely zákona č. 111/1998 o vysokých školách, ze Studijního a zkušebního řádu Jihočeské univerzity v Č. Budějovicích, Opatření děkana o organizaci studia v doktorksých studijních programech na PřF JU a o stipendiu studentů v doktorských studijních programech. Tyto předpisy obsahují plné znění všech práv a povinností studentů.

    1. Po obdržení oznámení o přijetí ke studiu se student ve stanoveném termínu dostaví na studijní oddělení, obdrží “Výkaz o studiu na vysoké škole” (index). Zároveň si povinně zřídí fakultní e-mailovou adresu (pokud se rozhodne ji nepoužívat, je jeho povinností a zájmem přesměrovat si došlé zprávy na jinou používanou adresu) a Identifikační kartu studenta JU. Návod pro první přihlášení najdete na adrese: https://www.prf.jcu.cz/struktura-prf/it-sluzby.html

    2. Studentům v prezenční formě studia náleží po standardní dobu studia stipendium. Jeho výši stanoví Opatření děkana.

    3. Do 2 měsíců od zahájení studia předloží student oborové radě prostřednictvím studijního oddělení „Plán doktorského studia“ (1 výtisk + elektronicky), který vypracoval s navrženým školitelem na základě závěrů přijímacího řízení. Plán doktorského studia tvoří povinně a) vyplněný formulář, který je k dispozici na studijním oddělení nebo na www PřF, b) rozbor zadání doktorské disertace; obsah, formu a rozsah stanoví oborová rada.

    4. Po celou dobu studia, tj. do obhájení disertační práce, musí být student veden ve stavu studentů – tato evidence se obnovuje zápisem před začátkem každého semestru, kdy si student zapíše předmět “Doktorandská praxe” a případně další, studijním plánem stanovené předměty včetně jazykových kurzů (zapisuje si je postupně po semestrech, kdy bude skládat zápočet či zkoušku). Na konci prvního roku studia a na konci každého akademického roku musí student předložit “Výkaz o studiu” na studijní oddělení ke kontrole.

    5. Samostatnou práci studenta potvrzuje školitel každý semestr udělením zápočtu předmětu “Doktorandská praxe”.

    6. Nejpozději do konce prvního roku studia student vypracuje a předloží kritickou literární rešerši problematiky disertační práce a na semináři prezentuje metodiku a záměry disertace. Školitelem schválený výtisk rešerše předá a v el. podobě zašle na studijní oddělení; rešerši posoudí oborová rada. Zápočet za splnění předmětů Literární rešerše a Doktorandský seminář uděluje předseda Oborové rady.

    7. Student každoročně prezentuje pokroky a výsledky své práce na semináři schváleném oborovou radou. Zápočet za splnění předmětu Doktorandský seminář uděluje předseda Oborové rady.

    8. Každoročně student odevzdá na předepsaném formuláři „Výroční zprávu o průběhu studia“, ve které uvede plnění svých povinností a stručně popíše pokroky ve své vědecké práci (uvedou se mj. absolvované předměty, plnění pedagogických povinností, prezentace výsledků na konferencích, publikování dílčích výsledků disertační práce, zahraniční stáže a pod.). Výroční zprávu v elektronické podobě plus školitelem schválenou zprávu s podpisy garantů kurzů, ve kterých student plnil pedagogickou praxi, předloží student vždy k 31.10. prostřednictvím studijního oddělení oborové radě.

    9. Do konce standardní doby studia musí student prokázat (např. formou zápisů ve výročních zprávách, jiným písemným potvrzením) a) pedagogickou činnost v rozsahu 42 hodin za dobu studia; b) úspěšné absolvování stanovených předmětů a angličtiny, c) prezentaci svých výsledků na mezinárodní konferenci, do konce studia dále publikaci alespoň části výsledků své doktorské práce (v časopise s IF nad 0,5) a absolvování zahraniční stáže (možno absolvovat jako více pobytů o minimální délce jednotlivého 14 dní, celková doporučená délka jsou 3 měsíce). Povinnost pedagogické činnosti neplatí pro studenty v kombinované formě studia.

    10. Standardní doba studia v doktorském programu je 4 roky. Před jejím koncem se musí student přihlásit ke státní doktorské zkoušce. Disertační práci a ostatní náležitosti k obhajobě práce musí student odevzdat tak, aby nepřekročil maximální délku studia, která je pro prezenční studium 5 a pro kombinované 6 let. Do doby studia se nezapočítává přerušení studia, jež může celkově činit až 2 roky, a mateřská/rodičovská dovolená.

    11. Studenti jsou povinni důsledně dbát na etiku vědecké práce včetně publikování získaných výsledků. Na všech publikacích vzniklých v souvislosti s řešením doktorské disertační práce i na případných jiných výstupech vždy uvádějí jako své pracoviště Přírodovědeckou fakultu JU.

    Dotazy a žádosti předkládejte na studijní oddělení (referentka paní Ivana Voldřichová, Bc. Petra Korcová, tel. linka 2262), případně proděkanovi (doc. Marie Šmilauerová, tel. linka 2386, e-mail: This email address is being protected from spambots. You need JavaScript enabled to view it.; pracovna 217 v budově katedry botaniky, Na zlaté stoce 1A).

Read more …Doctoral studies

  • Hits: 19

Dendrochronologie

  • Seznam štítků: PŘF

Skutečným přírodním archivem jsou pravidelné roční přírůsty rostlin. Především letokruhy dřevin poskytují konkrétní informace, protože změny prostředí se vždy odráží v jejich růstových reakcích. Věda, která se zabývá letokruhy se nazývá dendrochronologie a slouží jako dostupný zdroje informací o prostředí, ve kterém dřevina roste.

Dendrochronologie respektive dendroekologie je mezioborová metoda využívaná v mnohých vědních odvětvích, např. v lesnictví, ekologii, klimatologii, archeologii aj.

Dendroekologie

Dendroekologie se zabývá se vlivem faktorů prostředí na tvorbu letokruhů. Na základě letokruhových řad je možné některé z těchto faktorů zpětně identifikovat a objasnit tak některé ekologické aspekty v historii stanoviště. Pro dendrochronologii jsou vhodné dřeviny s roční periodickou činností kambia, tzn. téměř všechny dřeviny mírného pásma, některé byliny a dřeviny z jiných vegetačních zón jevící obdobnou pravidelnou periodicitu růstu. Dendroekologie umožňuje poznání dlouhodobé dynamiky lesních ekosystémů, detekovat geomorfologické a hydrologické změny stanoviště (svahové pohyby, laviny, záplavy apod.). Dendrochronologie je také často používána v klimatologických studiích, je jednou z metod napomáhajících objasnit změny klimatu v minulosti a jeho regionálních odlišností.

Dendrochronologie

V úzkém slova smyslu je dendrochronologie chápána jako metoda datování dřevěných vzorků z historických, archeologických a fosilních nálezů. Datování je založeno na porovnávání získaných letokruhových řad ze vzorků se standardními chronologiemi pro jednotlivé druhy dřevin. Křížové datování nám umožňuje konkrétní určení kalendářního roku, ve kterých jednotlivé letokruhy přirostly. Jedná se o jednu z nejpřesnějších způsobů datování dřevěných objektů. Pro úspěšné datování vzorku je nutná dostatečná délka letokruhové řady (alespoň 40 letokruhů) a vhodná regionální standardní chronologie. Rok smýcení stromu lze určit v případě, že na vzorku je zachován podkorní letokruh.

Vybavení dendrochronologické laboratoře

Laboratoř je vybavena měřícím přístrojem TimeTable rakouské výroby, který je propojen s počítačem pomocí odečítacího modulu ParSer v1.3 a Stereomikroskopem Olympus SZ51. Pro měření a datování vzorků je využíván software PAST32 a PAST4.

Zaměření dendrochronologické laboratoře

Dendrochronologické pracoviště slouží zejména k výuce na přírodovědecké a filozofické fakultě Jihočeské univerzity a k samostatnému výzkumu studentu obvykle v rámci Laboratoře archeobotaniky a paleoekologie. Primárním účelem je zajištění dendrochronologického datování dřevených konstrukcí a objektu v rámci zpracovávaných projektu Laboratoře archeobotaniky a paleoekologie. Dlouhodobé se pracoviště zabývá především problematikou datování objektu v jižních Cechách a sestavením regionálních chronologií pro jednotlivé podoblasti zejména v závislosti na nadmořské výšce, a také změnou používaných druhu dřevin pro konstrukce v minulosti. Dendroklimatologickým analýzám růstových reakcí smrku na Šumavě a problematice lesních mokřadů.

  • Hits: 2320

Analýza škrobů

  • Seznam štítků: PŘF

Analýza škrobových zrn je vhodným zdrojem dat pro archeologii. Škrobová analýza se začala používat pro účely archeologického bádání v posledních třech dekádách. Škrobová zrna patří do skupiny rostlinných mikrozbytků spolu s fytolity, pylem, sporami aj. Zkoumáním těchto rostlinných reziduí se odhalují změny v životním prostředí a změny přirozeně vzniklé přírodními procesy i antropogenními aktivitami. Analýza škrobových zrn je spojena s odpověďmi na otázky ohledně užívání i opracovávání rostlin a složení rostlinné složky lidské potravy. Tato technika je také vhodná pro zkoumání funkce nástrojů, domestikaci rostlin a vegetační historii. Poškozená zrna škrobu mohou však bránit použití této konkrétní techniky. Výsledky vzešlé díky škrobové analýze je vhodné kombinovat s výsledky poskytovanými jinými metodami, jako jsou palynologie, fytolitová analýza nebo rozbory rostlinných makrozbytků.

 

starch

Škrobová zrna z archeologických artefaktů

Škrob je zásobní polysacharid u většiny fotosynteticky aktivních rostlin. Výjimka jsou rostliny, které tvoří místo škrobu zásobní polysacharid inulin. Škrob je zdroj glukózy pro rostliny uzpůsobený k dlouhodobému uchování. Je směsí dvou homopolysacharidů (amylózy a amylopektinu).

Škrob se tvoří v zelených částech rostliny ve specializovaných organelách, chloroplastech. V chloroplastech vznikají malá škrobová zrna o průměru 1 µm. Škrobová zrna jsou spotřebována nebo transportována. Škrob se dále ukládá ve specializovaných organelách buněk, v amyloplastech. Největší množství škrobu je uloženo v zásobních orgánech ve specializovaných buňkách semen, kořenů a hlíz. Škrob je v amyloplastech uskladněn ve formě škrobových zrn, která jsou druhově specifická. Liší se tvarem, velikostí a poměrem polysacharidů. Tyto vlastnosti škrobových zrn jsou dány z velké části geneticky, ale jsou také ovlivňovány vnějšími vlivy.

Postup analýzy

Škrob je možno identifikovat použitím optické mikroskopie v polarizovaném světle, kdy má škrobové zrno specifický optický projev (extinction cross). Na LAPE jsou k tomuto účelu používána dvě mikroskopovací pracoviště. Optický mikroskop Nikon Eclipse a optický mikroskop Leica MD 2500. Obě pracoviště jsou vybavena digitální kamerou pro záznam a počítačem s ovládacím a analytickým softwarem. Pro přesné morfologické rozlišení škrobových zrn je třeba použít vzorky ze srovnávací sbírky. Lze použít rovněž statistický postup identifikace škrobů z archeologických vzorků.

  • Hits: 1551

Stay in touch
social media

© 2024 University of South Bohemia
Cookies

1

0